[发明专利]利用荧光定量PCR检测人源脐带间充质干细胞制剂中细菌的方法在审
申请号: | 202111634766.1 | 申请日: | 2021-12-27 |
公开(公告)号: | CN114214444A | 公开(公告)日: | 2022-03-22 |
发明(设计)人: | 张春娟;陆晓;强斌;马进 | 申请(专利权)人: | 江苏拓弘康恒医药有限公司 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6851 |
代理公司: | 南京佰腾智信知识产权代理事务所(普通合伙) 32509 | 代理人: | 黄杭飞 |
地址: | 211000 江苏省南*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 利用 荧光 定量 pcr 检测 脐带 间充质 干细胞 制剂 细菌 方法 | ||
1.利用荧光定量PCR检测人源脐带间充质干细胞制剂中细菌的方法,其特征在于,具体包括如下步骤:
(1)将人源间充质干细胞制品进行离心弃上清后,向沉淀中加入裂解液破环细菌细胞壁后,提取纯化获得细菌DNA;
(2)对样本DNA进行荧光定量PCR检测;
(3)通过Ct值判断样本的结果。
2.根据权利要求1的方法,其特征在于,步骤(1)中,DNA提取的具体步骤:
1)取200μl细胞制品,高速离心弃上清后作为样品组;
取200μl DNA洗脱液,高速离心弃上清后作为阴性对照组;
2)适用革兰氏阳性菌DNA提取:取150~200μl适宜浓度的破壁酶分别加入上述两组中,涡旋混匀;30~40℃孵育20-40min;加入20μl蛋白酶K和200μl裂解缓冲液,涡旋混匀;50~60℃孵育后转至90~100℃孵育;
适用革兰氏阴性菌DNA提取:取150~200μl裂解液分别加入上述两组中,涡旋混匀,瞬时离心;加入20μl蛋白酶K,涡旋混匀,瞬时离心,50~60℃孵育10-15min,瞬时离心;加入200μl裂解缓冲液,涡旋混匀,瞬时离心,65~75℃孵育5~15min,瞬时离心;
3)加入200μl无水乙醇,漩涡,瞬时离心;
4)将混合物转移至分离柱中,放置在收集管中,高速离心,将收集管丢弃;
5)将分离柱放入新的收集管中,加入500μl缓冲液1,高速离心,将收集管丢弃;
6)将分离柱放入新的收集管中,加入500μl缓冲液2,高速离心数分钟,将收集管丢弃;
7)将分离柱放入新的收集管中,高速离心;
8)将分离柱放入新的1.5mlEP管中,加入20~200μlDNA洗脱液,室温孵育数分钟,高速离心,洗脱DNA;
9)将上一步骤中的DNA洗脱液重新加入到分离柱中,室温孵育数分钟,高速离心,重新洗脱DNA。
3.根据权利要求1的方法,其特征在于,步骤(2)中,荧光定量PCR检测
1)反应液配制;
2)按18μl/孔加入反应液,再根据反应组别加入2μl/孔各组样品DNA,总体积为20μl/孔;
3)循环进行检测。
4.根据权利要求3的方法,其特征在于,步骤(2)中的1),各组分配制反应液的量为:Premix ExTaqTM:10μl;16s-F:0.4μl;16s-R:0.4μl;16s-Probe:0.4~0.8μl;ROX:0.1~0.2μl;PCR-grade water:6.2~6.7μl;总体积:18μl。
5.根据权利要求3的方法,其特征在于,步骤(2)中的2),反应组别为
1)组别:样品组;加入样品类型:提取的样品DNA;
2)组别:阴性对照组;加入样品类型:提取的洗脱液DNA;
3)组别:阳性对照组;加入样品类型:阳性对照品DNA;
4)组别:空白对照组;加入样品类型:洗脱液。
6.根据权利要求3的方法,其特征在于,步骤(2)中的3),先95℃保温30s;再95℃保温5s,60℃保温34s的顺序40个循环进行检测。
7.根据权利要求1的方法,其特征在于,步骤(3)中,结果判断标准为
1)当阳性对照组扩增曲线呈S型,且Ct值<31;阴性对照、空白对照扩增曲线不呈S型或Ct值≥31或无Ct值,方可判断样品结果;
2)当样品扩增曲线呈S型,且Ct值<31,判断结果为阳性;
当样品扩增曲线不呈S型或Ct值≥31或无Ct值,判断结果为阴性。
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