[发明专利]荧光图像信号数据存储与颜色分类方法有效
申请号: | 202111001852.9 | 申请日: | 2021-08-30 |
公开(公告)号: | CN113539368B | 公开(公告)日: | 2023-02-03 |
发明(设计)人: | 石乐民;冯欣;张昕;于源华;宫平;司远;刘闪闪;单韵歌;周苇锟;降雨薇;高悦;文欣雨 | 申请(专利权)人: | 长春理工大学;长春理工大学高技术产业有限责任公司 |
主分类号: | G16B30/00 | 分类号: | G16B30/00;G06V10/764;G06F16/906;G06F16/901 |
代理公司: | 长春众邦菁华知识产权代理有限公司 22214 | 代理人: | 张伟 |
地址: | 130022 吉林*** | 国省代码: | 吉林;22 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 荧光 图像 信号 数据 存储 颜色 分类 方法 | ||
本发明涉及一种荧光图像信号数据存储与颜色分类方法,属于微滴式数字PCR技术领域,该方法具体包括以下步骤:获取荧光图像,提取所述荧光图像中的荧光信号,并将提取到的荧光信号数据保存在data_table文件中;data_table文件采用自定义NodePoint类型的单向链表对荧光信号数据进行存储,并利用单向链表中的数据标记位完成数据颜色分类。本发明采用自定义NodePoint类型的单向链表,其包括X、Y、Temp三个数据成员,Temp为标识位的数据结构,通过自定义数据结构的方法对数据进行存储,通过数据标识位的方式完成颜色的分类,提高了数据存储及颜色分类的灵活性。
技术领域
本发明涉及微滴式数字PCR技术领域,特别是涉及一种荧光图像信号数据存储与颜色分类方法。
背景技术
核酸定量技术是疾病诊断的重要手段,是精准医疗的基础。微滴式数字PCR(Droplet digital PCR,ddPCR)作为核酸定量检测手段之一,具有超灵敏、绝对定量的特性且具有较大的动态范围。与上一代的实时荧光定量PCR相比,具有无需依赖外部标准、可绝对定量、可重复性强、对抑制剂的耐受性更高的优点,广泛应用于稀有变异检测、低丰度模板的精确定量、肿瘤治疗的伴随诊断和实时监控、微生物与病毒检测等生物医学领域。
ddPCR的原理是将DNA及荧光物质生成乳液微滴,然后将每个微滴用作独立的反应系统进行扩增,通过检测每个微滴是否存在荧光信号从而对核酸含量进行判断。乳液微滴芯片是用于承载用于PCR的微滴的芯片,乳液微滴芯片扫描成像分析仪是用于对芯片上微滴进行荧光激发、拍照、识别、数据分类从而进行微滴生成质量判别或核酸定量的器械。
ddPCR检测系统将从观察一维数据的变换曲线转变成获取生成的每个微滴的最终荧光强度,并且采用双激发光检测,一组激发光源进行实验有效性检测,即确保PCR实验的成功,另一组激发光源对目标检测基因位点进行检测。检测数据需要以二维数据呈现。但是目前的ddPCR检测系统的数据分类存储形式单一,数据分类灵活性较低,且不能实现对数据颜色的灵活分类,导致ddPCR检测系统在实验数据显示处理方面有较大的局限性。
发明内容
为了克服现有技术中存在的问题,本发明提供一种荧光图像信号数据存储与颜色分类方法,该方法能够实现按需求灵活划分十字象限,并且具有矩形、多边形框选数据进行颜色分类的功能,支持数据的多次灵活划分。
为实现上述目的,本发明采取如下的技术方案:
一种荧光图像信号数据存储与颜色分类方法,所述方法具体包括以下步骤:
步骤一:获取荧光图像,提取所述荧光图像中的荧光信号,并将提取到的荧光信号数据保存在data_table文件中;
步骤二:data_table文件采用自定义NodePoint类型的单向链表对荧光信号数据进行存储,并利用单向链表中的数据标记位完成数据颜色分类;
步骤二包括以下步骤:
步骤1:定义System.Data命名空间中的DataRow类的一个对象,用SData表示;定义System.Collections.Generic命名空间中Point类型的List类对象,用Data_listA和Data_listB表示;定义System.Collections.Generic命名空间中NodePoint类型的List类对象,用data_point表示;定义System.Data命名空间中DataTable类对象,用data_table表示;
步骤2:SData对象调用NewRow函数,创建新数据行对象,用dr表示,循环调用Substring函数,并将调用Substring函数的返回值赋值给dr,判断循环过程的表达式值是否为True,若是,则执行步骤3,否则继续执行步骤2;
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