[发明专利]小麦籽粒过氧化物酶活性关联位点qPOD-2A标记

说明书

本发明属于小麦分子育种领域，具体涉及一个小麦籽粒中过氧化物酶（POD）活性显著关联位点qPOD‑2A标记。本发明专利利用全基因关联分析，在小麦2A染色体短臂上鉴定出一个与过氧化物酶活性显著性关联的SNP位点qPOD‑2A，可解释表型变异达10.16%。其第36位碱基存在一个A/G的等位变异；当第36位碱基为A时，为高POD活性的基因型，当第36位碱基为G时，为低POD活性的基因型。充分挖掘与小麦过氧化物酶活性显著相关的优异位点及基因，对于解析小麦POD活性遗传分子机制、开发出相应的检测标记，培育优质小麦新品种，改善面制食品外观品质具有重要的理论意义和应用价值。

技术领域

本发明属于小麦分子育种领域，具体涉及一个小麦籽粒中过氧化物酶（POD）活性显著关联位点 qPOD-2A标记。

背景技术

随着粮食育种技术进步和育种理念发展，技术人员逐渐将小麦的育种目标从高产和抗病延展到小麦品质的改良。品质已经成为小麦生产和育种的重要目标，也是影响产业间竞争力的重要因素。小麦品质的决定因素中，面粉及其制品的色泽是小麦品质评价的重要指标之一，也是制约我国面粉及其制品品质的重要因素，目前颜色改良已成为小麦品质遗传改良的重要内容。

过氧化物酶（Peroxidase，POD）作为一种氧化活性物质，对于相关颜色表型往往具有较为直观的和明显影响。其在植物组织中以过氧化氢为底物催化各种还原剂的氧化反应：RH₂+H₂O₂→2H₂O+R。具体到小麦中，小麦籽粒中过氧化物酶（Peroxidase，POD）能催化阿魏酸等主要酚酸的氧化，并产生发色基团，这是面粉及面制品在加工储藏过程中往往存在褐变和漂白双重变化的主要原因之一。

尽管环境因素对POD活性有一定的影响，但POD活性在一定程度上仍然主要由遗传因素控制。例如，部分统计结果表明，普通小麦的POD活性显著高于硬粒小麦（P ＜0.05）,在不同品种的小麦籽粒中POD活性相差3-10倍。因此，从遗传途径深入研究POD活性调节的遗传分子机制，对于小麦新品种培育、以及最终面制食品外观品质的调节具有重要的科研理论和实际应用意义。

发明内容

在对小麦全基因组关联分析分析基础上，本申请目的在于提供系列与小麦籽粒中过氧化物酶POD活性相关的遗传标记，从而为小麦籽粒中POD活性调控的分子机理研究和最终小麦新品种培育奠定一定技术基础。

本申请所采取的技术方案详述如下。

小麦籽粒过氧化物酶活性关联位点qPOD-2A标记，该遗传标记名称AX-111134186，位于小麦2A染色体短臂上，其核苷酸序列为：

GCCGCTACCGAACATTGACGCCGTCAAGAACACGG[A/G]GCCAGAATGGTTGTTCGATGTGCTGGAACCCCTGT；

在该序列的第36位碱基存在一个A/G的等位基因的突变；当第36位碱基为A时，为高POD活性的基因型，碱基序列（71bp）如SEQ ID No.1所示，具体如下：

GCCGCTACCGAACATTGACGCCGTCAAGAACACGGAGCCAGAATGGTTGTTCGATGTGCTGGAACCCCTGT；

当第36位碱基为G时，为低POD活性的基因型，碱基序列（71bp）如SEQ ID No.2所示，具体如下：

GCCGCTACCGAACATTGACGCCGTCAAGAACACGGGGCCAGAATGGTTGTTCGATGTGCTGGAACCCCTGT。

针对小麦籽粒过氧化物酶活性关联位点qPOD-2A标记，依据该遗传标记的多态性（核苷酸多态性）所开发KASP标记，可有效用于小麦籽粒中POD活性的检测；

具体KASP标记引物序列设计为：