[发明专利]从FFPE样本中快速提取核酸的试剂、试剂盒及其应用有效
申请号: | 202111036791.X | 申请日: | 2021-09-06 |
公开(公告)号: | CN113584019B | 公开(公告)日: | 2022-08-30 |
发明(设计)人: | 崔国鹏;董超;张银;张晓亮;杨增利 | 申请(专利权)人: | 郑州安图生物工程股份有限公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 450001 河南省*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | ffpe 样本 快速 提取 核酸 试剂 试剂盒 及其 应用 | ||
1.一种从FFPE样本中提取核酸的试剂,其特征在于:所述试剂包括结合缓冲液,所述结合缓冲液包括以下组分:胍盐1-5M,吐温系列表面活性剂0.1-2%(v/v),聚乙二醇辛基苯基醚1-5%(v/v),乙二胺四乙酸10-40mM,Tris-HCl 20-60mM,聚乙二醇0.1-2%(w/v),十二烷基硫酸根离子沉淀剂0.1-2M,pH值为8.0-9.5;
所述胍盐为盐酸胍或异硫氰酸胍;
所述吐温系列表面活性剂为吐温20或吐温40;
所述聚乙二醇的分子量为6000-8000;
所述十二烷基硫酸根离子沉淀剂为氯化钾或氯化锶;
所述试剂还包括脱蜡剂、裂解缓冲液、蛋白酶、磁珠、核酸助沉剂、洗涤缓冲液和洗脱缓冲液;
所述裂解缓冲液由以下组分组成:十二烷基硫酸钠10-50mM,吐温20或吐温40 0.1-1%(v/v),Tris-H2SO410-50mM,pH值为7.5-10.0;
所述洗涤缓冲液包括洗涤缓冲液I和洗涤缓冲液II,所述洗涤缓冲液I由以下组分组成:胍盐1mM-5M,Tris-HCl 10-60mM,乙醇或异丙醇40-80%(v/v),pH值为4.0-8.0;所述洗涤缓冲液II由以下组分组成:Tris-HCl 10-60mM,乙醇或异丙醇60-90%(v/v),pH值为7.0-10.0,余量为水;
所述洗脱缓冲液为TE缓冲液,组成为:Tris-HCl 10mM,乙二胺四乙酸1mM,pH值为8.0-9.5。
2.根据权利要求1所述的从FFPE样本中提取核酸的试剂,其特征在于:所述磁珠选自硅羟基磁珠、羧基修饰磁珠中的任意一种,表面无孔或多孔;
所述核酸助沉剂选自C1-C5的一元醇、C1-C9的多元醇中的一种或多种;所述C1-C5的一元醇选自甲醇、乙醇、丙醇、异丙醇、丁醇、戊醇中的一种或多种;所述C1-C9的多元醇选自2-甲基-1,3-丙二醇、2,3-丁二醇、1,2-丙二醇、三丙二醇中的一种或多种。
3.根据权利要求1所述的从FFPE样本中提取核酸的试剂,其特征在于:所述试剂还包括甲醛清除剂、解交联试剂中的一种或多种;
所述脱蜡剂选自萜烯油、矿物油、C7-C10的直链/支链烷烃或其混合物、柠檬精油、6-溴己基乙酸酯、C10-C16的直链/支链/环状烷烃或其混合物、聚有机硅氧烷脱蜡剂中的一种或多种;
所述甲醛清除剂选自己二酸二酰肼、琥珀酸二酰肼中的一种或多种;
所述解交联试剂选自乙醇胺、二乙醇胺、三乙醇胺、2-氨基-1,3-丙二醇、氨基胍中的一种或多种。
4.一种从FFPE样本中提取核酸的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒包括包含如权利要求1所述试剂的容器,具体为:
包含脱蜡剂的容器;
包含裂解缓冲液的容器;
包含蛋白酶的容器;
包含结合缓冲液的容器;
包含磁珠的容器;
包含核酸助沉剂的容器;
包含洗涤缓冲液的容器;
包含洗脱缓冲液的容器。
5.根据权利要求4所述的从FFPE样本中提取核酸的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括以下一个或多个容器:
包含甲醛清除剂的容器;
包含解交联试剂的容器。
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