[发明专利]一种基于高通量SNP位点筛选的辅助育种方法

权利要求书

1.一种基于高通量SNP位点筛选的辅助育种方法，其特征在于:

1）利用高光谱四维成像仪器，获取目标生物的三维形貌及高光谱信息；构建表型性状特征的考种模型，表型性状特征包括生长速度、抗病能力；关联四维信息和目标生物表型性状特征，搭建目标生物的自动化考种平台；

2）针对特定表型性状的目标生物的参考群个体，进行高通量基因组测序和全基因组关联分析,获得SNP位点；据此设计高通量SNP特异性筛选芯片；

3）利用所述的高通量SNP特异性筛选芯片对待测样本进行高通量检测，获得具有对应的基因型样本；

4）根据SNP位点分析的结果和基于SNP聚类的亲缘关系信息，从候选育种亲本中筛选出用于表型性状鉴定的亲本子集；结合亲本子集的表型重复鉴定结果最终确定育种计划所需的入选育种亲本。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：所述的高通量基因组测序采用数字PCR方法进行扩增，PCR反应体系进行微滴化处理分割为油包水的微滴，直径10-100μm，实现单拷贝核酸水平上的扩增及信号放大，扩增产物混合后建立高通量测序文库用于测序分析。

3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：所述的目标生物为泥蚶，线激光扫描3D相貌，线激光投射在待测样品的表面上形成亮线，亮线受到表面的深度起伏调制而变形，通过对相机像面上亮线的像素坐标计算得到待测样品的剖面高度数据，通过电动位移平台的移动，使激光线扫描样品，从而得到样品局部的三维形貌数据；高光谱图谱仪进一步探测泥蚶外壳物质和闭壳肌的光学特性；三维形貌数据和光谱数据的融合增强对泥蚶品质，生理信息和种类的分析。

4.根据权利要求1所述的SNP辅助育种方法，其特征在于：所述的入选育种亲本用于杂交转育。