[发明专利]一种与苏姜猪背膘厚相关的SNP位点及其应用在审
| 申请号： | 202111298043.9 | 申请日： | 2021-11-04 |
| 公开（公告）号： | CN113881783A | 公开（公告）日： | 2022-01-04 |
| 发明（设计）人： | 徐盼;陶勇;周春宝;倪黎纲;朱淑斌;王利红;周根来;张君胜;张伟 | 申请（专利权）人： | 江苏农牧科技职业学院 |
| 主分类号： | C12Q1/6888 | 分类号： | C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司： | 南京禾祁专利代理事务所(普通合伙) 32462 | 代理人： | 黄天天 |
| 地址： | 225300*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 苏姜猪背膘厚 相关 snp 及其 应用 | ||
1.一种与苏姜猪背膘厚相关的SNP标记，其特征在于，所述SNP标记位于猪4号染色体上的SDR16C5基因的核苷酸序列上，所述SNP标记的位点为猪参考基因组11.1版本4号染色体第75587915位碱基（rs333532377）由G到C的位点突变。
2.用于检测权利要求1所述的SNP标记的引物对，其特征在于，包含引物SDR16C5 F和SDR16C5 R，其核苷酸序列如下：
正向引物SDR16C5 F：TACAGACATCCCACAAACCAC；
反向引物SDR16C5 R：GACTCAAGCCCCATCCAG。
3.一种检测苏姜猪背膘厚性状的方法，其特征在于，检测权利要求1所述的与苏姜猪背膘厚相关的SNP标记，判断所述的SNP标记在所在染色体的第75587915位碱基是G还是C，其中，GG基因型比CG基因型和CC基因型的背膘厚小。
4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，在检测时，采用权利要求2中所述的引物SDR16C5 F与SDR16C5 R利用PCR扩增包含猪参考基因组11.1版本4号染色体第75587915位碱基（rs333532377）GC突变的基因片段，所述基因片段如SEQ ID NO:2所示，然后采用测序技术进行基因分型。
5.权利要求1所述的SNP标记在苏姜猪背膘厚辅助选育中的应用，其特征在于，通过判断所述的SNP标记在所在染色体的第75587915位碱基是G还是C，其中，GG基因型比CG基因型和CC基因型的背膘厚小，选育GG基因型的个体，淘汰该位点的CG基因型和CC基因型个体。
6.权利要求2所述的引物对在苏姜猪背膘厚辅助选育中的应用，其特征在于，采用权利要求2中所述的引物SDR16C5 F与SDR16C5 R 利用PCR扩增包含猪参考基因组11.1版本4号染色体第75587915位碱基（rs333532377）GC突变的基因片段，所述基因片段如SEQ ID NO:2所示，然后采用测序技术进行基因分型，选育GG基因型的个体，淘汰该位点的CG基因型和CC基因型个体。
7.一种苏姜猪的遗传改良方法，其特征在于，包含如下步骤：提取苏姜猪的基因组DNA，对所述基因组DNA进行PCR扩增，得到PCR扩增产物，对扩增产物测序，得到测序结果，根据测序结果，确定权利要求1所述的SNP分子标记的基因型，选育GG基因型的个体，淘汰该位点的CG基因型和CC基因型个体，以逐代提高该位点的纯合基因型GG型的频率，从而降低苏姜猪的背膘厚。
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