[发明专利]免疫原性细胞死亡相关基因在头颈鳞癌生存预后及放疗应答性中的应用

权利要求书

1.一种用于头颈鳞癌生存预后评估和/或放疗应答性的标志物，其特征在于，所述标志物包括选自下列基因中的任意一种或多种：

ATF6、BECN1、CSNK2A2、CTTN、FBXO7、NLRP1、PLAA、RFPL1、RUBCNL、SPTLC1、SRPX、STK24、TP53INP1、TRIML2和VPS37C。

2.如权利要求1所述的标志物，其特征在于，所述标志物为ATF6、BECN1、CSNK2A2、CTTN、FBXO7、NLRP1、PLAA、RFPL1、RUBCNL、SPTLC1、SRPX、STK24、TP53INP1、TRIML2和VPS37C组成的组；

优选的，所述预后评估具体包括对头颈鳞癌患者总生存期的评估。

3.检测权利要求1或2所述标志物的表达水平的试剂在制备产品中的应用，所述产品用于头颈鳞癌生存预后评估和/或放疗应答性。

4.一种产品，其特征在于，所述产品包含检测上述用于头颈鳞癌生存预后评估和/或放疗应答性的标志物的物质，所述产品用于头颈鳞癌生存预后评估和/或放疗应答性。

5.如权利要求4所述产品，其特征在于，所述产品包括检测待测样本中所述免疫原性细胞死亡相关基因表达水平的引物、探针、芯片、核酸膜条、制剂或试剂盒；

所述待测样本为人源样本，优选的，所述待测样本包括受试者头颈鳞癌组织和/或细胞。

6.如权利要求4所述产品，其特征在于，所述产品为试剂盒。

7.一种用于头颈鳞癌生存预后评估和/或放疗应答性的系统，其特征在于，所述系统包括：

i)分析模块，所述分析模块包含：用于确定受试者的待测样品中选自免疫原性细胞死亡相关基因表达水平的检测物质，以及；

ii)评估模块，所述评估模块包含：根据i)中确定的所述凋亡相关基因表达水平对所述受试者进行生存预后评估和/或放疗应答性判断。

8.如权利要求7所述的系统，其特征在于，

所述步骤i)分析模块中，所述免疫原性细胞死亡相关基因包括选自下列基因中的任意一种或多种：

ATF6、BECN1、CSNK2A2、CTTN、FBXO7、NLRP1、PLAA、RFPL1、RUBCNL、SPTLC1、SRPX、STK24、TP53INP1、TRIML2和VPS37C；

优选的，所述免疫原性细胞死亡相关基因为ATF6、BECN1、CSNK2A2、CTTN、FBXO7、NLRP1、PLAA、RFPL1、RUBCNL、SPTLC1、SRPX、STK24、TP53INP1、TRIML2和VPS37C组成的组；

所述步骤ii)评估模块具体评估流程包括：根据i)中确定的所述免疫原性细胞死亡相关基因表达水平基于免疫原性细胞死亡相关基因预测指数ICDRGPI进行生存预后评估和/或放疗应答性判断；

其中，所述ICDRGPI，其计算公式＝(0.34*ATF6基因表达量)+(0.70*BECN1基因表达量)+(0.32*CSNK2A2基因表达量)+(0.06*CTTN基因表达量)+(0.64*FBXO7基因表达量)-(0.27*NLRP1基因表达量)+(0.26*PLAA基因表达量)-(0.15*RFPL1基因表达量)-(0.11*RUBCNL基因表达量)+(0.27*SPTLC1基因表达量)+(0.09*SRPX基因表达量)+(0.16*STK24基因表达量)–(0.05*TP53INP1基因表达量)+(0.10*TRIML2基因表达量)–(0.38*VPS37C基因表达量)。

9.如权利要求8所述的系统，其特征在于，受试者ICDRGPI指数高于阈值时为高表达，则指示受试者预后较差(总生存期较短)，对放疗敏感；受试者ICDRGPI指数低于阈值时为低表达，则指示受试者预后较好(总生存期较长)，对放疗不敏感。

10.一种头颈鳞癌患者预后风险评估和/或放疗应答性的方法，其特征在于，所述方法包括使用权利要求1或2所述标志物和/或权利要求7-9任一项所述系统进行评估；

优选的，所述预后风险评估包括对受试者的总生存期进行预测评估。