[发明专利]基于在体荧光信号的动物脑机接口实现方法及系统在审

专利信息
申请号: 202111447778.3 申请日: 2021-11-30
公开(公告)号: CN114356074A 公开(公告)日: 2022-04-15
发明(设计)人: 李卫东;杨翔宇;赵冰蕾;兰兆辉;陈志堂;汪紫滢;匡奕方;张旭;曾苏华 申请(专利权)人: 上海交通大学
主分类号: G06F3/01 分类号: G06F3/01;G06V10/77;G06V10/764;G06V10/44;G06V10/62;G06V20/69;G06K9/62
代理公司: 上海汉声知识产权代理有限公司 31236 代理人: 胡晶
地址: 200240 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 基于 荧光 信号 动物 接口 实现 方法 系统
【权利要求书】:

1.一种基于在体荧光信号的动物脑机接口实现方法,其特征在于,包括:

步骤S1:通过在大脑皮层或深部核团,注射钙离子指示剂或者指示蛋白在体病毒,使指示剂或者指示蛋白在胞内表达;

步骤S2:在指示媒介进入细胞后,在实验动物目标脑区植入脑部接口,通过在体微型荧光显微镜进行记录,记录结果经过信号采集主机,传输至信号处理主机;

步骤S3:数据结果经过传入后,进入解码算法进行模式规律识别,并经指令输出接口输出至控制端;

步骤S4:控制端接收装置接收信号后,对信号再编码最终实现对外部设备进行编码控制,形成脑机交互。

2.根据权利要求1所述的基于在体荧光信号的动物脑机接口实现方法,其特征在于,所述指示剂中荧光指示信号表达后,影像数据经采集端传入信号处理端进行信号处理,具体包括:实验动物大脑活动荧光原始信号经过采集设备采集后,传输至信号处理主机进行在线处理;原始数据需要经过算法进行神经元活动提取和识别,主要包括降噪校正和细胞标记。

3.根据权利要求2所述的基于在体荧光信号的动物脑机接口实现方法,其特征在于,所述降噪校正是降低运动导致的信号噪音干扰,并对相同神经元不同时间点的位置进行实时校正,通过在原始图像帧上应用异性扩散去噪操作实现;

对于每一帧图像,I∈RHxW,对于给定的扩散时间τ,演化遵循等式:

其中,div是散度算子,和Δ分别是梯度和拉普拉斯算子,C是取决于像素和τ的扩散系数矩阵;

I表示当前帧;RHxW表示帧集合;H表示帧画面高度;W表示帧画面宽度;

随后,在不同帧之间使用KTL跟踪器来估计两个相邻帧之间潜在角状特征的位移;基于KTL跟踪器配准后,使用diffeomorphic Log-Demons进行进一步单位配准;

最后采集到的影像数据将是运动噪音最小化,进而进行后续分析处理。

4.根据权利要求3所述的基于在体荧光信号的动物脑机接口实现方法,其特征在于,所述细胞标记包括:经过图像平滑处理后,需要对潜在的细胞轮廓影像进行细胞标记:

首先,随机选择一部分帧:

其中,a是随机轮廓集的帧编号;s表示轮廓投影;T表示最大帧编号;

然后计算所选帧的最大投影图:

并检测该图上所有局部最大点为Sα,多次重复上述过程,其中任意两个自己不包含相同的帧;

最终采集全部最大投影图的Sα和有完整轮廓数据集计算最大投影图S的整合,作为最终的神经元轮廓种子集合。

5.根据权利要求4所述的基于在体荧光信号的动物脑机接口实现方法,其特征在于,获得神经元轮廓之后,系统将对相应神经元进行荧光活动监测和模式学习和分类,具体地:

首先,需要对影像数据的荧光亮度归一化,用目标细胞轮廓的平均亮度Ft减去平局的背景荧光亮度F0再除以除以背景荧光亮度值F0,计算公式如下,其中ΔFt/F0简写为ΔF/F:

其次,还需要利用指数加权移动平均方法对记录到的钙信号进行去噪平滑;

再次,在获得平滑后的荧光强度变化数值后,在线侦测荧光活动事件;

最后,同步采集实验动物行为,并对动物行为和实时荧光成像结果进行配对,进行模式学习,并基于PCA和SVM算法进行特征提取和模式分类,对存在的荧光活动模式进行分类学习;

在经过模式学习和分类后,根据分类模式对输出指令进行对应编码,执行工作时在线对荧光活动模式进行判断,并输出对应指令,控制外部设备。

6.根据权利要求4所述的基于在体荧光信号的动物脑机接口实现方法,其特征在于,获得神经元轮廓之后,选用整体荧光观察方法,对核团活性进行指征,获得神经元轮廓后,计算整幅帧图像的平均灰度值,其步骤在于统计整幅图像的所有像素点,累加求取所有像素点的灰度值总和,平均灰度值为灰度值总和与像素点个数之商。

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