[发明专利]一种鉴别高原鼢鼠的试剂盒及方法

说明书

本发明提供了一种鉴别高原鼢鼠的试剂盒，它包括检测待检物种的12S rRNA基因中如下任意一个或两个SNP位点的试剂：SEQ ID NO:3所示保守motif序列的第1位、第2位。本发明提供了一种简便、准确鉴定高原鼢鼠物种的试剂盒以及鉴定高原鼢鼠的方法，解决了通过形态进行鼢鼠物种鉴定的难题，在鼢鼠的物种鉴别中具有优异的应用前景。

技术领域

本发明属于鉴定技术领域，具体涉及一种鉴别高原鼢鼠的试剂盒及方法。

背景技术

鼢鼠是鼢鼠亚科(Myospalacinae)动物的统称，主要分布于中国和西伯利亚南部地区。现存鼢鼠包括凸颅鼢鼠属(Eospalax)和平颅鼢鼠属(Myspalax)，我国几乎分布了所有现生鼢鼠物种。平颅鼢鼠包括草原鼢鼠(M.aspalax)和东北鼢鼠(M.psilurus)等2-3个物种，凸颅鼢鼠属只分布在我国，包括中华鼢鼠(E.fontanieri)、斯氏鼢鼠(E.smithi)、罗氏鼢鼠(E.rothschildi)、高原鼢鼠(E.baileyi)、甘肃鼢鼠(E.cansus)和秦岭鼢鼠(E.rufescens)等6个物种。鼢鼠几乎终生都生活在密闭的地下洞道系统中，独特的地下生活方式使得其在觅食、婚配、繁殖等多方面具有特殊性，引起了科学家的广泛兴趣。

识别鉴定生物种类是认识和保护生物多样性的基础，每种生物只有能够被准确识别后，才能开展更多领域的研究。但是由于不同鼢鼠生活环境相似而形态趋同，种间区分难度大，未经专业训练通过形态进行物种准确鉴定非常困难。

因此，研究一种能够快速、准确进行高原鼢鼠物种鉴定的方法与试剂，具有非常重要的意义。

发明内容

本发明的目的在于提供一种能够简便、准确鉴定高原鼢鼠物种的试剂盒和方法，解决通过形态进行鼢鼠物种鉴定的难题。

本发明提供了一种鉴别高原鼢鼠的试剂盒，它包括检测待检物种的12SrRNA基因中的如下2个SNP位点中任意一个或两个的试剂：

SEQ ID NO:3所示保守motif序列的第1位、第2位。

进一步地，上述试剂是同时检测所述2个SNP位点的试剂；

或，所述SNP位点的碱基如下：

SEQ ID NO:3所示保守motif序列的第1位碱基为T、第2位碱基为G。

经过发明人研究发现，本申请前述2个SNP位点通常是同时存在，即当SEQ ID NO:3所示保守motif序列的第1位碱基为T时，SEQ ID NO:3所示保守motif序列的第2位碱基为G。进一步的实验还发现，只有高原鼢鼠的基因组具有前述2个SNP位点，因而通过检测前述2个SNP中的任意一个或者两个位点，即可鉴别待检物种是否为高原鼢鼠。

更进一步地，上述试剂为：测序用试剂、KASP方法用试剂或限制性片段长度多态性方法用试剂。

进一步地，上述试剂盒还包括扩增12S rRNA基因保守motif序列的试剂；所述保守motif序列为SEQ ID NO:3所示的序列。

更进一步地，上述扩增12S rRNA基因保守motif序列的试剂包括SEQ ID NO:1～2所示的引物对。

本发明还提供了扩增12S rRNA基因保守motif序列的试剂在鉴别高原鼢鼠的试剂盒中的用途，所述保守motif序列是SEQ ID NO:3所示的任意一个或两个序列；

优选地，所述试剂包括SEQ ID NO:1～2所示的引物对。

本发明还提供了一种鉴别高原鼢鼠的方法，包括如下步骤：

(1)提取待检鼢鼠样本的基因组总DNA；