[发明专利]一种检测新型冠状病毒亚基因的荧光定量PCR方法及试剂盒有效
申请号: | 202111294163.1 | 申请日: | 2021-11-03 |
公开(公告)号: | CN113801966B | 公开(公告)日: | 2022-09-27 |
发明(设计)人: | 崔仑标;朱小娟;葛以跃;乔乔;吴涛;吴斌;赵康辰;朱立国;朱凤才 | 申请(专利权)人: | 江苏省疾病预防控制中心(江苏省公共卫生研究院) |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6851;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 北京预立生科知识产权代理有限公司 11736 | 代理人: | 朱萍;孟祥斌 |
地址: | 210009 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 新型 冠状病毒 基因 荧光 定量 pcr 方法 试剂盒 | ||
1.一种设计用于检测活性新型冠状病毒的组合物的方法,其特征在于,所述的方法包括:设计靶向Leader区和/或N基因区的探针、靶向Leader区的上游引物、靶向N基因区的下游引物,所述的上游引物包括在如SEQ ID NO.7所示序列的第四位引入突变的序列,所述的突变为将A突变为G,突变后的序列如SEQ ID NO.1所示,所述的下游引物包括如SEQ IDNO.2所示的序列,所述的探针包括如SEQ ID NO.3所示的序列。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的探针5’端以FAM荧光基团标记。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的探针3’端以BHQ1荧光基团标记。
4.一种用于检测活性新型冠状病毒的组合物,其特征在于,所述的组合物包括采用权利要求1-3任一项所述的方法设计的探针、上游引物、下游引物,其中,上游引物包括如SEQID NO.1所示的序列,下游引物包括如SEQ ID NO.2所示的序列,探针包括如SEQ ID NO.3所示的序列。
5.根据权利要求4所述的组合物,其特征在于,所述的探针5’端以FAM荧光基团标记。
6.根据权利要求4所述的组合物,其特征在于,所述的探针3’端以BHQ1荧光基团标记。
7.一种诊断新型冠状病毒的试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒包含权利要求4-6任一项所述的组合物。
8.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒包含至少一种反应混合物,其中所述至少一种反应混合物包含以下一种或多种:DNA聚合酶、脱氧核糖核苷酸、核糖核苷酸、阳性对照核酸、阴性对照核酸、对照引物、对照探针、内标核酸、内标核酸引物、内标核酸探针、KCl、MgCl2、乙酸钾、缓冲液、牛血清白蛋白、蔗糖、海藻糖、二甲基亚砜、甜菜碱、甲酰胺、甘油、聚乙二醇、非离子型去污剂、铵离子、乙二胺四乙酸。
9.根据权利要求8所述的试剂盒,其特征在于,所述的阳性对照核酸为包含新型冠状病毒N亚基因片段的重组质粒。
10.根据权利要求9所述的试剂盒,其特征在于,所述的重组质粒的载体为pMD19-T。
11.根据权利要求9所述的试剂盒,其特征在于,所述的新型冠状病毒N亚基因片段序列包括如SEQ ID NO.11所示的核苷酸序列。
12.根据权利要求8所述的试剂盒,其特征在于,所述的内标核酸为RNaseP。
13.根据权利要求12所述的试剂盒,其特征在于,所述的RNaseP的上游引物包括如SEQID NO.4所示的序列,RNaseP的下游引物包括如SEQ ID NO.5所示的序列,RNaseP的探针包括如SEQ ID NO.6所示的序列。
14.根据权利要求13所述的试剂盒,其特征在于,所述的RNaseP的探针的5’端以HEX荧光基团标记。
15.根据权利要求13所述的试剂盒,其特征在于,所述的RNaseP的探针的3’端以BHQ2荧光基团标记。
16.根据权利要求7-15任一项所述的试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒还包含说明书。
17.权利要求4-6任一项所述的组合物在制备诊断新型冠状病毒的试剂盒中的应用。
18.一种非诊断目的的检测活性新型冠状病毒的方法,其特征在于,所述的方法包括采用权利要求4-6任一项所述的组合物配制荧光定量PCR反应体系。
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