[发明专利]一种石蜡切片宏基因组提取试剂盒及提取方法有效
申请号: | 202111466880.8 | 申请日: | 2021-12-03 |
公开(公告)号: | CN114107284B | 公开(公告)日: | 2023-09-05 |
发明(设计)人: | 徐君南;赵毅;范星菊;于丹 | 申请(专利权)人: | 辽宁康惠生物科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12Q1/6806;C12R1/32 |
代理公司: | 大连星海专利事务所有限公司 21208 | 代理人: | 杨翠翠 |
地址: | 110016 辽*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 石蜡 切片 宏基 提取 试剂盒 方法 | ||
1.一种石蜡切片宏基因组提取试剂盒,该试剂盒中包括组织裂解液和细胞裂解液,其特征在于:
所述组织裂解液Buffer ATL组分为PMSF 0.1-1mol/L、Aprotinin 0.005-0.2umol/L、硫脲1-10 mol/L、DTT 0.1-1mol/L、NP-40 裂解液1%-5%、Triton X-100 0.5%-1.5%、pharmalyte 1%-5%、CHAPS 1%-10%、Tris 0.01-0.08mol/L、EDTA 0.1-1mol/L;
所述细胞裂解液Buffer AL组分为硫脲1-10 mol/L、脲1-10 mol/L、DTT 0.1-1mol/L、CHAPS 1%-10%、Tris 0.01-0.08mol/L;
所述试剂盒中还包括洗涤液Ⅰ、洗涤液Ⅱ和Buffer AE;
洗涤液I的组分为1-10 mmol/L Tris-HCl、0.1-1mol/L NaCl、10-50%C2H5OH、0.5-2mol/L CH5N3∙HCl ,pH为6-7 ;
洗涤液II的组分为0.5-2.5 nmol/L NaAC、70-85% C2H5OH,pH为6-7;
Buffer AE为 9.5-10.5 mmol/L Tris-HCl、0.8-1.2mmol/L EDTA。
2.根据权利要求1所述的一种石蜡切片宏基因组提取试剂盒提取宏基因组的方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1去除石蜡:向装有组织切片的EP管中加入二甲苯,振荡混匀,室温离心16000 g,弃上清;加入无水乙醇,室温离心16000 g,弃上清;重复上述步骤1次后,打开EP管盖,37 ℃孵育,直至残余乙醇全部挥发;
S2样本组织破碎:在已脱蜡的组织块切片管内加入组织裂解液 Buffer ATL,转移到研磨管内进行研磨;研磨后管中液体转移到的离心管中;所述研磨管内有3颗3 mm氧化锆珠和5颗1 mm 氧化锆珠,研磨仪机器设置频率为50 Hz,研磨时间40 -60s;
S3样本DNA提取:向离心管内加入提前预热的蛋白酶K,充分混匀,56 ℃水浴1-2h,每隔15 min颠倒混匀一次;90 ℃水浴1 -2h,短暂离心,迅速加入细胞裂解液 Buffer AL和无水乙醇,充分混匀,离心;所述蛋白酶K浓度为10-40 g/L;
S4样本DNA吸附:转移混合物于QIAamp层析柱中,盖上盖子,过柱离心;
S5样本DNA洗涤:打开QIAamp层析柱,加入洗涤液I,盖上盖子,离心洗涤;将QIAamp层析柱放入一个干净的收集管中,加入洗涤液II,盖上盖子,离心洗涤;将QIAamp层析柱取出放入另一个干净的收集管中,离心,生物安全柜中静置使膜完全干燥;洗涤液I的组分为1-10mmol/L Tris-HCl、0.1-1mol/L NaCl、10-50%C2H5OH、0.5-2 mol/L CH5N3∙HCl ,pH为6-7 ;洗涤液II的组分为0.5-2.5 nmol/L NaAC、70-85% C2H5OH,pH为6-7;
S6样本DNA洗脱:将QIAamp层析柱放入新的EP管中,打开柱子,加入Buffer AE,室温盖上盖子静置5-10 min,20 ℃ 16000 rpm离心1 min,洗脱DNA,于-20℃保存;Buffer AE为9.5-10.5 mmol/L Tris-HCl、0.8-1.2mmol/L EDTA。
3.根据权利要求2所述的一种提取石蜡组织切片的试剂盒提取基因的方法,其特征在于:步骤S3中90℃孵育前若有沉淀,进行10000 g,3 min进行离心,留上清90 ℃水浴1 h,丢弃沉淀。
4.根据权利要求1所述的一种石蜡切片宏基因组提取试剂盒的应用,其特征在于:用于石蜡切片病原微生物宏基因组的提取。
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