[发明专利]促进水稻抽穗的QTL qHD1b及其应用在审

申请号：	202111645810.9	申请日：	2021-12-30
公开（公告）号：	CN114350836A	公开（公告）日：	2022-04-15
发明（设计）人：	吴玮勋;程式华;刘嶺;曹立勇;张迎信;占小登;杨正福	申请（专利权）人：	中国水稻研究所
主分类号：	C12Q1/6895	分类号：	C12Q1/6895;C12N15/11;C12N15/29;C12N15/113;A01H1/04
代理公司：	北京市京大律师事务所 11321	代理人：	李洪群
地址：	311401 浙***	国省代码：	浙江;33
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摘要：
搜索关键词：	促进水稻抽穗 qtl qhd1b 及其应用
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【权利要求书】：

1.促进水稻抽穗的QTL qHD1b，其特征在于，所述QTL qHD1b位于水稻第1染色体标记INDEL4和RM10390之间112.7-kb的区间内；

其中，用于扩增标记INDEL4的正向引物和反向引物序列分别为SEQ ID NO:39和40；用于扩增标记RM10390的正向引物和反向引物序列分别为SEQ ID NO:41和42。

2.权利要求1所述QTL qHD1b的以下任一应用：

(1)调控植物生长发育；

(2)促进植物长短日照条件下抽穗；

(3)植物品种改良；

(4)制备转基因植物；

(5)促进水稻基因Ehd1、OsMADS14、OsMADS15、Hd3a和RFT1的表达；

(6)改良与水稻产量相关的农艺性状，包括提高水稻千粒重、增加粒长；

所述调控为正调控；

优选地，所述植物为禾本科植物，更优选水稻。

3.与权利要求1所述QTL qHD1b紧密连锁的分子标记，其特征在于，包括75个SNP标记SNP1～SNP75和10个InDel标记InDel1～InDel10；

其中，SNP1～SNP3分别位于水稻基因LOC_Os01g11946 CDS序列第56bp、876bp和1915bp，多态性分别为T/C、A/T和G/A；SNP4～SNP12分别位于水稻基因LOC_Os01g11952 CDS序列第91bp、178bp、484bp、810bp、1051bp、1215bp、1550bp、2116bp和2276bp，多态性分别为C/T、G/A、G/A、A/G、C/G、C/T、C/G、C/T和A/C；SNP13～SNP15分别位于水稻基因LOC_Os01g11960 CDS序列第807bp、851bp和920bp，多态性分别为G/A、G/T和T/C；SNP16～SNP18分别位于水稻基因LOC_Os01g12080 CDS序列第475bp、548bp和689bp，多态性分别为C/T、A/C和C/T；SNP19～SNP34分别位于水稻基因LOC_Os01g11940 ATG起始密码子上游第-68、-176、-198、-222、-276、-399、-475、-640、-700、-866、-1031、-1194、-1199、-1242、-1253和-1258bp，多态性分别为G/C、G/C、A/G、G/A、C/T、G/A、G/C、A/G、T/G、C/T、T/G、C/T、C/T、T/C、A/G和T/G；SNP35～SNP37分别位于水稻基因LOC_Os01g11946 ATG起始密码子上游第-7bp、-313bp和-1041bp，多态性分别为A/C、C/T和C/T；SNP38～SNP57分别位于水稻基因LOC_Os01g11952 ATG起始密码子上游第-42bp、-323bp、-378bp、-385bp、-476bp、-591bp、-595bp、-609bp、-616bp、-630bp、-656bp、-704bp、-707bp、-753bp、-897bp、-926bp、-961bp、-1009bp、-1030bp和-1065bp，多态性分别为G/T、T/G、A/C、A/C、G/A、T/C、T/A、T/C、G/A、C/T、G/A、T/C、T/C、C/T、C/T、G/A、G/A、T/C、T/C和C/T；SNP58～SNP73分别位于水稻基因LOC_Os01g11960 ATG起始密码子上游第-82bp、-184bp、-191bp、-627bp、-659bp、-741bp、-767bp、-838bp、-870bp、-889bp、-907bp、-920bp、-988bp、-1219bp、-1352bp和-1433bp，多态性分别为G/C、G/T、C/T、A/C、A/G、A/T、C/T、C/T、G/A、T/C、A/G、T/C、T/G、A/G、T/C和A/G；SNP74～SNP75分别位于水稻基因LOC_Os01g12080 ATG起始密码子上游第-106bp和-333bp，多态性分别为A/G和A/G；

InDel1位于水稻基因LOC_Os01g11946 ATG起始密码子上游第-42～-44bp，多态性为---/GAG；

InDel2位于水稻基因LOC_Os01g11952 ATG起始密码子上游第-370～-378bp，多态性为--------/ACCCCCCC；

NDel3位于水稻基因LOC_Os01g11952 ATG起始密码子上游第-486～-487bp，多态性为--/GT；

InDel4位于水稻基因LOC_Os01g11952 ATG起始密码子上游第-544～-566bp，多态性为TATTTGATATTCAAAAGCACAGA/----------------------；

InDel5位于水稻基因LOC_Os01g11952 ATG起始密码子上游第-871～-889bp，多态性为-------------------/GTTTCCGACTTTTTATTTG；

InDel6位于水稻基因LOC_Os01g11952 ATG起始密码子上游第-877bp，多态性为-/T；

InDel7位于水稻基因LOC_Os01g11960 ATG起始密码子上游第-439bp，多态性为-/T；

InDel8位于水稻基因LOC_Os01g11960 ATG起始密码子上游第-502～-503bp，多态性为--/AA；

InDel9位于水稻基因LOC_Os01g11960 ATG起始密码子上游第-1003bp，多态性为-/A；

InDel10位于水稻基因LOC_Os01g12080 ATG起始密码子上游第-669～-670bp，多态性为TC/--；

其中，-表示碱基缺失；

水稻基因LOC_Os01g11940、LOC_Os01g11946、LOC_Os01g11952、LOC_Os01g11960和LOC_Os01g12080分别同权利要求6所述。