[发明专利]SARS-CoV-2易感基因组合及制备COVID-19易感人群筛查试剂盒中的应用

说明书

本发明属于医学检测领域，具体涉及SARS‑CoV‑2易感基因组合及制备COVID‑19易感人群筛查试剂盒中的应用，本发明所述的人类基因组合为：KIR2DL2和HLA‑C，具体为HLA‑C*01、HLA‑C*02、HLA‑C*03、HLA‑C*04、HLA‑C*05、HLA‑C*06、HLA‑C*07、HLA‑C*08、HLA‑C*09、HLA‑C*10、HLA‑C*12、HLA‑C*14、HLA‑C*15、HLA‑C*16、HLA‑C*17。目前世界范围对于SARS‑CoV‑2病毒感染的发生和易感人群并没有前期预测的相关研究。本发明提供的试剂盒在疾病易感人群有极大的应用价值。

技术领域

本发明属于医学检测领域，具体涉及SARS-CoV-2易感基因组合及制备COVID-19易感人群筛查试剂盒中的应用。

背景技术

世界卫生组织于2020年1月30日宣布2019年冠状病毒疾病(COVID-19)暴发为重要的公共卫生事件^[1]。COVID-19的病原为冠状病毒(CoVs)(SARS-CoV-2)属于冠状病毒科，其特征是具有正义的单链核糖核酸(RNA)。冠状病毒基因组高度易突变，导致基因漂移并逃避免疫识别的的影响^[2]。

在对SARS-CoV-2感染的研究中，发现了部分家族性发病的特点，主要是在有血缘关系的直系家人中传播提示疾病的发生和发展可能与个体的免疫遗传背景关系密切^[3]。在不同地区，COVID-19患者的HLA-I和HLA-II的分布频率和健康人群有明显差异。在一项沙特的COVID-19感染患者HLAI类基因分型的研究中，与对照组相比，感染患者中HLA-A*01、B*56和C*01的频率显着增加。此外，与感染患者相比，死亡患者中HLA-A*03和C*06的频率显着增加^[4]。在日本，使用二代测序对COVID-19患者HLA基因进行测序中，结果发现HLA-A*11，HLA-C*12和HLA-B*52被发现与COVID-19的严重程度显着相关^[5]。在意大利，Covid-19疾病显示出北部地区严重到南部地区轻微的特殊地理分布。意大利人群中HLA-C*07区域分布与Covid-19重叠，并且与COVID-19发病率和死亡率呈正相关^[6]。

自然杀伤细胞(NK细胞)是先天免疫反应中的重要淋巴细胞之一。它们可以在没有活性的情况下直接杀死靶细胞，并且不会损害健康的“自我”细胞^[7]。在人体内，NK细胞比较丰富，占血液和其他部位淋巴细胞的5％-20％，在抗病毒和抗肿瘤免疫中起关键作用^[8]。其中，人肺中NK细胞的比例约为15％，研究发现，在肺中NK细胞中，CD56dim NK细胞亚群的分布约占总数量的60％-80％。NK细胞^[9]。

编码KIR(杀伤细胞免疫球蛋白样受体)的基因是反映个体免疫遗传背景的一类重要基因。KIR受体是免疫球蛋白超家族的成员。它们在NK细胞和一些T淋巴细胞的表面表达^[10]。其主要配体为HLA-I分子，不同个体在KIR基因的数量和种类(激活与抑制)方面都不同^[11]。如基于HLA重链a1结构域中77和80位的多态性，KIR2DL1、KIR2DL2/3和KIR2DS2可以识别不同的HLA-C同种异型。例如，KIR2DL1可以结合HLA-Cw2，HLA-Cw4，HLA-Cw5和HLA-Cw6(称为C2)，而KIR2DL2、KIR2DL3和KIR2DS2则可与HLA-Cw1，HLA-Cw3，HLA-Cw7和HLA-Cw8(称为C1)结合^[12]。

目前并无直接证据证明携带特定组合基因就一定会被特定病毒感染，但从群体水平来看，携带特定基因人群发生特定疾病概率较高是得到较多认可的。本发明通过制备SARS-CoV-2易感基因筛查试剂盒检测部分个体免疫相关的遗传背景相关基因，可初步筛选判定COVID-19易感人群，可为COVID-19的预防提供基因层面筛查依据。