[发明专利]一种面向序列切片的扫描电镜三维影像获取系统及方法在审

专利信息
申请号: 202111138563.3 申请日: 2021-09-27
公开(公告)号: CN114049252A 公开(公告)日: 2022-02-15
发明(设计)人: 陈曦;韩华;沈丽君;马宏图;张丽娜 申请(专利权)人: 中国科学院自动化研究所
主分类号: G06T3/40 分类号: G06T3/40;G06T7/50;G06T7/30
代理公司: 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 代理人: 王宇杨
地址: 100190 *** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 面向 序列 切片 扫描电镜 三维 影像 获取 系统 方法
【权利要求书】:

1.一种面向序列切片的扫描电镜三维影像获取系统,其特征在于,包括:

人机交互模块,用于确定感兴趣区域,并生成所述感兴趣区域的三维成像指令和配准指令;

控制模块,用于根据所述三维成像指令,生成所述控制指令;

接口模块,用于向扫描电镜发送控制指令,并接收所述扫描电镜的图像数据;其中,所述扫描电镜基于所述感兴趣区域获取所述图像数据,所述感兴趣区域由若干图像采集区域构成,相邻的所述图像采集区域的边缘处形成重叠采集区域;

存储模块,用于存储所述图像数据;

数据处理模块,用于获取所述存储模块的所述图像数据,并根据所述配准指令,对所述图像数据进行三维配准并组合,得到三维影像,以及,将配准后的所述三维影像发送给所述人机交互模块。

2.根据权利要求1所述的面向序列切片的扫描电镜三维影像获取系统,其特征在于,所述人机交互模块包括:

区域确定单元,用于确定所述感兴趣区域;

指令生成单元,用于根据所述感兴趣区域,生成所述感兴趣区域对应的所述三维成像指令和所述配准指令。

3.根据权利要求1所述的面向序列切片的扫描电镜三维影像获取系统,其特征在于,所述控制模块包括:

确定单元,用于根据所述三维成像指令以及所述扫描电镜的电镜参数,确定所述图像数据的成像参数;

控制单元,用于根据所述成像参数,生成所述控制指令。

4.根据权利要求1所述的面向序列切片的扫描电镜三维影像获取系统,其特征在于,所述数据处理模块包括:

获取单元,用于获取所述存储模块的所述图像数据;

二维拼接单元,用于根据所述配准指令,将若干所述图像数据拼接成显微图像;

三维配准单元,用于对拼接得到的若干所述显微图像进行配准并组合,得到所述三维影像。

5.一种基于权利要求1-4任一项所述的面向序列切片的扫描电镜三维影像获取系统所实现的面向序列切片的扫描电镜三维影像获取方法,其特征在于,包括以下步骤:

获取生物组织样品的序列切片,确定每个所述切片的所述感兴趣区域,并生成所述感兴趣区域的所述三维成像指令和所述配准指令;

根据所述三维成像指令,生成所述控制电镜的控制指令;

所述扫描电镜根据所述控制指令,获取所述切片对应的所述图像数据;

根据配准指令,对所述图像数据进行二维拼接,得到所述显微图像;

根据配准指令,对拼接得到的若干所述显微图像进行配准并按切片顺序进行组合,得到生物组织样品的所述三维影像。

6.根据权利要求5所述的面向序列切片的扫描电镜三维影像获取方法,其特征在于,所述根据所述三维成像指令,生成所述控制电镜的控制指令,具体包括以下步骤:

根据所述三维成像指令以及所述扫描电镜的电镜参数,确定所述图像数据的成像参数;

根据所述成像参数,生成所述控制指令。

7.根据权利要求5所述的面向序列切片的扫描电镜三维影像获取方法,其特征在于,所述扫描电镜根据所述控制指令,获取所述切片对应的所述图像数据,具体包括以下步骤:

所述扫描电镜根据所述控制指令,获取所述图像采集区域编号的顺序,按所述顺序依次获取所述感兴趣区域的所述图像数据;其中,所述感兴趣区域划分为若干所述图像采集区域,并在划分过程中对所述图像采集区域进行编号。

8.根据权利要求6所述的面向序列切片的扫描电镜三维影像获取方法,其特征在于,所述根据配准指令,对所述图像数据进行二维拼接,得到所述显微图像,具体包括以下步骤:

根据所述配准指令,获取所述顺序;

根据所述顺序,获取每一块所述图像采集区域相邻的所有所述图像采集区域;

根据所述重叠采集区域,对所述图像采集区域进行二维拼接,得到每一个所述切片在所述感兴趣区域的所述显微图像。

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