[发明专利]一种BPPV眼震信号的标注方法在审
申请号: | 202111455667.7 | 申请日: | 2021-12-01 |
公开(公告)号: | CN114091621A | 公开(公告)日: | 2022-02-25 |
发明(设计)人: | 时海波 | 申请(专利权)人: | 上海市第六人民医院 |
主分类号: | G06K9/62 | 分类号: | G06K9/62;G06N3/04;G06N3/08 |
代理公司: | 上海科政专利代理事务所(普通合伙) 31463 | 代理人: | 杨军 |
地址: | 200233 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 bppv 信号 标注 方法 | ||
本发明涉及一种BPPV眼震信号的标注方法,包括以下步骤:专家依据临床诊断经验,对部分挑选的高质量视频样本进行打标签;根据专家已打标签的数据,采用数据增强、正样本扩充等数据处理方案,将样本量进行扩充获得充足的样本数量,训练一个基础的深度学习模型,作为Teacher Model;将未标注数据作为测试集,使用Teacher Model对未标注数据进行预测,给出对应的伪标签效果;对于伪标签显示阴性、低置信度阳性的样本、独立存在的阳性样本,选择舍弃;对于连续的阳性样本,其中高置信度的样本标注为阳性,作为新的训练样本;本发明利用有限的标注数据集训练深度学习模型,并对新的病患样本进行自动标注,降低标注成本。
[技术领域]
本发明涉及医疗领域数据建模,具体地说是一种BPPV眼震信号的标注方法。
[背景技术]
在对真实的视频数据进行建模时,对于有监督学习来说,需要一定量的标注数据。然而在医疗领域,标注样本往往需要专业的医生参与,并且对标注的准确度要求极高;同时,因为隐私、法律等相关因素,病人的真实数据往往无法从外部获得,这就导致医院获得带标签的可训练样本有非常高的成本。
深度学习模型训练需要大量的标注数据,而这一点在医疗领域的成本是非常高的。比如在论文《Developing a Diagnostic Decision Support System for BenignParoxysmal Positional Vertigo Using a Deep-Learning Model》提出的深度学习模型中,需要有7万名患者的带标签视频数据。而在为一家三甲医院建模时,可供使用的已标注视频样本也不足200个,成为深度学习模型训练的最大阻碍。且对于非专业数据机构来说,获得标注样本的成本是非常高的。
此外,在详细研究了BPPV病症病因和视频样本后,得出以下结论:(1)正样本(存在眼震)的样本数量远远小于负样本;(2)眼震信号为瞳孔规律性地快慢相运动,瞳孔轨迹的时间序列上信号非常明确;(3)正样本的标注成本高于负样本。基于以上结论,本发明认为对于高准确率的一维卷积神经网络模型,该模型对于新的未标注样本的预测评分可以作为正样本标注的依据。
[发明内容]
本发明的目的就是要解决上述的不足而提供一种BPPV眼震信号的标注方法,能够利用有限的标注数据集训练深度学习模型,并对新的病患样本进行自动标注,降低标注成本。
为实现上述目的设计一种BPPV眼震信号的标注方法,包括以下步骤:1)对少量样本进行专家标注:由医院的专家依据临床诊断经验,对部分挑选的高质量视频样本进行打标签;2)训练深度学习模型:根据专家已打标签的数据,采用数据增强、正样本扩充等数据处理方案,将样本量进行扩充获得充足的样本数量,训练一个基础的深度学习模型,作为Teacher Model教师模型;3)预测未标注样本:将未标注数据作为测试集,使用步骤2)中的Teacher Model教师模型对未标注数据进行预测,给出对应的伪标签效果;4)伪标签筛选:对于伪标签显示阴性、低置信度阳性即0.95的样本,选择舍弃;对于独立存在的阳性样本,选择舍弃;对于连续的阳性样本,其中高置信度即0.95的样本标注为阳性,作为新的训练样本。
进一步地,步骤4)之后还包括更新模型的步骤:将步骤4)获得的阳性样本与步骤2)训练集数据合并,进行数据增强和正负样本再平衡,并划分新的训练集和验证集,然后使用新数据集训练新的模型,重复迭代直到损失函数收敛或不再提升为止。
进一步地,步骤2)中,对样本量进行扩充包括但不限于将数据翻转、反转、加噪声,以及SMOTE样本构造算法。
进一步地,步骤3)中,当新样本需要进行眼震信号预测时,使用模型在预测阶段将眼震曲线滚动切分为长度400帧的子样本,并使用模型对每个子样本进行预测。
进一步地,步骤3)中,将子样本分为多个子样本片段,每个子样本片段对应的预测伪标签值用1和0表示,其中,1代表该子样本片段存在眼震,0代表该子样本片段未检测出眼震。
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