[发明专利]上游调控因子IbWRKY1及其在调控紫心甘薯IbMYB1表达中的应用有效
申请号: | 202111410514.0 | 申请日: | 2021-11-23 |
公开(公告)号: | CN114316005B | 公开(公告)日: | 2022-09-23 |
发明(设计)人: | 付丹文;惠亚可;李旭辉;高峰 | 申请(专利权)人: | 广东省科学院南繁种业研究所 |
主分类号: | C07K14/415 | 分类号: | C07K14/415;C12N15/29;C12N15/11;C12N15/82;A01H5/00;A01H6/20;C12Q1/6895 |
代理公司: | 广州科粤专利商标代理有限公司 44001 | 代理人: | 陈洁娣 |
地址: | 510316 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 上游 调控 因子 ibwrky1 及其 心甘 ibmyb1 表达 中的 应用 | ||
本发明公开了上游调控因子IbWRKY1及其在调控紫心甘薯IbMYB1表达中的应用。本发明以紫心甘薯品系“A5”为实验材料,克隆了IbMYB1的启动子序列,通过酵母单杂交文库筛选实验,获得了IbMYB1基因的上游调控因子IbWRKY1。运用酵母单杂交回转实验和双荧光素酶报告系统检测证实,IbMYB1启动子与上游调控因子IbWRKY1之间存在相互作用。通过酵母双杂交和双分子荧光互补实验,研究了调控因子之间的相互作用,结果显示,IbWRKY1与IbEBF2存在相互作用。本发明在理论上可以丰富和深化植物花色素苷生物合成分子调控的基础理论,还可望为提高紫心甘薯块根中色素含量的栽培措施提供新的思路和线索。
技术领域
本发明涉及植物遗传与变异的分子机制领域,具体涉及上游调控因子IbWRKY1及其 在调控紫心甘薯IbMYB1表达中的应用。
背景技术
甘薯是一种具有多种用途的根茎类农作物,尤其是在食品工业等方面的应用具有重大 意义。块根是甘薯的主要收获器官,在甘薯块根中含有大量的可溶性糖和蛋白质等营养成 分。甘薯块根可直接用作食品,也可用于酒精和淀粉生产以及动物饲料等各个方面。在一 些国家,甘薯被评价为健康的食品,因为它含有类胡萝卜素和花青素等具有抗氧化和其他 活性的功能成分。
花青素相关的结构基因的表达主要受到IbMYB1基因启动子的调控。已有学者研究发 现IbMYB1受到光、激素等环境因子的调控,但由于甘薯块根是深埋于地下的不见光部分。 IbMYB1启动子可能受到其它还未发现的基因对它的调控,从而参与花青素的合成途径。研 究发现,在心里美萝卜中,RsMYB1启动子上游存在7372bp的CACTA类型转座子,其在心里美萝卜肉色形成中发挥重要作用,同时高度甲基化的转座子扩散到RsMYB1启动子区域,使该基因的表达受到抑制,阻断花青苷的合成,形成白肉突变体。通过酵母双杂等实 验证实,MdMYB1与MdSIZ1相互作用,在愈伤和苹果果实中MdSIZ1通过SUMO化MYB1 调控花青苷的合成。由此可见,MYB1启动子通过与某些蛋白相互作用,调控花青素的合 成,因此寻找MYB1启动子在花青素合成途径中的互作蛋白具有重大意义。
WRKY基因家族是高等植物转录因子家族中一个大家族,在植物生理过程和环境适应 的转录调节中起重要作用。基于WRKY结构域的数量和锌指位点的具体特征,WRKY蛋白分为三类,第一类是含有两个WRKY结构域(分别在C段和N段),其锌指位点为C2H2; 第二类和第三类都只含有1个WRKY结构域,第二类的锌指位点为C2H2,第三类的锌指 位点为C2HC,同时第二类WRKY蛋白根据附加的短反结构位点的不同又分为五个亚类 (IIa、IIb、IIc、IId和IIe)。在植物中,转录因子WRKY家族是一个大的转录调控家族, 主要调控植物的生长发育和抗生物和非生物胁迫,过表达WRKY可使植物的抗逆性增强。 有报道发现WRKY参与了花色素苷合成的调控,WRKY40参与了苹果中花色素苷合成的调 控,黄酮类物质的合成途径是高度有组织的,关键的结构基因和大量的转录因子一起参与 了其过程。到目前为止已有至少6类主要的转录因子参与其中,分别是MYB、bHLH、WD40、 WRKY、Zinc finger和MADS蛋白。
发明内容
本发明要解决的技术问题在于筛选一种促进紫心甘薯IbMYB1表达的上游调控因子。
为了解决上述技术问题,本发明首先用Trizol法从甘薯块根提取RNA,用SMART技术逆转录合成双链的cDNA,构建紫心甘薯酵母单杂交cDNA文库。
进一步的,以紫心甘薯块根DNA为模板,用TaKaRa高保真酶Max DNAPolymerase扩增两端带有不同酶切位点末端的IbMYB1的启动子DNA片段,并将启动子IbMYB1构建到pAbAi载体中,扩增IbMYB1的启动子DNA片段的PCR引物对的具体序 列如下所示:
PIbMYB1-F:5'-TATTGCTCTCAATGTGCAAGAATCA-3'和
PIbMYB1-R:5'-TTTGATACGCATACCTTATGCCTAA-3'。
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