[发明专利]TaHDA9-B基因中的C2308T SNP位点在辅助筛选不同株高小麦中的应用

说明书

本发明公开了TaHDA9‑B基因中的C2308T SNP位点在辅助筛选不同株高小麦中的应用。检测待测小麦基于TaHDA9‑B基因的基因型为基因型I还是基因型II，基因型II的小麦的株高基因型I的小麦的株高；基因型I的小麦为基于C2308T SNP位点的基因型为CC纯合型的小麦；基因型II的小麦为基于C2308T SNP位点的基因型为TT纯合型的小麦；C2308T SNP位点为小麦基因组中SEQ ID NO:1自5’末端起的第2308位核苷酸。实验证明，通过检测待测小麦基于TaHDA9‑B基因的基因型可以筛选小麦株高性状。本发明在小麦育种中具有重要应用价值。

技术领域

本发明属于生物技术领域，尤其涉及TaHDA9-B基因中的C2308T SNP位点在辅助筛选不同株高小麦中的应用，C2308T SNP位点为小麦基因组中SEQ ID NO:1自5’末端起的第2308位核苷酸。

背景技术

小麦(Triticum aestivum L.)是我国最主要的粮食作物之一。提升小麦单产是满足粮食需求不断提高的重要方式，同时也是保证粮食安全的战略目标。降低小麦株高可以增加抗倒伏能力，进而小麦产量增加。因此株高性状对于实现小麦的高产、稳产极其重要。

目前，研究者已经定位了大量调控株高的QTL：Gao等利用周842B×中国春的重组自交系群体鉴定到位于染色体2A、4A、4B、4D和5A的5个株高QTL；Zhang等在染色体1D、2B、3A、3D、4A、4B、5A和6B鉴定到8个与株高相关QTL；Guo等基于芯片标记技术对215个小麦品种进行关联分析，关联到11个与株高相关的QTL位点，分别被定位3A、3B、5B、6A、6B和7B染色体上；Yu等利用包含有110株系ITMI的RIL群体为材料，对小麦株高进行定位，共检测到10个控制株高的QTL位点，分别被定位3B、5A、5B、6A和7D染色体上；Bai等利用双单倍体材料(Avalon x Cadenza)，对小麦株高性状进行定位，共5个QTLs被检测到，分别被定位在2D、4D、3A、3B和6A。尽管已经定位了大量的与小麦株高相关的QTL，但由于绝大多数QTL的表型贡献率较小，且在不同年际及环境间重复性差，所以这些QTL难以应用于小麦株高的遗传改良。

CAPS标记又称为PCR-RFLP(限制性片段长度多态性聚合酶链反应)，是一类以PCR为基础的共显性分子标记，揭示的是特异PCR片段的限制性长度变异信息，其基本原理是用PCR扩增目的DNA，扩增产物再用特异性内切酶消化切割成不同大小片段，直接在凝胶电泳上分辨。不同等位基因的限制性酶切位点分布不同，产生不同长度的DNA片段条带。优点是避免了RFLP分析中繁琐的转移、杂交步骤，又能保持RFLP分析的精确度。然而，SNP恰好位于限制性酶切位点的情况比较少，因此，提出了dCAPS标记，即在CAPS标记的基础上通过在扩增引物中引入错配碱基，结合SNP位点引入新的限制性内切酶作用位点，产生和CAPS标记类似的多态性。

发明内容

本发明的目的为如何筛选或辅助筛选不同株高的小麦。

本发明首先保护筛选或辅助筛选不同株高小麦的方法。

本发明所保护的筛选或辅助筛选不同株高小麦的方法，具体可为方法一，可包括如下步骤：检测待测小麦基于TaHDA9-B基因的基因型为基因型I还是基因型II，基因型II的小麦的株高基因型I的小麦的株高；

所述基因型I的小麦为基于C2308T SNP位点的基因型为CC纯合型的小麦；

所述基因型II的小麦为基于C2308T SNP位点的基因型为TT纯合型的小麦；

所述C2308T SNP位点为小麦基因组中SEQIDNO:1自5’末端起的第2308位核苷酸。

本发明所保护的筛选或辅助筛选不同株高小麦的方法，具体可为方法二，可依次包括如下步骤：