[发明专利]与谷子株高性状紧密连锁的分子标记及其引物序列和应用

权利要求书

1.检测谷子基因组中Si5G271900C的多态性或基因型的物质在如下1）-4）中任一种中的应用：

1）鉴定或辅助鉴定谷子株高基因；

2）制备鉴定或辅助鉴定谷子株高的产品；

3）谷子育种；

4）制备谷子育种的产品；

所述Si5G271900C为谷子基因组中的一个SNP，其核苷酸种类为C或T，为序列表中序列1第234位核苷酸；

所述物质包括引物对，所述引物对为扩增包括所述Si5G271900C的谷子基因组DNA片段的PCR引物；

所述物质还包括限制性内切酶Dde I；

所述引物对由引物F和引物R组成；

所述引物F为核苷酸序列是SEQ ID No.2的单链DNA分子，

所述引物R为核苷酸序列是SEQ ID No. 3的单链DNA分子；

所述谷子为矮秆263A和高秆育成品种创29的杂交后代。

2.一种鉴定或辅助鉴定谷子株高的方法，其特征在于：所述方法包括检测待测谷子的基因型，根据所述待测谷子的基因型鉴定或辅助鉴定谷子的株高；所述基因型为谷子基因组中Si5G271900C的基因型；所述Si5G271900C为谷子基因组中的一个SNP，其核苷酸种类为C或T，为序列表中序列1第234位核苷酸；

根据所述待测谷子的基因型鉴定或辅助鉴定谷子的株高为：基因型为T/T的待测谷子株高高于或候选高于基因型为C/C和C/T的待测谷子的株高；基因型为C/T的待测谷子株高高于或候选高于基因型为C/C的待测谷子的株高；所述T/T是谷子基因组中所述Si5G271900C为T的纯合型；所述C/C是谷子基因组中所述Si5G271900C为C的纯合型；所述C/T是谷子基因组中所述Si5G271900C为T和C的杂合型；

所述检测待测谷子的基因型的方法包括A）或B）：

A）测序；

B）用权利要求1中的所述引物对对所述待测谷子基因组DNA进行PCR扩增，再用限制性内切酶Dde I酶切扩增产物，检测酶切产物：根据所述酶切产物确定所述待测谷子的基因型；

所述待测谷子为矮秆263A和高秆育成品种创29的杂交后代。

3.权利要求2所述的方法在谷子育种中的应用。

4.一种谷子育种的方法，包括如下步骤：选择Si5G271900C 的基因型为C/C的谷子作为亲本进行育种，所述Si5G271900C为谷子基因组中的一个SNP，其核苷酸种类为C或T，为序列表中序列1第234位核苷酸，所述C/C是谷子基因组中所述Si5G271900C为C的纯合型；

所述Si5G271900C 的基因型为C/C的谷子为矮秆263A为母本和高秆育成品种创29为父本的杂交F2代或其以上后代。