[发明专利]CYP2C9突变体、其对应的核酸片段及应用有效
申请号: | 202111219681.7 | 申请日: | 2021-10-20 |
公开(公告)号: | CN113943717B | 公开(公告)日: | 2023-08-08 |
发明(设计)人: | 陈浩;戴大鹏;杨杰孚;蔡剑平;施海峰;巫华兰;种甲;吕游;周姗;赵芳玲 | 申请(专利权)人: | 北京医院 |
主分类号: | C12N9/02 | 分类号: | C12N9/02;C12N15/53;C12Q1/6883;C12N15/11 |
代理公司: | 北京信诺创成知识产权代理有限公司 11728 | 代理人: | 陈悦军;尹吉伟 |
地址: | 100730*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | cyp2c9 突变体 对应 核酸 片段 应用 | ||
本发明属于生物学领域,涉及一种CYP2C9突变体。本发明的突变体具有SEQ ID NO.1所示的序列,该突变体对药物的代谢活性低于野生型,对个体化用药具有指导意义。本发明还提供对应于该突变体的核酸片段及其应用。
技术领域
本发明属于生物学领域,涉及一种CYP2C9突变体。
背景技术
患者对药物治疗的反应存在较大的个体差异,只有约50%-75%的患者对药物治疗干预反应充分,而其他患者要么缺乏疗效,要么遭受不良反应事件。药物治疗结果可被多种因素影响,如环境因素(共同用药、饮食、吸烟等)、生理因素(性别、年龄、伴生疾病等)和遗传因素,其中遗传变异可解释约20-30%的不同治疗结局。根据临床药物基因组学实施联盟(CPIC)发布的指南,目前已有118种基因被认为具有药物遗传学活性,如HLA、CYP、VKORC1等。
细胞色素P450(Cytochrome P450 proteins,CYP)是人体内主要的药物代谢酶,它们能催化代谢多种内源、外源物质,通过结构中存在的亚铁离子传递电子氧化异源物,增强异源物的水溶性使其更易排出体外。CPIC发布的被认为具有药物遗传学活性的基因中,包含多个CYP的亚家族,如CYP2C9、CYP2C19、CYP2D6等,其中CYP2C9是CYP2亚家族中的重要成员,约占肝微粒体P450蛋白总量的20%,约有16%的临床药物经由CYP2C9代谢。已有研究表明,其编码基因CYP2C9的遗传多态性可显著改变CYP酶的药物代谢活性,进而影响药物的体内代谢情况,并导致可能的药物不良反应的发生,尤其是针对像华法林这类低治疗窗的药物时更为显著。
前期研究中,申请人针对中国汉族人群建立了国际范围内单一民族最大的CYP2C9等位基因遗传多态性数据库,共检测到14种已知等位基因,同时还发现了22种新的非同义突变,其中的21种被国际人类CYP等位基因命名委员会命名为新等位基因(CYP2C9*36-*56)。体外研究表明,这些新发现的变异体均会导致CYP2C9酶的药物代谢活性下降,提示携带这些等位基因的个体服用经由CYP2C9代谢的药物时,发生药物不良反应的概率可能会上升。然而这些仅是CYP2C9可能存在的变异体的一部分,前期针对大量人群的基因筛查研究表明,汉族人群中可能还存在许多未被发现的CYP2C9突变类型,因此,本领域需要发现并研究更多的CYP2C9突变体,为临床合理用药提供重要的科学依据。
发明内容
申请人对北京医院心内科513例京籍汉族住院患者开展了CYP2C9基因分型检测,发现了一种全新的CYP2C9突变类型,该突变体由单碱基突变引起。因此,本发明的目的是提供一种新的CYP2C9突变类型,并提供对应该突变体的核酸片段及其应用。
本发明的第一个方面是提供一种CYP2C9突变体,其氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示。与野生型CYP2C9的氨基酸序列相比,该突变体存在Q214H突变。
第二个方面,提供对应于所述CYP2C9突变体的核酸片段,所述核酸片段包含对应于SEQ ID NO.2的第501位的突变位点,且是SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列中的至少10个连续核苷酸,其中第501位的核苷酸是T;或者所述核酸片段包含对应于SEQ ID NO.3的第642位的突变位点,且是SEQ ID NO.3所示的核苷酸序列中的至少10个连续核苷酸,其中第642位的核苷酸是T;或者为上述核酸片段的互补序列片段。
第三个方面,提供用于检测和/或分析单碱基突变的引物,所述单碱基突变对应于SEQ ID NO.2的第501位或对应于SEQ ID NO.3的第642位,所述引物能够扩增所述单碱基突变。
第四个方面,提供用于检测和/或分析单碱基突变的试剂盒,所述试剂盒包括本发明的引物。
第五个方面,提供本发明的核酸片段在制备用作检测CYP2CP基因突变的检验标志物或制剂中的应用。
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