[发明专利]用于检测小麦镰刀菌苗枯病QTL Qfsb.hbaas-1DL的分子标记及其应用

说明书

本发明公开了一种用于检测抗镰刀菌苗枯病QTL Qfsb.hbaas‑1DL的分子标记及其应用。本发明提供了检测小麦染色体1DL的SNP IWB41243位点的基因型的物质在鉴定或辅助鉴定小麦镰刀菌苗枯病抗性中的应用；还提供了检测小麦染色体1DL的SNP IWB41243位点的基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定小麦镰刀菌苗枯病抗性产品中的应用。本发明通过全基因组关联分析(GWAS)发现了位于小麦1D染色体长臂上抗镰刀菌苗枯病位点Qfsb.hbaas‑1DL，进一步将其关联SNP IWB41243转化为普通PCR标记KASP‑Fsb1DL，两者对240份材料分型一致率为97.9％。该标记可用于检测抗镰刀菌苗枯病QTL Qfsb.hbaas‑1DL的基因型，并用于抗镰刀菌苗枯病分子育种。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，具体涉及一种用于检测抗小麦镰刀菌苗枯病QTLQfsb.hbaas-1DL的分子标记及其应用。

背景技术

小麦(Triticum aestivum L.)是世界上最重要的粮食作物之一，对保障粮食安全具有重要意义。小麦镰刀菌苗枯病(Fusarium seedling blight，FSB)和赤霉病(Fusariumhead blight，FHB)主要由镰刀菌病原体引起，是全球小麦和其他小粒谷物作物的破坏性病害。小麦苗枯病会对生长中的幼苗造成损害或在生长季节后期腐烂，从而导致出苗减少和生长发育迟缓，从而导致产量损失。此外，小麦苗枯病可以为随后的小麦赤霉病感染提供病原体来源，导致小麦减产和食品安全危害。近年来，由于全球气候和耕作制度的变化，小麦苗枯病和赤霉病经常达到流行水平，并在全球小麦产区造成数百万公顷的巨大产量损失。此外，小麦苗枯病和赤霉病在感染过程中都会产生各种真菌毒素，这些毒素对人类和家畜都具有高毒性，威胁人类健康。

培育抗病小麦品种是减轻小麦苗枯病危害最经济和有效的手段。利用分子标记辅助育种是抗病育种的有效手段，而相关分子标记的定位与开发至关重要。同小麦赤霉病相比，小麦苗枯病并未受到太多关注，目前国内外仅有少量研究关注小麦苗枯病抗性的QTL。前人利用一个包含91份材料双单倍体(DH)群体，鉴定出一个在5B染色体上控制小麦苗枯病抗性的QTL，连锁标记WMC75解释了13.8％的表型变异。Ren等(2016)利用一个包含110份材料DH群体，分别在染色体1AL和2BS上定位了由病原菌Microdochium nivale和Microdochium majus引起的小麦苗枯病抗性的单个主要QTL。上述研究均为利用遗传群体(DH群体)进行分子标记定位，都没有开发出适宜大规模检测的可用于分子标记辅助育种的可靠标记。

发明内容

为了挖掘小麦抗镰刀菌苗枯病位点并开发其分子标记，本发明的一个目的是检测小麦染色体1DL的SNP IWB41243位点的基因型物质的用途。

本发明提供了检测小麦染色体1DL的SNP IWB41243位点的基因型的物质在鉴定或辅助鉴定小麦镰刀菌苗枯病抗性中的应用；

和/或，本发明提供了检测小麦染色体1DL的SNP IWB41243位点的基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定小麦镰刀菌苗枯病抗性产品中的应用；

本发明还提供了检测小麦染色体1DL的SNP IWB41243位点的基因型的物质在选育抗镰刀菌苗枯病小麦品种中的应用；

和/或，本发明还提供了检测小麦染色体1DL的SNP IWB41243位点的基因型的物质在制备选育抗镰刀菌苗枯病小麦产品中的应用。

本发明还提供了检测小麦染色体1DL的SNP IWB41243位点的基因型的物质在抗镰刀菌苗枯病小麦育种中的应用；

和/或，本发明还提供了检测小麦染色体1DL的SNP IWB41243位点的基因型的物质在制备抗镰刀菌苗枯病小麦育种产品中的应用。

上述应用中，所述SNP IWB41243位点为位于小麦染色体1DL上，物理位置为458.9Mb的位点；