[发明专利]一种基于qRT-PCR检测方法快速测算桃品种需冷量的方法在审

专利信息
申请号: 202111261417.X 申请日: 2021-10-28
公开(公告)号: CN114231602A 公开(公告)日: 2022-03-25
发明(设计)人: 刘芸;姜新;罗瑞鸿;李一伟;关世凯;阮经宙 申请(专利权)人: 广西壮族自治区农业科学院
主分类号: C12Q1/6851 分类号: C12Q1/6851;C12N15/11;G16B5/00
代理公司: 南宁启创知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 45122 代理人: 谢美萱
地址: 530003 广西*** 国省代码: 广西;45
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 qrt pcr 检测 方法 快速 测算 品种 需冷量
【权利要求书】:

1.一种基于qRT-PCR检测方法快速测算桃品种需冷量的方法,其特征在于,包括以下步骤:

(一)PpDAM5基因相对表达量的检测:

(1)RNA提取:取已知需冷量的桃品种的落叶时期的未落叶片,提取RNA;

(2)反转录cDNA合成:将提取得的RNA反转录合成第一链cDNA;

(3)qRT-PCR检测:以合成的cDNA为模板,分别以内参基因Actin基因和目的基因PpDAM5基因的引物对作为引物进行qRT-PCR扩增,绘制扩增溶解曲线,获得内参基因Actin基因和目的基因PpDAM5基因的表达量,计算获得目的基因PpDAM5基因的相对表达量;

(二)PpDAM5基因相对表达量与需冷量的等级划分:

将步骤(一)中获得的已知需冷量的桃品种叶片的PpDAM5基因相对表达量与其需冷量建立需冷等级划分模型,如下:

(三)待测桃品种的快速测算:

将需冷量待测的桃树新品种进行步骤(一)PpDAM5基因相对表达量的检测,然后根据步骤(二)建立的需冷等级划分模型进行匹配,初步快速测算待测桃品种的需冷量。

2.根据权利要求1所述的基于qRT-PCR检测方法快速测算桃品种需冷量的方法,其特征在于,步骤(3)中,所述目的基因PpDAM5基因的上、下游引物分别为PpDAM5-F和PpDAM5-R;PpDAM5-F和PpDAM5-R引物序列分别为:

PpDAM5-F:5’-ATCTCCACCACCTGCAACAGT-3’;

PpDAM5-R:5’-CTTCTTAACGCCCCAGTTTGAG-3’。

3.根据权利要求1所述的基于qRT-PCR检测方法快速测算桃品种需冷量的方法,其特征在于,步骤(3)中,所述内参基因Actin基因的上、下游引物分别为Actin-F和Actin-R;Actin-F和Actin-R引物序列分别为:

Actin-F:5’-CAGATCATGTTTGAGACCTTCAATGT-3’;

Actin-R:5’-CATCACCAGAGTCCAGCACAAT-3’。

4.根据权利要求1所述的基于qRT-PCR检测方法快速测算桃品种需冷量的方法,其特征在于,步骤(3)中,所述qRT-PCR扩增的扩增体系以20μL计,包括以下组分:RNase-FreeddH2O 8μL,ChamQ Universal SYBR qPCR Master Mix 10μL,cDNA模板1μL,上、下游引物各0.5μL;

5.根据权利要求4所述的基于qRT-PCR检测方法快速测算桃品种需冷量的方法,其特征在于,步骤(3)中,所述qRT-PCR扩增的扩增条件包括以下步骤:95℃预变性3min,95℃变性15s,58℃退火15s,72℃延伸20s;所述预变性-变性-退火-延伸进行40个循环。

6.根据权利要求1所述的基于qRT-PCR检测方法快速测算桃品种需冷量的方法,其特征在于,步骤(2)中,所述反转录合成cDNA的反应体系以8μL计,包括以下组分:RNase-FreeddH2O 5μL,4×gDNA wiper Mix 2μL,RNA模板1μL;

7.根据权利要求6所述的基于qRT-PCR检测方法快速测算桃品种需冷量的方法,其特征在于,步骤(2)中,所述反转录合成cDNA的反应条件为:50℃15min,85℃5s。

8.根据权利要求1所述的基于qRT-PCR检测方法快速测算桃品种需冷量的方法,其特征在于,步骤(1)中,所述RNA的提取方法为采用RNAprep Pure多糖多酚植物总RNA提取试剂盒法提取RNA。

9.根据权利要求1所述的基于qRT-PCR检测方法快速测算桃品种需冷量的方法,其特征在于,步骤(1)中,所述已知需冷量的桃品种为秋蜜桃1号、鹰嘴蜜桃、霞脆、银河、金霞油蟠、紫金红2号、金霞早油蟠、霞晖5号和霞晖8号中的任一种。

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