[发明专利]检测KRAS基因突变、ADAMTS1与BNC1甲基化的引物探针,试剂盒与方法在审

专利信息
申请号: 202111211496.3 申请日: 2021-10-18
公开(公告)号: CN113699242A 公开(公告)日: 2021-11-26
发明(设计)人: 杨柳;童云广;蒋佳宏;唐正清;张叔祖;朱虹;任永丽;陈哲灵 申请(专利权)人: 浙江省人民医院;杭州奥明医学检验实验室有限公司
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/6858;C12Q1/6869;C12N15/11
代理公司: 杭州裕阳联合专利代理有限公司 33289 代理人: 王贞利
地址: 310000 浙*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 检测 kras 基因突变 adamts1 bnc1 甲基化 引物 探针 试剂盒 方法
【权利要求书】:

1.一种用于早期检测胰腺癌的多联合基因靶点,其特征在于,包括KRAS基因的第2号外显子的第12和13密码子的7种突变型,ADAMTS1的甲基化与BNC1的甲基化。

2.根据权利要求1所述的一种用于早期检测胰腺癌的多联合基因靶点,其特征在于,所述KRAS基因的第2号外显子的第12和13密码子的7种突变型包括Gly12Ser,Gly12Aeg,Gly12Cys,Gly12Asp,Gly12Ala,Gly12Val与Gly13Asp。

3.检测KRAS基因突变、ADAMTS1与BNC1甲基化的引物探针,其特征在于,所述引物探针包括针对检测权利要求1-2任一项所述的7种KRAS基因突变型的捕获探针组A,检测ADAMTS1甲基化的引物探针组B,检测BNC1甲基化的引物探针组C与检测ATCB基因的引物探针组D;

所述引物探针组B包括正向引物b,反向引物b和探针b;

所述引物探针组C包括正向引物c,反向引物c和探针c;

所述引物探针组D包括正向引物d,反向引物d和探针d;

所述探针b,探针c和探针d的5’端设有报告荧光基团,所述探针b,探针c和探针d的3’端设有淬灭荧光基团。

4.根据权利要求3所述的检测KRAS基因突变、ADAMTS1与BNC1甲基化的引物探针,其特征在于,所述正向引物b的核苷酸序列为SEQ ID No.1,SEQ ID No.3或SEQ ID No.5;所述反向引物b的核苷酸序列为SEQ ID No.2,SEQ ID No.4或SEQ ID No.6;所述探针b的核苷酸序列为SEQ ID No.13。

5.根据权利要求3所述的检测KRAS基因突变、ADAMTS1与BNC1甲基化的引物探针,其特征在于,所述正向引物c的核苷酸序列为SEQ ID No.7,SEQ ID No.9或SEQ ID No.11;所述反向引物c的核苷酸序列为SEQ ID No.8,SEQ ID No.10或SEQ ID No.12;所述探针c的核苷酸序列为SEQ ID No.14。

6.根据权利要求3所述的检测KRAS基因突变、ADAMTS1与BNC1甲基化的引物探针,其特征在于,所述正向引物d的核苷酸序列为SEQ ID No.19;所述反向引物d的核苷酸序列为SEQID No.20;所述探针d的核苷酸序列为SEQ ID No.15。

7.根据权利要求4或5或6所述的检测KRAS基因突变、ADAMTS1与BNC1甲基化的引物探针,其特征在于,报告荧光基团包括FAM,HEX,VIC,TET,CY3,CY5或ROX,淬灭荧光基团为BHQ1。

8.根据权利要求3所述的检测KRAS基因突变、ADAMTS1与BNC1甲基化的引物探针,其特征在于,捕获探针组A为SEQ ID No.16与SEQ ID No.17。

9.一种检测KRAS基因突变、ADAMTS1与BNC1甲基化的试剂盒,其特征在于,包括权利要求3-8任一项所述的引物探针。

10.一种KRAS基因突变、ADAMTS1与BNC1甲基化的检测方法,其特征在于,包括使用权利要求3-8任一项所述的引物探针或包括权利要求9所述的试剂盒;所述检测方法包括以下步骤:

1)提取生物样本中的游离DNA;

2)对步骤1)得到的部分游离DNA进行甲基化转化并纯化;

3)将步骤2)甲基化转化并纯化后的游离DNA与剩余未转化的游离DNA进行荧光定量PCR扩增,并得到结果;

其中,PCR的每个体系50μL,其中含1xPCR反应缓冲液、200-400μm dNTPs、2-7mM MgCl2与1-5U AmpliTaq DNA聚合酶;

ADAMTS1与BNC1基因区域靶点的正向引物与反向引物各250-550nM,ADAMTS1与BNC1基因区域靶点的探针各200-400nM,ACTB基因区域靶点的正向引物与反向引物150-300nM,ACTB基因区域靶点的探针50-150nM。

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