[发明专利]一种采用实时荧光定量PCR技术检测藏羊BMPR-IB基因表达谱的方法在审
申请号: | 202111577919.3 | 申请日: | 2021-12-22 |
公开(公告)号: | CN114507742A | 公开(公告)日: | 2022-05-17 |
发明(设计)人: | 张军霞;杨葆春;倪小敏;李明明;贺娜 | 申请(专利权)人: | 青海大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6851;C12N15/11 |
代理公司: | 青海省专利服务中心 63100 | 代理人: | 周同永 |
地址: | 810000 青*** | 国省代码: | 青海;63 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 采用 实时 荧光 定量 pcr 技术 检测 bmpr ib 基因 表达 方法 | ||
1.一种采用实时荧光定量PCR技术检测藏羊BMPR-IB基因表达谱的方法,其特征在于,具体步骤包括如下:
步骤1,总RNA的提取:利用TRNzol Universal总RNA提取试剂进行总RNA的提取,具体步骤如下:
步骤1.1:取-80℃冻存组织,约50mg组织样,在无RNA酶的培养皿上剪碎,之后将其转入1.5mLEP管中,加入450μL TRNzol Universal试剂,用研磨器快速研磨成细末状,再加入550μL TRNzol Universal试剂,摇匀,得匀浆样品备用;
步骤1.2:将匀浆样品在室温放置4min,使得核酸蛋白复合物完全分解,然后在4℃,12000rpm条件下,离心10min,吸取上清液备用;
步骤1.3:在步骤1.2的上清液中加入200μL氯仿,盖好管盖,剧烈振荡15s,室温放置3min,然后在4℃,12000rpm条件下,离心15min;把500μL水相溶液转移到新的离心管中;
步骤1.4:将步骤1.3得到的水相溶液中加入等体积的异丙醇,混匀,室温放置10min,然后在4℃,12000rpm条件下,离心10min,弃上清液,沉淀物备用;
步骤1.5:在步骤1.4得到的沉淀物中,加入1mL用RNase-free ddH2O配制的75%乙醇,洗涤沉淀;然后在4℃,10000rpm条件下,离心5min,倒出液体,注意不要倒出沉淀,剩余的少量液体短暂离心,然后用枪头吸出,室温放置3min晾干,备用;
步骤1.6:在步骤1.5得到物质中,加入30μL RNase-free ddH2O,反复吹打、混匀,充分溶解RNA;
步骤2,RNA质量检测:取4μL步骤1提取的RNA,加入1μL的6xLoading Buffer上样缓冲液混匀,在浓度为1.0%的琼脂糖凝胶中电泳,并利用Nanodrop测定OD 260/280nm比值及浓度,总RNA样品在-80℃保存,备用;
步骤3,反转录-PCR:利用FastKing gDNA Dispelling RT SuperMix试剂盒进行反转录,反转录反应体系为20μL:RNA 10μL,5×FastKing-RT Super Mix 4μL,RNase-freeWater 6μL,反应条件为:42℃,15min,95℃,3min;
步骤4,引物设计及实时荧光定量PCR技术:根据GenBank数据库中绵羊BMPR-IB和GAPDH基因的mRNA序列设计引物,BMPR-IB基因的上下游引物分别为:
F:5-CAAGAAGCTGCGGCCCTCCT-3,
R:5-AGGCAGGATTGTGAGCCCAGC-3;
GAPDH的上下游引物分别为:
F:5-GCGAGATCCTGCCAACATCAAGT-3,
R:5-AGGCAGGATTGTGAGCCCAGC-3;
以GAPDH为内参,利用BIORAD CFX96荧光定量PCR仪,分析BMPR-IB基因在藏羊不同组织中的表达量;扩增体系为20μL:10μL 2×SuperReal Color PreMix,0.6μL上游引物(10μM),0.6μL下游引物(10μM),2μL cDNA,用ddH2O补足到20μL;熔解曲线条件为:60~95℃,每隔0.05s读板1次;阴性对照用1μL ddH2O代替模板,每个样品的检测进行3个独立重复,扩增条件为:95℃预变性15min;94℃变性10s;57℃退火32s;共40个循环;
步骤5,数据分析:采用2-ΔΔCT方法处理数据,分析基因表达量,其中,ΔCT=CT(BMPR-IB)-CT(GAPDH),2-ΔΔCT表示被测基因mRNA的表达相对于GAPDH的倍数,数据统计分析采用SPSS20.0。
2.根据权利要求1所述的一种采用实时荧光定量PCR技术检测藏羊BMPR-IB基因表达谱的方法,其特征在于,所述步骤1中,TRNzol Universal总RNA提取试剂购自北京天根生化有限公司。
3.根据权利要求1所述的一种采用实时荧光定量PCR技术检测藏羊BMPR-IB基因表达谱的方法,其特征在于,所述步骤4中,不同组织为健康成年藏羊个体的卵巢、输卵管、子宫、下丘脑、垂体、心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、瘤胃、十二指肠、背最长肌、臂三头肌、股四头肌及半腱肌。
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