[发明专利]一种基于冻融循环提高DNA链置换反应速率的调控方法有效
申请号: | 202111203266.2 | 申请日: | 2021-10-15 |
公开(公告)号: | CN113862337B | 公开(公告)日: | 2023-09-19 |
发明(设计)人: | 裴昊;朱韵;李丽;熊谢微;曹梦瑶 | 申请(专利权)人: | 华东师范大学 |
主分类号: | C12Q1/6844 | 分类号: | C12Q1/6844 |
代理公司: | 上海德禾翰通律师事务所 31319 | 代理人: | 夏思秋 |
地址: | 200241 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 循环 提高 dna 置换反应 速率 调控 方法 | ||
1.一种基于冻融循环提高DNA链置换反应速率的调控方法,其特征在于,所述方法中,先通过液氮冷冻,为DNA链置换反应运行提供区室化结构;再解冻使得DNA和溶质含量的急剧下降,破坏活性和非生产性复合物之间的平衡;经多次的冷冻--解冻的冻融循环,允许DNA链置换反复重启,加速驱动反应的运行,实现DNA链置换反应速率的提高;
所述方法包括以下步骤:
(1)根据沃森-克里克碱基互补配对原则分别设计对应的核酸分子链A、I、C的序列;
所述核酸分子链I、C、A的序列分别如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3所示;
(2)将所述核酸分子链A、I、C分别溶解于pH=8的tris-HCl缓冲溶液中,分别得到含核酸分子链A的溶液、含核酸分子链I的溶液、含核酸分子链C的溶液,然后在4℃下储存备用;
(3)将所述步骤(2)得到的含核酸分子链A的溶液、含核酸分子链C链的溶液混合;经过PCR仪进行退火形成含底物链D的溶液;将含核酸分子链A的溶液、含核酸分子链C链的溶液按1:1的摩尔比例进行混合;
(4)在pH=8的tris-HCl缓冲溶液中将所述含底物链D的溶液与所述步骤(2)得到的含核酸分子链I的溶液混合;将所述含底物链D的溶液与所述含核酸分子链I的溶液按1:1的摩尔比例进行混合
(5)将所述步骤(4)得到的混合溶液置于液氮冷冻1min之后再37℃水浴5min解冻;
(6)重复1-9次所述步骤(5),经1-9次冻融循环,实现DNA链置换反应速率的提高。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法进一步包括以下步骤(7):
(7)用荧光光谱仪收集荧光信号,完成核酸分子链置换反应的监测。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(1)中利用Nupack软件设计核酸分子链序列。
4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(6)反复冻融循环加快DNA链置换反应速度。
5.如权利要求1所述的调控方法在用于核酸分子逻辑电路、神经网络的加速中的应用。
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