[发明专利]一种基于数据增强的电子病历命名实体识别方法在审

专利信息
申请号: 202111215692.8 申请日: 2021-10-19
公开(公告)号: CN113990421A 公开(公告)日: 2022-01-28
发明(设计)人: 马凯;李超凡 申请(专利权)人: 徐州医科大学
主分类号: G16H10/60 分类号: G16H10/60;G06F40/295;G06F40/242;G06F40/289;G06N3/04;G06N3/08
代理公司: 北京淮海知识产权代理事务所(普通合伙) 32205 代理人: 王波
地址: 221000 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 数据 增强 电子 病历 命名 实体 识别 方法
【权利要求书】:

1.一种基于数据增强的电子病历命名实体识别方法,其特征在于,包括以下步骤:

步骤1:获取原始电子病历文本语料,对文本进行预处理,形成原始语料库,对原始语料库进行中文文本分词,形成原始词表;对原始语料库进行切字处理,形成原始字典;

针对原始词表和原始字典,利用词向量工具训练100维向量表示,对于电子病历文本的同一个序列S,在原始词表中表示为Sword=(word1,word2,…,wordn),在原始字典中表示为Schar=(char1,char2,…,charm),对于chari在序列Sword所在的词语wordj或在wordj前后连续的词语中也出现,则chari的字向量ei表示为:

式中:表示chari所在序列Sword中对应词wordj的词向量;

表示chari所在序列Sword中对应词wordj的前面连续k个词均匀出现chari词向量;

表示chari所在序列Sword中对应词wordj的后面连续k个词均匀出现chari词向量;

步骤2:依据步骤1所获得的原始词表、字典以及字典对应的组合字向量E=(e1,e2,…,em)、电子病历文本的同一个序列S,依据BIOES标注策略对原始词典中的词语进行标注,即获得词语中每个字在词语内部位置的标签,以此对原始字典中的字进行编码:

eposition=one-hot(wordi),0≤i≤l;

式中:one-hot编码为50维,词语wordi中含有l个汉字;

步骤3:依据步骤1所获得的原始词表、字典,对于电子病历文本的同一个序列S,依据词性对Sword=(word1,word2,…,wordn)为每个词语标记词性,同时将词性赋值给词语的每个汉字,然后对Schar=(char1,char2,…,charm)每个字的词性进行编码:

eflag=one-hot(wordi),0≤i≤l;

式中:one-hot编码为50维,词语wordi中含有l个汉字;

步骤4:依据步骤1获得的原始字典,提取每个字的偏旁部首,形成字典的偏旁部首映射表,将偏旁部首映射表编码为50维向量,并依据字典中的每个字的偏旁部首进行赋值:

ecnradical=one-hot(Schar);

步骤5:依据步骤1所获得的原始字典,对于电子病历文本的同一个序列Schar=(char1,char2,…,charm),将汉语拼音字母表编码为50维向量,对电子病历文本的同一个序列S每个汉字所出现的拼音字母频数进行编码:

epinyin=one-hot(Schar);

步骤6:依据步骤1-5所述的原始字典和电子病历文本的同一个序列S,结合得到的字向量ei,字位置向量eposition,词性向量eflag,字偏旁部首向量ecnradical,字拼音向量epinyin,则以汉字、字位置、词性、偏旁部首和拼音组成的五元组,实现基于汉字特征的数据增强,命名实体识别模型的字嵌入特征向量矩阵W=(w1,w2,…,wn)表示为:

步骤7:依据步骤6的字嵌入特征向量矩阵W=(w1,w2,…,wn)作为BiLSTM-CRF模型的输入,使用BiLSTM神经网络进行文本特征提取,使用CRF进行解码和实体标签的预测,从而实现基于数据增强的电子病历命名实体识别方法。

2.根据权利要求1所述的一种基于数据增强的电子病历命名实体识别方法,其特征在于,所述步骤1中针对原始电子病历文本的预处理主要包括,去除文本停用字词、标点符号与切分句子。

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