[发明专利]一种病理知识图谱的构建方法及装置

说明书

本申请提供了一种病理知识图谱的构建方法及装置，包括根据不同语料来源的医疗文本数据，创建病理数据知识库，病理数据知识库包括疾病类实体对和用于表征疾病类实体对中的两个疾病实体之间关联的第一实体关系；基于医学数据，根据预设医学规则，创建医学规则知识库，医学规则知识库包括解读类实体对和用于表征解读类实体对中的两个解读实体之间关联的第二实体关系；确定疾病类实体对与解读类实体对中的等价类实体；基于等价类实体，将病理数据知识库和医学规则知识库融合为目标知识库；基于目标知识库形成目标病理知识图谱以进行存储。

技术领域

本申请涉及医疗数据处理技术领域，具体而言，涉及一种病理知识图谱的构建方法及装置。

背景技术

医疗知识图谱的构建目的大多是为了解决临床业务或者互联网医疗业务的场景需求。但是，对于医疗行业的细分领域，病理大数据行业，目前并没有相对成熟、完整的知识图谱，来辅助并实践病理业务场景的需求落地。因此，针对病理行业的辅助诊疗判断、智能导诊、病理数据结构化处理、病理数据分析解读等真实场景的需求，病理知识图谱的创建具有非常重要的价值和意义。

此外，病理知识图谱还可以作为核心技术辅助手段，应用于医疗大数据平台的数据存储、查询、推理和数据挖掘。传统的高通量测序数据解读主要依赖于基于规则或者降维等数据分析方法实现。将病理知识图谱应用于这一场景，可以方便病理医生进行分子指标解读，提高产出分子病理报告的效率。

发明内容

有鉴于此，本申请的目的在于提供一种病理知识图谱的构建方法、装置、电子设备及存储介质，目的在于提供一种来源真实、覆盖面广泛、可移植性高的病理知识图谱，并应用于数据解读系统以获取病理分析图谱。

第一方面，本申请实施例提供一种病理知识图谱的构建方法，包括：根据不同语料来源的医疗文本数据，创建病理数据知识库，病理数据知识库包括疾病类实体对和用于表征疾病类实体对中的两个疾病实体之间关联的第一实体关系；基于医学数据，根据预设医学规则，创建医学规则知识库，医学规则知识库包括解读类实体对和用于表征解读类实体对中的两个解读实体之间关联的第二实体关系；确定疾病类实体对与解读类实体对中的等价类实体；基于等价类实体，将病理数据知识库和医学规则知识库融合为目标知识库；基于目标知识库形成目标病理知识图谱以进行存储。

优选地，根据不同语料来源的医疗文本数据，创建病理数据知识库的步骤，具体包括：将医疗文本数据输入实体识别模型，获得多个疾病类实体，并将多个疾病类实体随机组合，获得多个预测实体对；针对每个预测实体对，将该预测实体对输入关系识别模型，获得该预测实体对中的两个疾病实体之间的预测实体关系；基于预测实体关系，从多个预测实体对中筛选出符合实体关系条件的预测实体对；将筛选出的预测实体对确定为疾病类实体对，将筛选出的预测实体对之间的预测实体关系确定为第一实体关系，以生成病理数据知识库。

优选地，通过以下方式确定每个预测实体对中的两个疾病实体之间的预测实体关系：确定预测实体对的词向量；确定预测实体对所在语句的句子向量；将所确定的词向量和句子向量输入关系识别模型，获得预测实体对中的两个疾病实体之间的预测实体关系。

优选地，预设医学规则包括疾病变异解读关系，通过以下方式创建医学规则知识库：从医学数据中提取第一疾病实体；根据疾病变异解读关系，确定与所提取的第一疾病实体存在疾病解读关系的变异解读实体；

确定与变异解读实体存在一度解读关系或者多度解读关系的解读实体；确定与变异解读实体存在基因变异解读关系的基因变异序列；确定与基因变异序列存在一度解读关系或者多度解读关系的变异实体；将存在一度解读关系的实体确定为解读类实体对，将解读类实体对之间的一度解读关系确定为第二实体关系，以生成与第一疾病实体对应的医学规则知识库。