[发明专利]基于Cnn-former的肝纤维化病变检测模型训练方法与系统在审

专利信息
申请号: 202111085690.1 申请日: 2021-09-16
公开(公告)号: CN113838018A 公开(公告)日: 2021-12-24
发明(设计)人: 杨永林;张鹏程;冯艺;肖丽;李子轩;王欣茹;蔡虓;杨淑涵 申请(专利权)人: 泰州市人民医院;河海大学
主分类号: G06T7/00 分类号: G06T7/00;G06K9/62;G06N3/04;G06N3/08
代理公司: 南京苏高专利商标事务所(普通合伙) 32204 代理人: 孟红梅
地址: 225300 江苏*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 基于 cnn former 纤维化 病变 检测 模型 训练 方法 系统
【权利要求书】:

1.基于Cnn-former的肝纤维化病变检测模型训练方法,其特征在于:包括以下步骤:

(1)获取电子病历,包括生化特征、生理特征和CT图像特征;

(2)对生化特征进行缺失值补全、标准化处理以及异常检测处理,提取生理特征描述信息的自定义实体并转换为数值,通过二分类图像网络将CT图像分为是否疑似患病标签,将其作为一个特征加入训练数据集;训练数据集中的病理特征包括数值化的生化特征、生理特征和CT图像特征;

(3)绘制特征权重影响图,根据图中特征对于分类标签的影响进行特征筛选;

(4)根据Spearman相关系数计算所有特征的相关系数,将结果绘制为热力图,用于验证步骤(3)中筛选的特征是否有效,如果出现不一致,则根据专家分析结果,决定是否将其判定为有效特征;

(5)使用Cnn-former构建肝纤维化病变检测模型,使用训练数据集进行模型训练,其中Cnn-former是基于Informer模型改进的,在已有的Informer的基础上,去除掉最外层的词嵌入层以及相对位置编码层,使得Informer网络层可以输入病理特征;在最外层嵌入一个一维卷积层,训练集的输入先输入进一维CNN卷积,卷积后的结果加入ProbSpare self-attention层中,经过编码层与解码层,将最后的SoftPlus激活函数改为Softmax激活函数,得到患病的概率;

(6)对步骤(5)所获得的基于Cnn-former的肝纤维化病变检测模型进行测试和评估,验证其准确性。

2.根据权利要求1所述的基于Cnn-former的肝纤维化病变检测模型训练方法,其特征在于:所述步骤(2)中对生化特征的处理包括:

对所得数据样本的所有属性进行缺失值处理,采用均值插补的方法,如果字段可用常数度量,则使用该属性有效值的平均值来插补缺失值,如果该属性由数值等级度量,则使用该属性有效值的众数来插补缺失值;

根据Z-Score标准化方法对补全后的数据进行标准化处理,经过处理的数据符合标准正态分布,从而取消由于量纲不同引起的误差;

基于Isolation Forest异常检测算法的思想,递归随机划分肝纤维化病变数据集并建立局部模型,其中每棵孤立树用来识别特定属性子样本;计算出每个样本点的异常得分进行排序,将异常得分接近于1的样本点断为异常点;将标记为异常点的样本点直接删除,从而去除分布稀疏且离密度高的群体较远的异常数据。

3.根据权利要求1所述的基于Cnn-former的肝纤维化病变检测模型训练方法,其特征在于:所述步骤(2)中对生理特征的处理包括:

对生理特征描述信息,通过已有的Lac工具完成实体提取,获得“是否酗酒”、“是否有过刺痛感”信息,再将特征处理为数据特征,区分无酗酒和有酗酒,标定疼痛等级。

4.根据权利要求1所述的基于Cnn-former的肝纤维化病变检测模型训练方法,其特征在于:使用ResNet网络对CT图像进行分类,将图像转化为疑似病例和未疑似病例,作为一维特征加入训练数据集中。

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