[发明专利]检测KRAS基因突变、ADAMTS1与BNC1甲基化的引物探针,试剂盒与方法在审
申请号: | 202111211496.3 | 申请日: | 2021-10-18 |
公开(公告)号: | CN113699242A | 公开(公告)日: | 2021-11-26 |
发明(设计)人: | 杨柳;童云广;蒋佳宏;唐正清;张叔祖;朱虹;任永丽;陈哲灵 | 申请(专利权)人: | 浙江省人民医院;杭州奥明医学检验实验室有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6858;C12Q1/6869;C12N15/11 |
代理公司: | 杭州裕阳联合专利代理有限公司 33289 | 代理人: | 王贞利 |
地址: | 310000 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 kras 基因突变 adamts1 bnc1 甲基化 引物 探针 试剂盒 方法 | ||
1.一种用于早期检测胰腺癌的多联合基因靶点,其特征在于,包括KRAS基因的第2号外显子的第12和13密码子的7种突变型,ADAMTS1的甲基化与BNC1的甲基化。
2.根据权利要求1所述的一种用于早期检测胰腺癌的多联合基因靶点,其特征在于,所述KRAS基因的第2号外显子的第12和13密码子的7种突变型包括Gly12Ser,Gly12Aeg,Gly12Cys,Gly12Asp,Gly12Ala,Gly12Val与Gly13Asp。
3.检测KRAS基因突变、ADAMTS1与BNC1甲基化的引物探针,其特征在于,所述引物探针包括针对检测权利要求1-2任一项所述的7种KRAS基因突变型的捕获探针组A,检测ADAMTS1甲基化的引物探针组B,检测BNC1甲基化的引物探针组C与检测ATCB基因的引物探针组D;
所述引物探针组B包括正向引物b,反向引物b和探针b;
所述引物探针组C包括正向引物c,反向引物c和探针c;
所述引物探针组D包括正向引物d,反向引物d和探针d;
所述探针b,探针c和探针d的5’端设有报告荧光基团,所述探针b,探针c和探针d的3’端设有淬灭荧光基团。
4.根据权利要求3所述的检测KRAS基因突变、ADAMTS1与BNC1甲基化的引物探针,其特征在于,所述正向引物b的核苷酸序列为SEQ ID No.1,SEQ ID No.3或SEQ ID No.5;所述反向引物b的核苷酸序列为SEQ ID No.2,SEQ ID No.4或SEQ ID No.6;所述探针b的核苷酸序列为SEQ ID No.13。
5.根据权利要求3所述的检测KRAS基因突变、ADAMTS1与BNC1甲基化的引物探针,其特征在于,所述正向引物c的核苷酸序列为SEQ ID No.7,SEQ ID No.9或SEQ ID No.11;所述反向引物c的核苷酸序列为SEQ ID No.8,SEQ ID No.10或SEQ ID No.12;所述探针c的核苷酸序列为SEQ ID No.14。
6.根据权利要求3所述的检测KRAS基因突变、ADAMTS1与BNC1甲基化的引物探针,其特征在于,所述正向引物d的核苷酸序列为SEQ ID No.19;所述反向引物d的核苷酸序列为SEQID No.20;所述探针d的核苷酸序列为SEQ ID No.15。
7.根据权利要求4或5或6所述的检测KRAS基因突变、ADAMTS1与BNC1甲基化的引物探针,其特征在于,报告荧光基团包括FAM,HEX,VIC,TET,CY3,CY5或ROX,淬灭荧光基团为BHQ1。
8.根据权利要求3所述的检测KRAS基因突变、ADAMTS1与BNC1甲基化的引物探针,其特征在于,捕获探针组A为SEQ ID No.16与SEQ ID No.17。
9.一种检测KRAS基因突变、ADAMTS1与BNC1甲基化的试剂盒,其特征在于,包括权利要求3-8任一项所述的引物探针。
10.一种KRAS基因突变、ADAMTS1与BNC1甲基化的检测方法,其特征在于,包括使用权利要求3-8任一项所述的引物探针或包括权利要求9所述的试剂盒;所述检测方法包括以下步骤:
1)提取生物样本中的游离DNA;
2)对步骤1)得到的部分游离DNA进行甲基化转化并纯化;
3)将步骤2)甲基化转化并纯化后的游离DNA与剩余未转化的游离DNA进行荧光定量PCR扩增,并得到结果;
其中,PCR的每个体系50μL,其中含1xPCR反应缓冲液、200-400μm dNTPs、2-7mM MgCl2与1-5U AmpliTaq DNA聚合酶;
ADAMTS1与BNC1基因区域靶点的正向引物与反向引物各250-550nM,ADAMTS1与BNC1基因区域靶点的探针各200-400nM,ACTB基因区域靶点的正向引物与反向引物150-300nM,ACTB基因区域靶点的探针50-150nM。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于浙江省人民医院;杭州奥明医学检验实验室有限公司,未经浙江省人民医院;杭州奥明医学检验实验室有限公司许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/202111211496.3/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。