[发明专利]一种识别肺腺癌肿瘤干细胞的基因标志物及其应用

说明书

本发明涉及一种识别肺腺癌肿瘤干细胞的基因标志物及其应用，属于生物医药技术领域。基因标志物选自基因RPS4X、FTH1、CYBA、POMP、SLC25A5、RPL35A、BST2、SEC61G、HMGB1、COMMD6、CLIC1、COX6B1、NDUFB4、TPI1、COX8A、SAP18、HMGN1和XIST。本发明基于单细胞转录组测序得到的肺腺癌肿瘤干细胞的标志物，可以准确地识别肺腺癌中的肺腺癌干细胞，并不限于细胞表面的干性基因，为进一步研究肺腺癌干细胞和针对肺腺癌干细胞的治疗提供了新的分子靶点。

技术领域

本发明涉及一种识别肺腺癌肿瘤干细胞的基因标志物及其应用，属于生物医药技术领域。

背景技术

肺癌的发病率及死亡率在所有肿瘤中的排名均处于前列，其中最主要的肺癌亚型是肺腺癌。目前虽然临床上针对肺腺癌的治疗手段层出不穷，但患者整体的生存率依然不佳，因此进一步提升目前肺腺癌治疗手段的有效性是十分有必要的。肺腺癌肿瘤干细胞是肺腺癌组织中一小群具有自我更新及分化潜能的细胞类型，在肺腺癌的增殖、转移、放化疗耐药中均起着至关重要的作用。进一步深入地研究肺腺癌干细胞对战胜肺腺癌有着重要的意义。然而在既往的研究中，研究者通常是通过流式的方法，即通过细胞表面的干性基因来定义细胞的干性，这种方法一方面可供选择的标记基因较少，另一方面操作较为繁琐。因此开发一种可以识别肺腺癌中肿瘤干细胞基因标志物就显得十分有必要。因此，仍可能存在着一个方便、准确，有更高敏感性、特异性和应用价值的基因组合可以应用于区分肺腺癌干细胞和普通肺腺癌细胞。

近年来单细胞转录组测序的出现使得研究人员能够在单个细胞层面检测细胞的表达情况。通过单细胞转录组测序可以在单个细胞的层面研究肺腺癌中的干细胞，从而得到用于识别肺腺癌干细胞的特定表达谱(即肺腺癌干细胞基因标志物组合)。这将有助于研究者更为准确地区分肺腺癌中的肿瘤干细胞。

发明内容

本发明的目的是为解决获得识别肺腺癌肿瘤干细胞的基因标志物及其应用的技术问题。

为达到解决上述问题的目的，本发明所采取的技术方案是提供一种识别肺腺癌肿瘤干细胞的基因标志物，所述基因标志物包括基因RPS4X、FTH1、CYBA、POMP、SLC25A5、RPL35A、BST2、SEC61G、HMGB1、COMMD6、CLIC1、COX6B1、NDUFB4、TPI1、COX8A、SAP18、HMGN1和XIST中的至少一种。

本发明提供一种识别肺腺癌肿瘤干细胞的基因标志物在制备检测肺腺癌肿瘤干细胞的诊断试剂盒中的应用。

本发明提供一种识别肺腺癌肿瘤干细胞的基因标志物在制备肺腺癌预后的诊断试剂盒中的应用。

本发明提供一种识别肺腺癌肿瘤干细胞的基因标志物在制备治疗肺腺癌的药物中的应用。

本发明提供一种识别肺腺癌肿瘤干细胞的基因标志物在非诊断方法和非治疗方法中的应用。

相比现有技术，本发明具有如下有益效果：

1.本发明基于单细胞转录组测序得到的肺腺癌肿瘤干细胞的标志物，可以准确地识别肺腺癌中的肺腺癌干细胞，并不限于细胞表面的干性基因，为进一步研究肺腺癌干细胞和针对肺腺癌干细胞的治疗提供了新的分子靶点。

2.本发明可基于机器学习的方法建立风险评估模型，具有可定量分析、准确性高、灵敏度和特异性好的优点。

附图说明

图1为肺腺癌的肿瘤干细胞及非肿瘤干细胞聚类结果图；

图2为RPS4X等18个基因在区分肺腺癌的肿瘤干细胞和非肿瘤干细胞的ROC曲线图；

其中，横坐标代表特异性，纵坐标代表敏感性；

图3为基于RPS4X等18个基因构建的风险评估模型的ROC曲线图；