[发明专利]肠道菌群移植的群组配型方法、系统、设备及存储介质在审
申请号: | 202111559768.9 | 申请日: | 2021-12-17 |
公开(公告)号: | CN114446396A | 公开(公告)日: | 2022-05-06 |
发明(设计)人: | 王科;黄伟斌 | 申请(专利权)人: | 广州保量医疗科技有限公司 |
主分类号: | G16B40/30 | 分类号: | G16B40/30 |
代理公司: | 广州三环专利商标代理有限公司 44202 | 代理人: | 许羽冬;郭浩辉 |
地址: | 510030 广东省广州市黄埔区国*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 肠道 移植 群组配型 方法 系统 设备 存储 介质 | ||
1.一种肠道菌群移植的群组配型方法,其特征在于,所述方法包括:
获取肠道菌群的数据样本集;所述数据样本集包括待配型的受体和供体数据;
对所述数据样本集进行聚类分析,得到若干菌群聚类簇;
从每个菌群聚类簇内选择若干受体,并计算距离若干所述受体最近的供体,组成受体和供体的配型对。
2.根据权利要求1所述的肠道菌群移植的群组配型方法,其特征在于,所述通过对所述数据样本集进行聚类分析,得到若干菌群聚类簇的步骤包括:
通过DBSCAN算法对所述数据样本集进行聚类分析,得到若干菌群聚类簇。
3.根据权利要求2所述的肠道菌群移植的群组配型方法,其特征在于,所述通过DBSCAN算法对所述数据样本集进行聚类分析,得到若干菌群聚类簇的步骤包括:
确定所述数据样本集中每个数据点的EPS邻域;
统计每个数据点的EPS邻域内数据点数目,并将所述数据点数目超过密度阈值的数据点作为核心点;
将所述核心点中多个密度可达的核心点组成菌群聚类簇。
4.根据权利要求1所述的肠道菌群移植的群组配型方法,其特征在于,所述从每个菌群聚类簇内选择若干受体,并计算距离至少一个所述受体最近且等数量的供体的步骤包括:
在每个菌群聚类簇内,根据闵可夫斯基距离,计算若干所述受体距离最近的供体,组成若干一对一的配型对。
5.一种肠道菌群移植的群组配型系统,其特征在于,所述系统包括:
数据采集模块,用于获取肠道菌群的数据样本集;所述数据样本集包括待配型的受体和供体数据;
聚类分析模块,用于对所述数据采集模块所获取的所述数据样本集进行聚类分析,得到若干菌群聚类簇;
群组配型模块,用于从每个菌群聚类簇内选择若干受体,并计算距离若干所述受体最近的供体,组成受体和供体的配型对。
6.根据权利要求5所述的肠道菌群移植的群组配型系统,其特征在于,所述聚类分析模块采用DBSCAN算法对所述数据样本集进行聚类分析,得到若干菌群聚类簇。
7.根据权利要求6所述的肠道菌群移植的群组配型系统,其特征在于,所述聚类分析模块包括:
邻域确定模块,用于确定所述数据样本集中每个数据点的EPS邻域;
筛选模块,用于统计每个数据点的EPS邻域内数据点数目,并将所述数据点数目超过密度阈值的数据点作为核心点;
聚类模块,用于将所述核心点中多个密度可达的核心点组成菌群聚类簇。
8.根据权利要求5所述的肠道菌群移植的群组配型系统,其特征在于,所述群组配型模块还用于在每个菌群聚类簇内,根据闵可夫斯基距离,计算若干所述受体距离最近的供体,组成若干一对一的配型对。
9.一种计算机设备,包括存储器、处理器及存储在存储器上并可在处理器上运行的计算机程序,其特征在于,所述处理器执行所述计算机程序时实现权利要求1至4中任一所述方法的步骤。
10.一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,其特征在于,所述计算机程序被处理器执行时实现权利要求1至4中任一所述方法的步骤。
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