[发明专利]药物与细胞系反应预测方法及相关装置在审
申请号: | 202110995303.1 | 申请日: | 2021-08-27 |
公开(公告)号: | CN113707217A | 公开(公告)日: | 2021-11-26 |
发明(设计)人: | 李泽超;张捷 | 申请(专利权)人: | 上海商汤智能科技有限公司 |
主分类号: | G16B20/00 | 分类号: | G16B20/00;G06Q10/04;G06K9/62 |
代理公司: | 深圳市威世博知识产权代理事务所(普通合伙) 44280 | 代理人: | 何倚雯 |
地址: | 200233 上海市徐*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 药物 细胞系 反应 预测 方法 相关 装置 | ||
1.一种药物与细胞系反应的预测方法,其特征在于,所述方法包括:
获取细胞系基因数据及药物分子数据;
对所述细胞系基因数据及所述药物分子数据进行第一特征提取处理以得到第一特征序列;
对所述细胞系基因数据及所述药物分子数据进行第二特征提取处理以得到第二特征序列;
将所述第一特征序列与所述第二特征序列结合,以得到药物与细胞系反应预测结果。
2.根据权利要求1所述的药物与细胞系反应预测方法,其特征在于,所述将所述第一特征序列与所述第二特征序列结合,以得到药物与细胞系反应预测结果包括:
将所述第一特征序列与所述第二特征序列一一对应相加,以得到药物与细胞系反应预测结果。
3.根据权利要求1所述的药物与细胞系反应预测方法,其特征在于,所述对所述细胞系基因数据及所述药物分子数据进行第一特征提取处理以得到第一特征序列包括:
对所述细胞系基因数据及所述药物分子数据进行全部特征提取处理以得到第一特征序列;
所述对所述细胞系基因数据及所述药物分子数据进行第二特征提取处理以得到第二特征序列包括:
对所述细胞系基因数据及所述药物分子数据进行局部特征提取处理以得到第二特征序列。
4.根据权利要求3所述的药物与细胞系反应预测方法,其特征在于,所述对所述细胞系基因数据及所述药物分子数据进行全部特征提取处理以得到第一特征序列包括:
对所述细胞系基因数据进行特征提取处理,以得到第一维度的第一子特征;对所述药物分子数据进行特征提取处理,以得到第一维度的第二子特征;以及
将所述第一维度的第一子特征及所述第一维度的第二子特征进行拼接,以得到所述第一特征序列。
5.根据权利要求4所述的药物与细胞系反应预测方法,其特征在于,所述对所述细胞系基因数据进行特征提取处理,以得到第一维度的第一子特征;和所述对所述药物分子数据进行特征提取处理,以得到第一维度的第二子特征包括:
利用第一多层感知机对所述细胞系基因数据进行所述特征提取处理,以得到所述第一维度的第一子特征;
利用第二多层感知机对所述药物分子数据进行所述特征提取处理,以得到所述第一维度的第二子特征。
6.根据权利要求4所述的药物与细胞系反应预测方法,其特征在于,所述将所述第一维度的第一子特征及所述第一维度的第二子特征进行拼接,以得到所述第一特征序列包括:
将所述第一维度的第一子特征及所述第一维度的第二子特征进行拼接;
利用第三多层感知机对拼接的第一子特征和第二子特征进行特征提取处理,得到所述第一特征序列。
7.根据权利要求3所述的药物与细胞系反应预测方法,其特征在于,所述对所述细胞系基因数据及所述药物分子数据进行局部特征提取处理以得到第二特征序列包括:
对所述细胞系基因数据进行映射,以得到第二维度的第一子特征,及对所述药物分子数据进行映射,以得到第二维度的第二子特征;
将所述第二维度的第一子特征及所述第二维度的第二子特征进行关联,以得到关联特征;
在所述关联特征中提取细胞系与药物相互作用大于阈值的关联特征;
将提取到的所述细胞系与药物相互作用大于阈值的关联特征相加,以得到所述第二特征序列。
8.根据权利要求7所述的药物与细胞系反应预测方法,其特征在于,所述对所述细胞系基因数据进行映射,以得到第二维度的第一子特征,及对所述药物分子数据进行映射,以得到第二维度的第二子特征包括:
利用第一嵌入层对所述细胞系基因数据进行映射,以得到所述第二维度的第一子特征,及利用第二嵌入层对所述药物分子数据进行映射,以得到所述第二维度的第二子特征。
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