[发明专利]一种环状RNA作为寨卡病毒感染生物标志物的应用在审
申请号: | 202111569576.6 | 申请日: | 2021-12-21 |
公开(公告)号: | CN114085901A | 公开(公告)日: | 2022-02-25 |
发明(设计)人: | 段晓琼;谢鹤;康澜;陈利民;李世林;李玉佳;杨春晖;徐敏 | 申请(专利权)人: | 中国医学科学院输血研究所 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6851;C12N15/11 |
代理公司: | 成都九鼎天元知识产权代理有限公司 51214 | 代理人: | 吕玲 |
地址: | 610052 四*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 环状 rna 作为 病毒感染 生物 标志 应用 | ||
1.一种环状RNA作为寨卡病毒感染生物标志物,其特征在于:包括环状RNA hsa_circ_0007321及其扩增体系。
2.如权利要求1所述的一种环状RNA作为寨卡病毒感染生物标志物,其特征在于:所述扩增体系包括正向扩增引物5’-AGGAGGATGTTTCAGAAGGCT-3’和反向扩增引物5’-AGCTCTGTTGTCATTCGCTTC-3’。
3.如权利要求1或2所述的一种环状RNA作为寨卡病毒感染生物标志物,其特征在于:所述引物在制备寨卡病毒感染诊断试剂盒中的应用。
4.如权利要求1或2所述的一种环状RNA作为寨卡病毒感染生物标志物的应用,其特征在于包括以下步骤:
S1,提取待检测样本和未感染样本的总RNA;
S2,将S1中待检测样本和未感染样本的总RNA分别逆转录成cDNA;
S3,用所述引物对S2中cDNA的hsa_circ_0007321进行qPCR扩增,同时,选择一个内参基因,对S2中cDNA的内参基因也进行qPCR扩增,得到hsa_circ_0007321和内参基因的ct值,用相对定量方法分析待检测样本中hsa_circ_0007321表达相对于未感染样本hsa_circ_0007321表达量变化。
5.如权利要求4所述的一种环状RNA作为寨卡病毒感染生物标志物的应用,其特征在于,所述内参基因为GAPDH,所对应的引物为:
正向引物:5’-GCCTCCTGCACCACCAACTG-3’;
反向引物:5’-ACGCCTGCTTCACCACCTTC-3’。
6.如权利要求4所述的一种环状RNA作为寨卡病毒感染生物标志物的应用,其特征在于S3中所述qPCR扩增反应体系:反应组分总体积为20μL,包含10μL的2×SYBR mix(ROXPremixed),1μL的Forward primer,1μL的Reverse primer,5μL的cDNA和3μL的Nuclease-free Water。
7.如权利要求4所述的一种环状RNA作为寨卡病毒感染生物标志物的应用,其特征在于S3中所述qPCR反应条件为:
预变性,时间5min,温度95℃,反应循环数1;
变性,时间15s,温度95℃;
退火,时间15s,温度60℃;
延伸,时间30s,温度72℃;变性、退火和延伸的反应循环数为40。
8.如权利要求4所述的一种环状RNA作为寨卡病毒感染生物标志物的应用,其特征在于S3中qPCR扩增结束后还包括熔解曲线分析,判断扩增产物的特异性。
9.如权利要求8所述的一种环状RNA作为寨卡病毒感染生物标志物的应用,其特征在于所述熔解曲线分析的反应条件为:
温度95℃,时间15s;温度60℃,时间1min;温度95℃,时间30s;温度60℃,时间15s;三个反应循环数均为1。
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