[发明专利]一种果桑品种‘粤椹123’的SSR分子标记及其核心引物组、试剂盒和应用有效
申请号: | 202111002593.1 | 申请日: | 2021-08-30 |
公开(公告)号: | CN113430300B | 公开(公告)日: | 2021-11-09 |
发明(设计)人: | 王振江;唐翠明;罗国庆;钟建武;林森;陈莲;李智毅 | 申请(专利权)人: | 广东省农业科学院蚕业与农产品加工研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 广州科粤专利商标代理有限公司 44001 | 代理人: | 刘明星 |
地址: | 510610 广东省*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 品种 粤椹 123 ssr 分子 标记 及其 核心 引物 试剂盒 应用 | ||
1.一种用于鉴定果桑品种‘粤椹123’的SSR分子标记,其特征在于,包括SSR分子标记M10360和/或M29602;所述的SSR分子标记M10360的重复基序为(AT)n,其中n≥6,其右侧序列如SEQ ID NO.6所示,其左侧序列如SEQ ID NO.5所示;所述的SSR分子标记M29602的重复基序为(GCA)n,其中n≥6,其右侧序列如SEQ ID NO.8所示,其左侧序列如SEQ ID NO.7所示。
2.一种用于鉴定果桑品种‘粤椹123’的SSR分子标记的核心引物组,其特征在于,包括针对SSR分子标记M10360的引物和/或针对SSR分子标记M29602的引物:
所述的针对SSR分子标记M10360的引物:
M10360-F:5’-GAGTTCTTGAGGGGAAAGAGAAA-3’;
M10360-R:5’-AATTCCTGTGATCATCTGCCTTA-3’;
所述的引物M10360-F的5’端标记有荧光报告基团;
所述的针对SSR分子标记M29602的引物:
M29602-F:5’-ATGAACCCTCAGATGTTCTCAAT-3’;
M29602-R:5’-TTAATGATTCGACTCCGGTTTT-3’;
所述的引物M29602-F的5’端标记有荧光报告基团。
3.根据权利要求2所述的用于鉴定果桑品种‘粤椹123’的SSR分子标记的核心引物组,其特征在于,所述的荧光报告基团为FAM、HEX、TAMRA或ROX。
4.一种用于鉴定果桑品种‘粤椹123’的快速检测试剂盒,其特征在于,包括权利要求2或3所述的SSR分子标记的核心引物组。
5.一种利用SSR分子标记鉴定果桑品种‘粤椹123’的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)提取待测果桑样品的基因组DNA;
(2)以步骤(1)提取的基因组DNA为模板,分别利用权利要求2或3所述的引物对M10360-F/M10360-R和M29602-F/M29602-R进行PCR扩增;
(3)对步骤(2)中的PCR扩增产物进行分型,对分型结果进行条带判别;若以引物对M10360-F/M10360-R为引物扩增得到的PCR扩增产物只有158bp和176bp两条特异性条带,以引物对M29602-F/M29602-R为引物扩增得到的PCR扩增产物只有150bp一条特异性条带,则表明待测果桑样品为‘粤椹123’,否则,则表明待测果桑样品为非‘粤椹123’。
6.根据权利要求5所述的利用SSR分子标记鉴定果桑品种‘粤椹123’的方法,其特征在于,步骤(2)所述的PCR扩增,其反应体系为20μL,包括:50ng/μL DNA模板0.5μL、10×PCRbuffer 2μL、25mM MgCl2 2μL、10mM dNTPs 0.5μL、5U/μL Taq DNA聚合酶0.2μL、10μM上游引物0.5μL、10μM下游引物0.5μL和ddH2O 13.8μL;步骤(2)所述的PCR扩增,其反应程序为:95℃预变性5min;95℃变性30s,60℃退火30s,每个循环降1℃,72℃延伸30s,循环10次;94℃变性30s,50℃退火30s,72℃延伸30s,循环30次;最后72℃延伸5min。
7.权利要求2或3所述的核心引物组或权利要求4所述的快速检测试剂盒在鉴定果桑品种‘粤椹123’中的应用。
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