[发明专利]利用荧光定量PCR检测人源脐带间充质干细胞制剂中细菌的方法在审

专利信息
申请号: 202111634766.1 申请日: 2021-12-27
公开(公告)号: CN114214444A 公开(公告)日: 2022-03-22
发明(设计)人: 张春娟;陆晓;强斌;马进 申请(专利权)人: 江苏拓弘康恒医药有限公司
主分类号: C12Q1/689 分类号: C12Q1/689;C12Q1/6851
代理公司: 南京佰腾智信知识产权代理事务所(普通合伙) 32509 代理人: 黄杭飞
地址: 211000 江苏省南*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 利用 荧光 定量 pcr 检测 脐带 间充质 干细胞 制剂 细菌 方法
【权利要求书】:

1.利用荧光定量PCR检测人源脐带间充质干细胞制剂中细菌的方法,其特征在于,具体包括如下步骤:

(1)将人源间充质干细胞制品进行离心弃上清后,向沉淀中加入裂解液破环细菌细胞壁后,提取纯化获得细菌DNA;

(2)对样本DNA进行荧光定量PCR检测;

(3)通过Ct值判断样本的结果。

2.根据权利要求1的方法,其特征在于,步骤(1)中,DNA提取的具体步骤:

1)取200μl细胞制品,高速离心弃上清后作为样品组;

取200μl DNA洗脱液,高速离心弃上清后作为阴性对照组;

2)适用革兰氏阳性菌DNA提取:取150~200μl适宜浓度的破壁酶分别加入上述两组中,涡旋混匀;30~40℃孵育20-40min;加入20μl蛋白酶K和200μl裂解缓冲液,涡旋混匀;50~60℃孵育后转至90~100℃孵育;

适用革兰氏阴性菌DNA提取:取150~200μl裂解液分别加入上述两组中,涡旋混匀,瞬时离心;加入20μl蛋白酶K,涡旋混匀,瞬时离心,50~60℃孵育10-15min,瞬时离心;加入200μl裂解缓冲液,涡旋混匀,瞬时离心,65~75℃孵育5~15min,瞬时离心;

3)加入200μl无水乙醇,漩涡,瞬时离心;

4)将混合物转移至分离柱中,放置在收集管中,高速离心,将收集管丢弃;

5)将分离柱放入新的收集管中,加入500μl缓冲液1,高速离心,将收集管丢弃;

6)将分离柱放入新的收集管中,加入500μl缓冲液2,高速离心数分钟,将收集管丢弃;

7)将分离柱放入新的收集管中,高速离心;

8)将分离柱放入新的1.5mlEP管中,加入20~200μlDNA洗脱液,室温孵育数分钟,高速离心,洗脱DNA;

9)将上一步骤中的DNA洗脱液重新加入到分离柱中,室温孵育数分钟,高速离心,重新洗脱DNA。

3.根据权利要求1的方法,其特征在于,步骤(2)中,荧光定量PCR检测

1)反应液配制;

2)按18μl/孔加入反应液,再根据反应组别加入2μl/孔各组样品DNA,总体积为20μl/孔;

3)循环进行检测。

4.根据权利要求3的方法,其特征在于,步骤(2)中的1),各组分配制反应液的量为:Premix ExTaqTM:10μl;16s-F:0.4μl;16s-R:0.4μl;16s-Probe:0.4~0.8μl;ROX:0.1~0.2μl;PCR-grade water:6.2~6.7μl;总体积:18μl。

5.根据权利要求3的方法,其特征在于,步骤(2)中的2),反应组别为

1)组别:样品组;加入样品类型:提取的样品DNA;

2)组别:阴性对照组;加入样品类型:提取的洗脱液DNA;

3)组别:阳性对照组;加入样品类型:阳性对照品DNA;

4)组别:空白对照组;加入样品类型:洗脱液。

6.根据权利要求3的方法,其特征在于,步骤(2)中的3),先95℃保温30s;再95℃保温5s,60℃保温34s的顺序40个循环进行检测。

7.根据权利要求1的方法,其特征在于,步骤(3)中,结果判断标准为

1)当阳性对照组扩增曲线呈S型,且Ct值<31;阴性对照、空白对照扩增曲线不呈S型或Ct值≥31或无Ct值,方可判断样品结果;

2)当样品扩增曲线呈S型,且Ct值<31,判断结果为阳性;

当样品扩增曲线不呈S型或Ct值≥31或无Ct值,判断结果为阴性。

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