[发明专利]一种环状RNA作为寨卡病毒感染生物标志物的应用在审

专利信息
申请号: 202111569576.6 申请日: 2021-12-21
公开(公告)号: CN114085901A 公开(公告)日: 2022-02-25
发明(设计)人: 段晓琼;谢鹤;康澜;陈利民;李世林;李玉佳;杨春晖;徐敏 申请(专利权)人: 中国医学科学院输血研究所
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883;C12Q1/6851;C12N15/11
代理公司: 成都九鼎天元知识产权代理有限公司 51214 代理人: 吕玲
地址: 610052 四*** 国省代码: 四川;51
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摘要:
搜索关键词: 一种 环状 rna 作为 病毒感染 生物 标志 应用
【权利要求书】:

1.一种环状RNA作为寨卡病毒感染生物标志物,其特征在于:包括环状RNA hsa_circ_0007321及其扩增体系。

2.如权利要求1所述的一种环状RNA作为寨卡病毒感染生物标志物,其特征在于:所述扩增体系包括正向扩增引物5’-AGGAGGATGTTTCAGAAGGCT-3’和反向扩增引物5’-AGCTCTGTTGTCATTCGCTTC-3’。

3.如权利要求1或2所述的一种环状RNA作为寨卡病毒感染生物标志物,其特征在于:所述引物在制备寨卡病毒感染诊断试剂盒中的应用。

4.如权利要求1或2所述的一种环状RNA作为寨卡病毒感染生物标志物的应用,其特征在于包括以下步骤:

S1,提取待检测样本和未感染样本的总RNA;

S2,将S1中待检测样本和未感染样本的总RNA分别逆转录成cDNA;

S3,用所述引物对S2中cDNA的hsa_circ_0007321进行qPCR扩增,同时,选择一个内参基因,对S2中cDNA的内参基因也进行qPCR扩增,得到hsa_circ_0007321和内参基因的ct值,用相对定量方法分析待检测样本中hsa_circ_0007321表达相对于未感染样本hsa_circ_0007321表达量变化。

5.如权利要求4所述的一种环状RNA作为寨卡病毒感染生物标志物的应用,其特征在于,所述内参基因为GAPDH,所对应的引物为:

正向引物:5’-GCCTCCTGCACCACCAACTG-3’;

反向引物:5’-ACGCCTGCTTCACCACCTTC-3’。

6.如权利要求4所述的一种环状RNA作为寨卡病毒感染生物标志物的应用,其特征在于S3中所述qPCR扩增反应体系:反应组分总体积为20μL,包含10μL的2×SYBR mix(ROXPremixed),1μL的Forward primer,1μL的Reverse primer,5μL的cDNA和3μL的Nuclease-free Water。

7.如权利要求4所述的一种环状RNA作为寨卡病毒感染生物标志物的应用,其特征在于S3中所述qPCR反应条件为:

预变性,时间5min,温度95℃,反应循环数1;

变性,时间15s,温度95℃;

退火,时间15s,温度60℃;

延伸,时间30s,温度72℃;变性、退火和延伸的反应循环数为40。

8.如权利要求4所述的一种环状RNA作为寨卡病毒感染生物标志物的应用,其特征在于S3中qPCR扩增结束后还包括熔解曲线分析,判断扩增产物的特异性。

9.如权利要求8所述的一种环状RNA作为寨卡病毒感染生物标志物的应用,其特征在于所述熔解曲线分析的反应条件为:

温度95℃,时间15s;温度60℃,时间1min;温度95℃,时间30s;温度60℃,时间15s;三个反应循环数均为1。

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