[发明专利]检测VHL基因c.-195GA位点突变的方法、引物和试剂盒在审

专利信息
申请号: 202111451877.9 申请日: 2021-12-01
公开(公告)号: CN113913529A 公开(公告)日: 2022-01-11
发明(设计)人: 王淑一;牛林梅 申请(专利权)人: 济南艾迪康医学检验中心有限公司
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/6869;C12N15/11
代理公司: 浙江杭州金通专利事务所有限公司 33100 代理人: 黄素萍
地址: 250031 山*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 检测 vhl 基因 195 ga 突变 方法 引物 试剂盒
【说明书】:

发明公开了检测VHL基因c.‑195GA位点碱基突变的方法、引物和试剂盒,采用Touch‑down PCR扩增技术和Sanger测序技术,可用于快速检测患者体内VHL基因c.‑195GA位点突变情况。利用本发明的试剂盒进行检测的结果准确,对希佩尔‑林道(von Hippel‑Lindau,VHL)综合征有辅助诊断价值。

技术领域

本发明属生命科学和生物技术领域,特别涉及检测VHL基因c.-195G>A位点突变的试剂盒,采用Touch-down PCR结合Sanger测序技术,可用于快速检测患者体内VHL基因c.-195G>A位点的突变情况。

背景技术

希佩尔-林道(von Hippel-Lindau,VHL)综合征是一种常染色体显性遗传的家族性肿瘤综合征,发生率约为1/36000,以视网膜、神经系统血管母细胞瘤,肾细胞癌,肾上腺嗜铬细胞瘤等为特征,中枢神经系统血管母细胞瘤和肾细胞癌是最常见的死亡原因。根据VHL综合征患嗜铬细胞瘤的风险,临床上可分为两大类型:I型(不患嗜铬细胞瘤)和Ⅱ型(患嗜铬细胞瘤)。Ⅱ型根据患者患肾透明细胞癌的危险性高低分为三类亚型:ⅡA(低危)、ⅡB(高危)以及ⅡC型(仅表现为嗜铬细胞瘤)。临床上VHL综合征以I型最为多见,其次为ⅡA型。

VHL综合征发病机制至今还不是完全清楚,其中研究比较多的是低氧诱导因子-1(HIF-1)通路。VHL基因是一种抑癌基因,位于常染色体3p25-26区域,正常情况下,VHL蛋白可参与血管形成、细胞周期的调控并参与细胞外纤维连接素基质的形成或装配等,而VHL基因发生突变后导致其蛋白质结构发生改变,不能识别HIF-α,造成HIF-α无法降解,HIF-1转录激活靶基因大量表达,如TGFα、VEGF、PDGFβ、NF-κB等,从而引起细胞生长和微血管形成,加速血管母细胞瘤、肾细胞癌及与VHL病有关的其他肿瘤的生长。

VHL综合征的特征基因为VHL,研究显示所有VHL综合征患者都存在胚系VHL等位基因的异常,因此确诊VHL综合征需检测到VHL基因的异常。VHL基因中常发生种系突变的3个区域分别是:75-82号密码子、157-189号密码子、外显子2与3之间的剪切位点。其中基因突变多发生在密码子65、76、78和98,剪切突变则多发生在密码子155、158、161、162和167。临床两大类型间的VHL综合征,其VHL基因突变存在有明显的不同,I型主要表现为VHL基因的缺失、无义突变及移码突变,而Ⅱ型主要表现为VHL基因的错义突变。

由于VLH综合征受累器官多样性,且可同时或先后发病,间隔时间可长达10年以上,因此临床医生对诊断该疾病存在较大困难。而VHL基因检测是准确有效的诊断方法,特别对无症状的VHL病患者可以早期发现、早期治疗,减缓疾病进程,提高治疗效率。

发明内容

本发明的目的是提供一个检测VHL基因c.-195G>A位点突变的试剂盒,采用Touch-down PCR结合Sanger测序技术,可用于快速检测患者体内VHL基因c.-195G>A位点的突变情况。所述检测VHL基因c.-195G>A位点突变的试剂盒,包括:扩增VHL基因c.-195G>A位点的引物,其碱基序列为:

VHL-F:TGTAAAACGACGGCCAGTTTATAGTGGAAATACAGTAACGAGT

VHL-R:AACAGCTATGACCATGCGTGCTATCGTCCCTGCT。

进一步地,还包括测序引物,其碱基序列为:

M13 F:TGTAAAACGACGGCCAGT

M13 R:AACAGCTATGACCATG。

本发明还提供了检测VHL基因c.-195G>A位点突变情况的方法,包括以下步骤:

(1)抽提外周血中的基因组DNA;

(2)用PCR扩增步骤1中提取的DNA;

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