[发明专利]一种基因芯片的判读方法、装置、设备及存储介质

说明书

本发明实施例公开了一种基因芯片的判读方法，所述方法应用于内置在芯片杂交仪中的基因芯片的判读装置，包括：通过与芯片杂交仪相连的预设接口获取待判读的基因芯片图像，并在基因芯片图像中进行目标图像的识别；将目标图像输入训练好的判读模型中，获取输出的判读结果。本发明实施例提供的基因芯片的判读方法，通过将基因芯片判读装置嵌入现有的芯片杂交仪中，获取基因芯片图像，并利用判读模型进行智能判读，实现了基因芯片图像的自动化判读，减少了工作人员的重复性劳动，大大提高了工作效率。

技术领域

本发明涉及计算机视觉技术领域，尤其涉及一种基因芯片的判读方法、装置、设备及存储介质。

背景技术

基因芯片的测序原理是通过与一组已知序列的核酸探针杂交进行核酸序列测定，其中，斑点杂交法是指将待测的DNA变性后点加在硝酸纤维素膜(或尼龙膜、NC膜)上，用已标记的探针进行杂交，再进行洗膜(除去未接合的探针)和放射自显影，根据显影结果判断是否有杂交及其杂交强度，主要用于基因缺失或拷贝数改变的检测。

对基因芯片的判读，目前只能以人工判读的方式进行，存在以下问题：不能与智能化仪器整体配套，不能自动发送检测结果；工作繁琐，人工判读效率低。

对于基因芯片的自动判读，目前的方案效果都不理想，存在以下技术困难：图像不规整、背景差、色浅、边缘有阴影等造成误判；图像有涂写、记录文字、损坏等，造成误判；不能误别弱阳性，需要人工复核；外置的判读设备和软件，不能整合到杂交仪中。

发明内容

本发明实施例提供了一种基因芯片的判读方法、装置、设备及存储介质，实现了对基因芯片显影结果的智能判读。

第一方面，本发明实施例提供了一种基因芯片的判读方法，所述方法应用于内置在芯片杂交仪中的基因芯片的判读装置，包括：

通过与芯片杂交仪相连的预设接口获取待判读的基因芯片图像，并在所述基因芯片图像中进行目标图像的识别；

将所述目标图像输入训练好的判读模型中，获取输出的判读结果。

进一步地，在所述基因芯片图像中进行目标图像的识别，包括：

通过二值化处理将所述基因芯片图像转化为二值化图像；

对所述二值化图像进行边框识别，获取包含四条边框线的所述目标图像。

进一步地，通过二值化处理将所述基因芯片图像转化为二值化图像，包括：

将所述基因芯片图像的分辨率和尺寸调整为预设大小；

确定所述基因芯片图像中各像素点的灰度值，针对所述各像素点，若灰度值大于等于第一设定阈值则令对应像素点的灰度值为255，若灰度值小于第一设定阈值则令对应像素点的灰度值为0；

将各像素点的灰度值为0或255的图像确定为所述二值化图像。

进一步地，对所述二值化图像进行边框识别，获取包含四条边框线的所述目标图像，包括：

对所述二值化图像进行裁剪，去除所述二值化图像中的边缘部分，并通过旋转将所述二值化图像校正到标准位置；

识别所述二值化图像中的线条并进行筛选，保留灰度值大于等于第二设定阈值的线条；

确定所述二值化图像中的四条边框线，将包含所述四条边框线的二值化图像确定为所述目标图像。

进一步地，确定所述二值化图像中的四条边框线，包括：

分别确定所述二值化图像上侧第一条黑线下方设定距离处的第一参考线，和第二条黑线下方设定距离处的第二参考线，若所述第一参考线覆盖范围内灰度值为零，且所述第二参考线覆盖范围内灰度值不为零，则将所述第二参考线确定为上侧边框；