[发明专利]用于小细胞肺癌患者预后的系统及其应用有效
申请号: | 202111030306.8 | 申请日: | 2021-09-03 |
公开(公告)号: | CN113736879B | 公开(公告)日: | 2023-09-22 |
发明(设计)人: | 赫捷;孙楠;张志慧;张超奇;张国超 | 申请(专利权)人: | 中国医学科学院肿瘤医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11;C12Q1/6851;G16B5/00;G16B25/10;G16B25/20;G16H50/30 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 魏少伟 |
地址: | 100021 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 细胞 肺癌 患者 预后 系统 及其 应用 | ||
1.用于预测小细胞肺癌患者治疗疗效或预后的系统,包括检测PRRC2A、IGF2BP1、METTL5、METTL14、G3BP1、ZCCHC4、IGF2BP3、RBM15B、ALKBH5、YTHDC2和IGF2BP2十一种基因表达量的系统。
2.根据权利要求1所述的系统,其特征在于:所述检测PRRC2A、IGF2BP1、METTL5、METTL14、G3BP1、ZCCHC4、IGF2BP3、RBM15B、ALKBH5、YTHDC2和IGF2BP2十一种基因表达量的系统包括通过荧光定量PCR方法检测所述十一种基因表达量所需的试剂和/或仪器。
3.根据权利要求2所述的系统,其特征在于:所述通过荧光定量PCR方法检测所述十一种基因表达量所需的试剂包括检测PRRC2A、IGF2BP1、METTL5、METTL14、G3BP1、ZCCHC4、IGF2BP3、RBM15B、ALKBH5、YTHDC2和IGF2BP2十一种基因表达量的引物。
4.根据权利要求3所述的系统,其特征在于:所述引物为序列表中序列1-22所示的22条单链DNA。
5.根据权利要求3或4所述的系统,其特征在于:所述十一种基因表达量为所述十一种基因相对于内参基因的相对表达量,所述通过荧光定量PCR方法检测所述十一种基因表达量所需的试剂还包括检测内参基因的引物。
6.如权利要求1或2所述的系统,其特征在于:所述用于预测小细胞肺癌患者治疗疗效或预后的系统还包含数据处理装置;所述数据处理装置内设模块;所述模块具有如下(a1)和/或(a2)和/或(a3)和/或(a4)所示的功能:
(a1)根据待测小细胞肺癌患者的所述十一种基因相对表达量计算风险值,风险值=-0.1627×PRRC2A基因相对表达量-0.0702×IGF2BP1基因相对表达量+0.4571×METTL5基因相对表达量+0.151×METTL14基因相对表达量+0.1318×G3BP1基因相对表达量+0.1609×ZCCHC4基因相对表达量-0.1672×IGF2BP3基因相对表达量-0.2846×RBM15B基因相对表达量-0.2664×ALKBH5基因相对表达量+0.0212×YTHDC2基因相对表达量+0.0184×IGF2BP2基因相对表达量;
(a2)确定阈值,将由多个待测小细胞肺癌患者组成的待测群体分为低风险组和高风险组;
(a3)按照如下标准确定来自于所述待测群体的待测小细胞肺癌患者的预后风险和/或预后总生存率:“来自于所述高风险组中的待测患者”的预后风险高于或候选高于“来自于所述低风险组中的待测患者”;“来自于所述低风险组中的待测患者”的预后总生存率高于或候选高于“来自于所述高风险组中的待测患者”;
(a4)按照如下标准确定非所述待测群体的其他待测小细胞肺癌患者预后风险和/或预后总生存率:风险值大于阈值的其他待测小细胞肺癌患者的预后风险高或候选高,风险值小于等于阈值的其他待测小细胞肺癌患者的预后风险低或候选低;风险值大于阈值的其他待测小细胞肺癌患者的预后总生存率低或候选低,风险值小于等于阈值的其他待测小细胞肺癌患者的预后总生存率高或候选高。
7.权利要求1至6中任一所述的检测PRRC2A、IGF2BP1、METTL5、METTL14、G3BP1、ZCCHC4、IGF2BP3、RBM15B、ALKBH5、YTHDC2和IGF2BP2十一种基因表达量的系统。
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