[发明专利]一种用于筛选具有耐低温性状的日本对虾的分子标记A2629及其扩增引物和应用

说明书

本发明提供了一种用于筛选具有耐低温性状的日本对虾的分子标记A2629及其扩增引物和应用。所述分子标记A2629核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，分子标记A2629的扩增引物的核苷酸序列如SEQ ID No.2和SEQ ID No.3所示。所述的分子标记A2629为SNP标记，其耐低温基因型为AG基因型。所述分子标记A2629可以不受日本对虾生长阶段的限制，明显加快日本对虾的选育进程并快速选育出具备耐受低温优良性状的日本对虾新品种，并且使用该分子标记A2629检测日本对虾耐低温性状准确可靠且操作简单，有利于日本对虾的健康养殖与发展，具有广阔的应用前景。

技术领域

本发明属于水产动物分子标记辅助育种领域，具体涉及一种用于筛选具有耐低温性状的日本对虾的分子标记A2629及其扩增引物和应用。

背景技术

日本对虾(Marsupenaeus japonicus) 原称日本对虾，隶属十足目、对虾科、囊对虾属，分布在印度-西太平洋热带、非洲东海岸、马来西亚、日本、朝鲜、中国东南沿海等海域，是中国主要对虾养殖品种之一，日本对虾生长迅速、耐干露、色泽艳丽和经济价值高，深受水产品市场和养殖者欢迎，从我国南方到北方沿海各省市均有养殖，并形成一定的规模。良种繁育对日本对虾养殖业具有重要意义。耐低温是日本对虾的重要抗逆性状。一方面，由于日本对虾具有较高的市场需求，该种对虾主要在中国北方水域进行养殖，其中包括山东、河北、江苏等北方省份的海水水域，耐低温成为中国北方日本对虾养殖业追求的重要抗逆性状；另一方面，在中国的春节时期，鲜活日本对虾的市场价格是平常季节的3倍以上，北方等地的对虾养殖农户经常冒险的将上市时间拖到冬季，又往往因冬季寒潮造成水温骤降引起养殖对虾大规模死亡，耐低温品种的选育也是日本对虾养殖业的迫切需求。

传统的选育方法依赖于表型选择，具有周期长、不稳定等不利因素。分子育种，即分子标记辅助选择育种，是指利用DNA分子标记对育种材料进行选择的技术，分子育种方法根据有效的分子标记进行后备亲本选择，能更快速地提升子代的经济性状。SNP(SingleNucleotide Polymorphism)是指基因组上单核苷酸的多态性，是目前应用最广、最新的分子标记。目前，有关日本对虾耐低温的分子标记开发的研究较少，并且产业中缺乏可应用于分子标记辅助育种的标记。因此，开发耐低温性状相关分子标记对日本对虾的健康养殖及加速育种进程具有重要的意义。

发明内容

本发明提供了一种用于筛选具有耐低温性状的日本对虾的分子标记A2629及其扩增引物和应用。所述分子标记A2629及其扩增引物能够用于筛选具有耐低温性状的日本对虾，这有助于日本对虾耐低温性状的培育及养殖业发展。

为实现上述发明目的，本发明采用以下技术方案予以实现：

本发明提供了一种用于筛选具有耐低温性状日本对虾的分子标记A2629，所述分子标记A2629的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。

进一步的，所述分子标记A2629第501位碱基为G。

进一步的，所述分子标记A2629的耐低温基因型为AG基因型。

进一步的，所述分子标记A2629为SNP标记。

本发明还提供了所述的分子标记A2629的扩增引物，所述扩增引物的核苷酸序列如SEQ ID No.2和SEQ ID No.3所示。

本发明还提供了所述的分子标记A2629或所述的扩增引物在筛选具有耐低温性状的日本对虾品种中的应用。

进一步的，筛选具有耐低温性状的日本对虾品种的具体步骤为：提取待测的日本对虾样本的基因组DNA，并以基因组DNA为模板，利用所述扩增引物进行PCR扩增，对PCR扩增产物进行测序，测序结果中分子标记的基因型为AG基因型，则待测的日本对虾具有耐低温性状。