[发明专利]一种人SERPINB7基因突变快速分型检测方法在审
申请号: | 202111091748.3 | 申请日: | 2021-09-17 |
公开(公告)号: | CN113832148A | 公开(公告)日: | 2021-12-24 |
发明(设计)人: | 李明;李明阳;方耀东 | 申请(专利权)人: | 上海五色石医学科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/6883;C12Q1/6858 |
代理公司: | 杭州创信知识产权代理有限公司 33383 | 代理人: | 杜海东 |
地址: | 201403 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 serpinb7 基因突变 快速 检测 方法 | ||
1.一种用于检测人SERPINB7基因突变的引物探针组合物,其特征在于,包括如下至少一个基因位点的引物对及对应探针的序列,或者互补序列:
c.796CT位点为:序列如SEQ ID No.1及SEQ ID No.2所示的引物,序列如SEQ ID No.3和/或SEQ ID No.4所示探针;
c.522_523insT位点为:序列如SEQ ID No.5及SEQ ID No.6所示引物,序列如SEQ IDNo.7和/或SEQ ID No.8所示探针;
c.650_653delCTGT位点择一为:序列如SEQ ID No.9及SEQ ID No.10所示引物,序列SEQ ID No.12所示探针;或,序列如SEQ ID No.9及SEQ ID No.11所示引物,序列SEQ IDNo.13所示探针;
c.806_818delinsT位点为:序列如SEQ ID No.1及SEQ ID No.14所示引物,序列如SEQID No.15和/或SEQ ID No.16所示探针。
2.如权利要求1所述的引物探针组合物,其特征在于,任一所述探针的5’端连接荧光基团,任一所述探针的3’端连接荧光淬灭基团。
3.如权利要求2所述的引物探针组合物,其特征在于,任一所述探针连接的荧光基团独立地选自FAM、VIC、CY5、ROX、HEX、JOE、NED、Texas Red或CY3中的1种。
4.如权利要求3所述的引物探针组合物,其特征在于:
序列如SEQ ID No.3所示探针所连荧光基团为FAM,
序列如SEQ ID No.4所示探针所连荧光基团为ROX,
序列如SEQ ID No.7所示探针所连荧光基团为CY5,
序列如SEQ ID No.8所示探针所连荧光基团为ROX,
序列如SEQ ID No.12所示探针所连荧光基团为VIC,
序列如SEQ ID No.13所示探针所连荧光基团为FAM,
序列如SEQ ID No.15所示探针所连荧光基团为CY5,
序列如SEQ ID No.16所示探针所连荧光基团为VIC。
5.如权利要求2所述的引物探针组合物,其特征在于,任一所述探针连接的淬灭基团独立地选自MGB、BHQ-1、BHQ-2、BHQ-3或TAMRA中1种。
6.一种使用如权利要求1-5任一所述引物探针组合物的快速分型检测方法,其特征在于,检测的基因突变位点为SERPINB7基因的c.796CT、c.522_523insT、c.650_653delCTGT、c.806_818delinsT位点,所用的方法为TaqMan探针法。
7.如权利要求6所述的快速分型检测方法,其特征在于,所述c.796CT、c.522_523insT、c.650_653delCTGT、c.806_818delinsT位点需分组检测,所述分组检测至少为2组。
8.如权利要求7所述的快速分型检测方法,其特征在于,所述分组检测为2组时:
第一组检测位点包括c.796CT位点的突变型、c.522_523insT位点的野生型和突变型、c.650_653delCTGT位点的野生型;
第二组检测位点包括c.796CT位点的野生型、c.650_653delCTGT位点的突变型、c.806_818delinsT位点的野生型和突变型。
9.如权利要求8所述的快速分型检测方法,其特征在于,所述TaqMan探针法中的PCR扩增体系除引物探针组合物外,还包括DNA聚合酶、dNTP、Mg2+、ROX Dye。
10.如权利要求9所述的快速分型检测方法,其特征在于,所述PCR扩增体系还包括Tris、10mM~500mM的KCl、10mM~500mM的(NH4)2SO4、1%~50%质量含量的甘油、0.001mg/mL~1mg/mL的BSA、0.1%~10%质量含量的Tween 20、1mM/mL~100mM/mL的二硫苏糖醇、0.1M~3M的甜菜碱以及0.1%~10%质量含量的DMSO。
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