[发明专利]用于检测番茄叶霉病抗性的SNP位点组合及其应用在审
| 申请号： | 202111164336.8 | 申请日： | 2021-09-30 |
| 公开（公告）号： | CN113736908A | 公开（公告）日： | 2021-12-03 |
| 发明（设计）人： | 黄三文;吴坤;胡勇;吕亚清;赵婀姿 | 申请（专利权）人： | 中国农业科学院农业基因组研究所;中国农业科学院深圳农业基因组研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司： | 深圳市韦恩肯知识产权代理有限公司 44375 | 代理人： | 李华双 |
| 地址： | 518124 广*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 用于 检测 番茄 叶霉病 抗性 snp 组合 及其 应用 | ||
1.一种用于检测番茄叶霉病抗性的SNP位点组合，其特征在于，所述SNP位点组合包括位于番茄叶霉病抗性基因Cf-5内部及两侧的第一SNP位点组合和位于番茄叶霉病抗性基因Cf-9内部及两侧的第二SNP位点组合，所述第一SNP位点组合包括以下Cf5-SNP01位点～Cf5-SNP07位点中的一种或多种，所述第二SNP位点组合包括以下Cf9-SNP01位点～Cf9-SNP04位点中的一种或多种：
编号 基因 染色体 SNP物理位置 等位基因 Cf5-SNP01 Cf-5 Chr06 2162723 A或G Cf5-SNP02 Cf-5 Chr06 2161955 T或A Cf5-SNP03 Cf-5 Chr06 2161347 C或T Cf5-SNP04 Cf-5 Chr06 2164791 A或G Cf5-SNP05 Cf-5 Chr06 2163057 T或C Cf5-SNP06 Cf-5 Chr06 2162280 C或T Cf5-SNP07 Cf-5 Chr06 2161670 T或A Cf9-SNP01 Cf-9 Chr01 1126674 T或C Cf9-SNP02 Cf-9 Chr01 1127155 C或T Cf9-SNP03 Cf-9 Chr01 1125319 G或C Cf9-SNP04 Cf-9 Chr01 1125235 T或C
表中，基因序列及SNP物理位置信息对应于番茄(Heinz 1706)参考基因组SL2.50版本。
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