[发明专利]与丝瓜瓜长相关的SNP分子标记及其应用有效

专利信息
申请号: 202111195983.5 申请日: 2021-10-14
公开(公告)号: CN113969323B 公开(公告)日: 2022-08-02
发明(设计)人: 赵钢军;吴海滨;罗剑宁;龚浩;李俊星;郑晓明;刘小茜 申请(专利权)人: 广东省农业科学院蔬菜研究所
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12N15/11
代理公司: 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 代理人: 林德强
地址: 510640 广东省*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 丝瓜 相关 snp 分子 标记 及其 应用
【权利要求书】:

1.与丝瓜瓜长相关的SNP分子标记,所述SNP分子标记的序列如SEQ ID NO.1所示,SNP位点位于所述序列的第151位,其多态性为A/G。

2.用于扩增分型权利要求1所述的与丝瓜瓜长相关的SNP分子标记的引物组,所述引物组包括正向引物1、正向引物2和反向引物;所述正向引物1为GAGAACACATTACTTGAATATTAAGCAA;所述正向引物2为TGAGAACACATTACTTGAATATTAAGCAG;所述反向引物为TGTTGATGTATAGGTTAGGGTGGC。

3.一种试剂盒,包含权利要求2所述的引物组。

4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于:所述正向引物1和正向引物2的5’端还分别带有序列标签A和序列标签B,所述序列标签A和序列标签B的核苷酸序列互不相同并且与丝瓜基因组序列不同源。

5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于:

所述试剂盒还包含PCR预混液,所述PCR预混液含有荧光探针A、荧光探针B、淬灭探针A和淬灭探针B;

所述荧光探针A的核苷酸序列与序列标签A的核苷酸序列一致,荧光探针A的5’端连接荧光基团A;所述淬灭探针A的核苷酸序列与序列标签A的核苷酸序列反向互补,淬灭探针A的3’端连接淬灭基团;

所述荧光探针B的核苷酸序列与序列标签B的核苷酸序列一致,荧光探针B的5’端连接荧光基团B;所述淬灭探针B的核苷酸序列与序列标签B的核苷酸序列反向互补,淬灭探针B的3’端连接淬灭基团;

所述荧光基团A与荧光基团B互不相同。

6.检测分型权利要求1所述的与丝瓜瓜长相关的SNP分子标记的试剂在(1)~(6)中任一种中的应用;

(1)鉴定或辅助鉴定待测丝瓜的瓜长性状;

(2)制备鉴定或辅助鉴定待测丝瓜的瓜长性状的产品;

(3)选育果实为长瓜的丝瓜;

(4)制备选育果实为长瓜的丝瓜的产品;

(5)选育果实为短瓜的丝瓜;

(6)制备选育果实为短瓜的丝瓜的产品;

若待测丝瓜基因组中所述的与丝瓜瓜长相关的SNP分子标记的基因型为AA,则判断该待测丝瓜为短瓜;

若待测丝瓜基因组中所述的与丝瓜瓜长相关的SNP分子标记的基因型为AG或GG,则判断该待测丝瓜为长瓜。

7.(a1)~(a2)中任一项在(1)~(6)中任一种中的应用;

(a1)权利要求2所述的引物组;

(a2)权利要求3~5中任一项所述的试剂盒;

(1)鉴定或辅助鉴定待测丝瓜的瓜长性状;

(2)制备鉴定或辅助鉴定待测丝瓜的瓜长性状的产品;

(3)选育果实为长瓜的丝瓜;

(4)制备选育果实为长瓜的丝瓜的产品;

(5)选育果实为短瓜的丝瓜;

(6)制备选育果实为短瓜的丝瓜的产品;

若待测丝瓜基因组中所述的与丝瓜瓜长相关的SNP分子标记的基因型为AA,则判断该待测丝瓜为短瓜;

若待测丝瓜基因组中所述的与丝瓜瓜长相关的SNP分子标记的基因型为AG或GG,则判断该待测丝瓜为长瓜。

8.检测分型权利要求1所述的与丝瓜瓜长相关的SNP分子标记的试剂在(1)~(2)中任一种中的应用;

(1)鉴定或辅助鉴定待测丝瓜的果实为长瓜还是短瓜;

(2)制备鉴定或辅助鉴定待测丝瓜的果实为长瓜还是短瓜的产品;

若待测丝瓜基因组中所述的与丝瓜瓜长相关的SNP分子标记的基因型为AA,则判断该待测丝瓜为短瓜;

若待测丝瓜基因组中所述的与丝瓜瓜长相关的SNP分子标记的基因型为AG或GG,则判断该待测丝瓜为长瓜。

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