[发明专利]FFPE样本进行蛋白质组学分析的自动化处理方法及装置在审
申请号: | 202111649847.9 | 申请日: | 2021-12-29 |
公开(公告)号: | CN114459872A | 公开(公告)日: | 2022-05-10 |
发明(设计)人: | 余文祥;张宝;刘巧;赵晓雯;张伟;王忍;李艳萍 | 申请(专利权)人: | 天津诺禾致源科技有限公司 |
主分类号: | G01N1/36 | 分类号: | G01N1/36;G01N1/38;C12P21/06;C07K1/30;C07K1/14;G01N33/68 |
代理公司: | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人: | 金田蕴 |
地址: | 301700 天津市武清区武*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | ffpe 样本 进行 蛋白质 分析 自动化 处理 方法 装置 | ||
1.一种FFPE样本进行蛋白质组学分析的自动化处理方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1,第一移动模块将放置有FFPE样本的样本管放置到第一预定位置;
S2,识别单元对所述样本管进行识别,以得到所述样本管的标识信息;
S3,基于所述标识信息选择目标生产方式,其中,所述目标生产方式为用于对所述FFPE样本进行处理的方式;
S4,基于所述目标生产方式对所述FFPE样本进行处理,得到处理结果;其中,基于所述目标生产方式对所述样本进行处理,包括:
第二移动模块通过机械臂将所述样本管移动至自动化开关盖机执行开盖操作;
所述第二移动模块通过机械臂搬运所述样本管到自动化工作站上,以通过所述自动化工作站向所述样本管中添加脱蜡试剂;
所述第二移动模块将添加有所述脱蜡试剂的所述样本管移动至自动化震荡器,以进行震荡脱蜡处理,得到预处理后的样本;
所述第二移动模块将所述预处理后的样本转移至高速离心机进行离心处理,之后转移至所述自动化工作站去除上清,再通过所述自动化工作站加入所述脱蜡试剂重复一次脱蜡处理得到脱蜡后的样本;
然后通过所述自动化工作站依次加入不同比例的水化试剂、震荡离心、去除上清后得到水化的样品,再通过所述自动化工作站加入蛋白裂解液,震荡高温孵育,离心后取上清得到粗蛋白样品;
通过所述自动化工作站向所述粗蛋白样品中加入丙酮进行蛋白沉淀,离心去除上清后,再用丙酮清洗两次,最后复溶纯化之后的蛋白样品,转移到蛋白样品板;
扫描模块扫描记录所述蛋白样品板的板号,将所述蛋白样品板放入蛋白库位。
2.根据权利要求1所述的自动化处理方法,其特征在于,所述自动化处理方法还包括:在得到所述蛋白样品后,生成检测单;将所述检测单发送至智能生产线,以利用所述智能生产线对所述蛋白样品进行蛋白定量。
3.根据权利要求2所述的自动化处理方法,其特征在于,将所述检测单发送至智能生产线,以利用所述智能生产线对所述蛋白样品进行蛋白检测,包括:
对所述蛋白样品进行酶标仪定量,得到蛋白浓度;
取蛋白样品进行SDS-PAGE跑胶分析,以判断所述蛋白样品是否符合后续多肽处理要求,得到判断结果;
在所述判断结果表示所述蛋白样品符合条件时,执行多肽处理流程;
在判断结果表示所述蛋白样品不符合多肽处理条件时,重新再提取蛋白样品。
4.根据权利要求3所述的自动化处理方法,其特征在于,所述执行多肽处理流程包括:对符合多肽处理条件的所述蛋白样品进行酶解,正压脱盐,定量和转板。
5.根据权利要求4所述的自动化处理方法,其特征在于,所述自动化处理方法还包括:当接收到客户下单后,在确定需要进行多肽处理的情况下,将不同项目的多肽进行自动拼单排版,扫描确认新样本板编号,之后加酶解试剂,进行酶解;接着加入酸化试剂,震荡混匀之后高速离心;之后取样本上清进行正压脱盐,对多肽样品进行纯化;脱盐之后的多肽溶液进行冻干;冻干之后的多肽复溶,取少量多肽溶液进行定量;再基于定量结果对多肽进行稀释;之后高速离心,将多肽样品转移到上机的96孔板中,记录板号,得到最终待上机的多肽样品,系统排上机单。
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