[发明专利]一种化学物质P-糖蛋白相互作用QSAR筛选方法在审
| 申请号： | 202111338187.2 | 申请日： | 2021-11-12 |
| 公开（公告）号： | CN114171111A | 公开（公告）日： | 2022-03-11 |
| 发明（设计）人： | 陈会明;李海山;崔颖;周丽丽 | 申请（专利权）人： | 中检科健（天津）检验检测有限责任公司 |
| 主分类号： | G16B15/20 | 分类号： | G16B15/20;G16B40/00 |
| 代理公司： | 天津合正知识产权代理有限公司 12229 | 代理人： | 邢月 |
| 地址： | 300300 天津市东丽*** | 国省代码： | 天津;12 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 化学物质 糖蛋白 相互作用 qsar 筛选 方法 | ||
1.一种化学物质P-糖蛋白相互作用QSAR筛选方法，其特征在于：包括如下步骤：
(1)采集数据；
(2)计算分子描述符：将分子描述符的值进行归一化，使每个分子描述符的权重平等；
(3)数据集分割：将得到的数据集分为训练集、预测集和外部验证集；
(4)初步变量筛选：对分子描述符根据分子描述符之间的相关系数进行筛选；
(5)PSO-GA-SVM：将MPSO与GA进行嵌套循环，并优化支持向量机的内核参数与最优特征自变量子集后即成。
2.根据权利要求1所述的化学物质P-糖蛋白相互作用QSAR筛选方法，其特征在于：所述的步骤(1)中的采集数据步骤的采集条件为选择作用类型明确且结构多样的黄酮类化合物。
3.根据权利要求1所述的化学物质P-糖蛋白相互作用QSAR筛选方法，其特征在于：步骤(2)中将分子描述符的值进行归一化之前，删除常量值；所述的常量值为恒值与零值，所述的恒值的占比大于等于90％；所述的步骤(2)中的归一化步骤的范围为0-1。
4.根据权利要求1所述的化学物质P-糖蛋白相互作用QSAR筛选方法，其特征在于：所述的步骤(4)中的相关系数大于0.95分子描述符。
5.根据权利要求1所述的化学物质P-糖蛋白相互作用QSAR筛选方法，其特征在于：所述的步骤(5)中的嵌套循环具体为：先运行GA优化内核参数，完成后运行MPSO优化分子描述符。
6.根据权利要求5所述的化学物质P-糖蛋白相互作用QSAR筛选方法，其特征在于：所述的优化分子描述符具体为：分子描述符之间的相关系数大于0.75。
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