[发明专利]一种与油菜硒高效性状主效QTL位点qSe.C07紧密连锁的分子标记及应用

说明书

本发明属于分子生物学及遗传育种技术领域，具体涉及一种与油菜硒高效性状主效QTL位点qSe.C07紧密连锁的分子标记及应用。本发明首次获得了控制油菜硒高效性状的稳定的QTL位点qSe.C07，并检查到与该位点紧密连锁的位于已公开发表的甘蓝型油菜Darmor‑bzh v10基因组第C07染色体上第36436561个碱基的SNP标记，可解释12.2%的表型变异。根据该变异位点的反义链设计了KASP分子标记SeC07J，利用该标记可鉴定油菜硒高效QTL位点qSe.C07的优异等位变异，快速准确筛选出硒含量较高的优良单株，该分子标记还可与其他分子标记联用，进一步提高油菜硒富集能力筛选育种效率。

技术领域

本发明属于分子生物学及遗传育种技术领域，具体涉及一种与油菜硒高效性状QTL位点qSe.C07紧密连锁的分子标记及应用。

背景技术

硒是人体生命活动中不可或缺的微量元素，具有多种重要的生物调节功能，在增强机体免疫力、提高雄性生殖能力、改善心肌营养、防癌抗癌、延缓衰老等方面发挥着重要作用。长期硒摄入不足会导致克山病、大骨关节病、多发性硬化症、慢性胰腺炎等多种疾病。中国居民膳食营养素参考摄入量标准(WST 578.3—2017)推荐的成人每天硒摄入量为60-400微克。

含硒植物是人体摄入硒的主要途径。然而，由于我国土壤环境中硒缺乏现象普遍，生产的植物性食品硒含量普遍偏低。油菜具有菜薹产量高、口味好、营养均衡、地域适应能力强等优点，近年来已逐渐成为广受消费者喜爱的蔬菜产品。且前期研究表明部分油菜品种具有“硒高效”特性，即“硒高效”油菜在相同生产环境下在同一组织部位中可富集更高硒含量，即油菜的富硒能力。而油菜资源丰富，遗传多样性高，因此充分发掘油菜“硒高效”潜力进行育种改良，将是缓解我国居民硒摄取需求的有效手段。

传统的育种手段由于育种年限长、选择效率低，难以满足当前作物育种需求。随着分子生物学和测序技术的快速发展，通过基因型选择加速育种进程已成品种选育中广泛应用的技术手段。利用分子标记辅助选择检测油菜中与硒高效性状紧密关联的分子标记，可以克服硒含量表型鉴定中的困难，指导性状的精准导入或聚合，将极大提高育种效率。目前，油菜中尚无硒富集或硒高效性状关联位点被鉴定的报道，相关育种工作仍以传统的大规模表型筛选为主。

本发明通过对油菜薹硒含量的全基因组关联分析，旨在找到对油菜硒高效性状具有改良效应的主效QTL位点，并基于此开发实用的分子标记，用于油菜硒高效性状的标记辅助选择。

发明内容

本发明的目的是在于提供了一种与油菜硒高效性状主效QTL位点qSe.C07紧密连锁的分子标记，该分子标记为SNP标记，位于已公开发表的甘蓝型油菜Darmor-bzh v10基因组第C07染色体上第36436561个碱基。

本发明的另一个目的在于提供了一种与油菜硒高效性状主效QTL位点qSe.C07紧密连锁的分子标记的应用，通过对甘蓝型油菜Darmor-bzh v10基因组第C07染色体上第36436561个碱基进行基因型的检测，即可实现对油菜富硒能力的筛选育种。

本发明的最后一个目的在于提供了一种与油菜硒高效性状主效QTL位点qSe.C07紧密连锁的分子标记与其他分子标记联用的应用。

为了达到上述目的，本发明采取以下技术措施：

与油菜硒高效性状主效QTL位点qSe.C07的获得：

(1)收集327份来自世界各个国家的甘蓝型油菜自交系作为油菜关联群体，采集关联群体各株系的单株叶片，用CTAB法提取总DNA，利用武汉双绿源创芯科技研究院有限公司开发的油菜50K Illumina SNP芯片对每个样本进行基因型分析。