[发明专利]特异性结合环丙沙星的核酸适配体及其用途有效

专利信息
申请号: 202111472087.9 申请日: 2021-12-03
公开(公告)号: CN114032243B 公开(公告)日: 2023-09-05
发明(设计)人: 裴仁军;方晓娜 申请(专利权)人: 中国科学院苏州纳米技术与纳米仿生研究所
主分类号: C12N15/115 分类号: C12N15/115;G01N33/53
代理公司: 南京利丰知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 32256 代理人: 王茹
地址: 215123 江苏省苏州市*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 特异性 结合 环丙沙星 核酸 适配体 及其 用途
【说明书】:

发明公开了一种特异性结合环丙沙星的核酸适配体及其用途。所述特异性结合环丙沙星的核酸适配体具有如SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列,或者与SEQ ID NO:1的全长序列60%以上相同并且能够特异性结合环丙沙星的序列,或者,由SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列衍生的能够特异性结合环丙沙星的核苷酸序列。本发明还公开了一类核酸适配体的缀合物和核酸适配体的衍生物。本发明所提供的核酸适配体、其缀合物及其衍生物能够特异性结合环丙沙星,该核酸适配体具有高度特异性,且具有分子量小、化学性质稳定、易于保存和标记等优点,可以用于环丙沙星的检测。

技术领域

本发明涉及一种核酸适配体,具体涉及一种可用于特异性结合环丙沙星(Ciprofloxacin)的核酸适配体及其用途,属于生物技术领域。

背景技术

环丙沙星别名环丙氟哌酸、适普灵等,外文名:Ciprofloxacin、CPFX、CIPROBAY等。是人工合成的第三代喹诺酮类抗菌药物,是一种新型广谱抗菌药,杀菌力强而迅速。对包括绿脓杆菌、肠道细菌及金黄色葡萄球菌在内的革兰阳性和阴性菌均有杀菌作用。临床多用其盐酸盐,用于呼吸道感染、泌尿道感染、肠道感染、胆道各系统感染、腹腔内感染、妇科疾病感染、骨关节感染及全身严重感染的治疗。

抗生素对细菌感染性疾病的治疗至关重要,但是当过分使用,释放到环境中时,它们可能会影响整个生态系统的平衡并导致耐药菌的产生,从而对人类健康产生重大影响。近年来,由于抗生素的不规范使用,尤其是在动物护理领域的使用不当和预防性使用,抗生素耐药菌的产生和相应的污染已成为全球范围的一个严重问题。环丙沙星属于抗生素的一种,也存在这一问题。目前环丙沙星的检测方法主要是依赖气相色谱-质谱法,液相色谱-串联质谱法,高效液相色谱等方法,色谱法检测灵敏度较高,检测结果准确,但是需要昂贵的仪器设备,对检测材料的要求很高,需要提纯处理,并且耗时,需要专业的技术人员,无法实现快速便捷的检测。因此,越来越需要开发用于快速评估抗生素及其残留物的稳定、简便、灵敏和低成本的方法。而生物传感器的成本低,专一性好,准确性高,只对特定的底物起反应,因此一般不需要进行样品的预处理,干扰少,分析速度快,操作简单,容易实现自动化分析,因此可以很好的避免现有检测手段的缺陷。其中,基于核酸适配体的生物传感器(apta-sensors)因其良好的选择性,特异性和灵敏度而备受关注。

核酸适配体(aptamer)是指通过指数富集的配基系统进化技术(SELEX)筛选分离得到的DNA或者RNA分子,它可以与靶标如蛋白质、金属离子、小分子、多肽甚至整个细胞高亲和力和特异性的结合,因此在生化分析,环境监测,基础医学,新药合成等方面展示广阔的前景。核酸适配体与抗体相比分子量小,稳定性更好,易改造修饰,无免疫原性,制作周期短,可以通过人工合成,免去了动物免疫、饲养、蛋白提取和纯化等一系列流程,因此核酸适配体是一种非常理想的分子探针。

基于SELEX的方法,筛选出结合特定小分子的核酸适配体,并将该核酸适配体用于小分子的检测,目前也被广泛研究。针对于环丙沙星的核酸适配体目前报道的还很少,因此,本领域对针对环丙沙星有高结合亲和力的核酸适配体存在需求。

发明内容

为了克服现有技术的不足,本发明要解决的问题是提供一种具有高度特异性、分子量小、化学性质稳定、易于保存和标记的能够结合环丙沙星的核酸适配体及其衍生物,还相应提供所述核酸适配体的用途。

为实现前述发明目的,本发明采用的技术方案包括:

本发明实施例提供了一种特异性结合环丙沙星的核酸适配体,它具有如SEQ IDNO.1所示的核苷酸序列,或者与SEQ ID NO:1的全长序列60%以上相同并且能够特异性结合环丙沙星的序列,或者,由SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列衍生的能够特异性结合环丙沙星的核苷酸序列。

进一步地,所述核酸适配体包含能够与SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列杂交的核苷酸序列。

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