[发明专利]预测肺腺癌患者对免疫疗法敏感性的生物标志物、应用和装置

权利要求书

1.预测肺腺癌患者对免疫检查点抑制剂疗法敏感性的生物标志物，其特征在于，包括突变型细胞分化调控基因，所述细胞分化调控基因选自ZFHX3和PTPRD基因中的至少一种，所述突变型是错义突变和/或无义突变。

2.根据权利要求1所述的生物标志物在制备预测肺腺癌患者对免疫检查点抑制剂疗法敏感性或肿瘤突变负荷程度的试剂或试剂盒中的应用。

3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述突变型的突变位点包括以下位点中的至少一个：

ZFHX3基因的p.E858*、p.L3091I、p.C1144F、p.D3665V、p.G2893R、p.P1255S、p.Q149*、p.L1315V、p.E510D、p.S2098L、p.T813S、p.A188S、p.S3601L、p.S3654L和p.G210C位点，以及PTPRD基因的p.G1213E、p.E698Q、p.F850L、p.R1674S、p.L984F、p.Y1191C、p.S306*、p.E21Q、p.P1525T、p.G1835A、p.S667L、p.P519T、p.T1100K、p.G1418W、p.G761C、p.D473V、p.A1413D、p.M1864K、p.E1639*、p.P1520T、p.E118K、p.S896L、p.P1839R、p.G1152V、p.T706K、p.Y1386*、p.T376R、p.T1738S和p.D473Y位点。

4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述突变型的突变位点包括以下共突变位点中的至少一组：

ZFHX3基因的p.D3665V位点和PTPRD基因的p.Y1191C位点、ZFHX3基因的p.G2893R位点和PTPRD基因的p.E21Q位点、ZFHX3基因的p.P1255S位点和PTPRD基因的p.P1525T位点、ZFHX3基因的p.E510D位点和PTPRD基因的p.A1413D位点、ZFHX3基因的p.S2098L位点和PTPRD基因的p.P1520T位点或ZFHX3基因的p.S3601L位点和PTPRD基因的p.T376R位点。

5.根据权利要求2～4任一项所述的应用，其特征在于，所述免疫检查点包括PD-1、PD-L1或CTLA4。

6.根据权利要求2～4任一项所述的应用，其特征在于，所述试剂或试剂盒用于核酸水平或蛋白水平的检测。

7.根据权利要求6所述的应用，所述试剂或试剂盒用于执行以下任一种方法：

聚合酶链反应、变性梯度凝胶电泳、核酸测序法、核酸分型芯片检测、变性高效液相色谱法、原位杂交、高分辨率熔解法以及氨基酸测序法。

8.根据权利要求2～4任一项所述的应用，其特征在于，所述试剂盒还包括样品的处理试剂，所述样品的处理试剂包括样品裂解试剂、样品纯化试剂以及样品核酸提取试剂中的至少一种。

9.一种用于预测肺腺癌患者对免疫检查点抑制剂疗法敏感性的装置，其特征在于，包括：

数据获取模块，用于获取受试者细胞分化调控基因的突变情况，所述细胞分化调控基因选自ZFHX3和PTPRD基因中的至少一种；

输出预测模块，用于根据所述受试者的所述突变情况中是否存在错义突变和/或无义突变的突变型，输出该受试者对免疫检查点抑制剂疗法敏感性的预测结果。

10.根据权利要求9所述的装置，其特征在于，所述根据所述受试者的所述突变情况中是否存在错义突变和/或无义突变的突变型，输出该受试者对免疫检查点抑制剂疗法敏感性的预测结果是，若ZFHX3和PTPRD基因中至少有一个基因存在错义突变或无义突变的目标位点，说明该受试者对免疫检查点抑制剂疗法敏感，否则，则说明该受试者对免疫检查点抑制剂疗法不敏感。