[发明专利]一种数据非依赖采集质谱数据格式的转化方法及应用

权利要求书

1.一种数据非依赖采集质谱数据格式的转换方法，其特征在于，包括以下步骤：

S1：读取质谱张量数据格式文件,其中所述质谱张量数据格式文件为由碎片离子所对应的前体离子索引、碎片离子质荷比和循环次数索引三个维度构成的三维张量数组；

S2：解析所述质谱张量数据格式文件得到质荷比数组和对应的强度数组；

S3：还原所述质荷比数组内的质荷比索引得到质荷比数值，得到质荷比-强度数组；

S4：填充标准格式文件的缺失信息，所述缺失信息和所述质荷比-强度数组组合得到标准格式文件。

2.根据权利要求1所述的数据非依赖采集质谱数据格式的转换方法，其特征在于，步骤S2包括步骤S21:根据所述三维张量数组的三个维度建立三层嵌套式循环，通过所述三层嵌套式循环共同作用解析得到按照扫描顺序排列的质荷比索引和对应强度数值，所述质荷比索引组成所述质荷比数组，所述强度数值组成所述强度数组。

3.根据权利要求1所述的数据非依赖采集质谱数据格式的转换方法，其特征在于，根据所述三维张量数组的三个维度建立三层嵌套式循环，外层循环按顺序从头至尾遍历循环次数索引；中层循环遍历前体离子索引，每个所述前体离子索引对应一个一维数组，所述一维数组包含该次扫描的质荷比索引和强度数值；内层循环从头到尾依次遍历所述质荷比索引，提取所有不为0的值，形成系列的质荷比索引和对应强度数值，所述质荷比索引组成所述质荷比数组，所述强度数值组成所述强度数组。

4.根据权利要求1所述的数据非依赖采集质谱数据格式的转换方法，其特征在于，步骤S3包括步骤S31：获取质荷比最小值和分箱大小，获取所述质荷比索引和所述分箱大小的乘积并加上所述质荷比最小值，得到所述质荷比数值。

5.根据权利要求1所述的数据非依赖采集质谱数据格式的转换方法，其特征在于，在步骤S4中，所述填充时间包括填充保留时间，前体离子的质荷比，前体离子的窗口设置列表。

6.根据权利要求1所述的数据非依赖采集质谱数据格式的转换方法，其特征在于，所述标准格式文件为基于XML的质谱格式文件。

7.根据权利要求1·所述的数据非依赖采集质谱数据格式的转换方法，其特征在于，所述质荷比索引的大小等于质荷比范围除以分箱大小。

8.根据权利要求1所述的数据非依赖采集质谱数据格式的转换方法，其特征在于，获取重要数据以及标准格式文件的格式要求，所述重要数据包括文件格式、是否zlib压缩数据以及数据精度，调用pyOpenMS库，创建MSExperiment对象和一系列MSSpectrum对象，将所述重要数据按序填入，按所述目标文件的格式要求设置生成文件的选项条件，最终将MSExperiment对象存入目标文件mzXML或mzML对象中得到所述标准格式文件。

9.一种数据非依赖采集质谱数据格式的转换装置，其特征在于，包括：

质谱张量数据读取单元，用于读取质谱张量数据格式文件,其中所述质谱张量数据格式文件为由碎片离子所对应的前体离子索引、碎片离子质荷比和循环次数索引三个维度构成的三维张量数组；

质谱张量数据解析单元，用于解析所述质谱张量数据格式文件得到质荷比数组和对应的强度数组；

质荷比数组处理单元，用于还原所述质荷比数组内的质荷比索引得到质荷比数值，得到质荷比-强度数组；

标准格式文件生成单元，用于填充标准格式文件的缺失信息，所述缺失信息和所述质荷比-强度数组组合得到标准格式文件。

10.一种电子装置，包括存储器和处理器，其特征在于，所述存储器中存储有计算机程序，所述处理器被设置为运行所述计算机程序以执行权利要求1到8任一所述的数据非依赖采集质谱数据格式的转换方法。