[发明专利]通用核酸微阵列芯片及检测方法在审
申请号: | 202111658216.3 | 申请日: | 2021-12-30 |
公开(公告)号: | CN114214393A | 公开(公告)日: | 2022-03-22 |
发明(设计)人: | 朱滨;张佳琦;刘淑敏;杜玉梅;陈翔;钟逾;肖磊 | 申请(专利权)人: | 上海百傲科技股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6837 | 分类号: | C12Q1/6837;C12Q1/6806;C12N15/11 |
代理公司: | 上海立群专利代理事务所(普通合伙) 31291 | 代理人: | 杨楷;毛立群 |
地址: | 200233 上海市徐汇区*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 通用 核酸 阵列 芯片 检测 方法 | ||
1.一种核酸微阵列芯片,包括载体和固定在该载体上的3-61种核酸探针,其特征在于,
所述核酸探针的序列取自SEQ ID No.1-61,
所述核酸探针包括质控探针以及捕获探针,所述质控探针的序列为SEQ ID No.61,所述捕获探针的序列为SEQ ID No.1-60。
2.如权利要求1所述的核酸微阵列芯片,其特征在于,
所述质控探针位于微阵列的第一列,所述捕获探针位于所述质控探针的后列,每种所述捕获探针在同一行重复三个点。
3.如权利要求1所述的核酸微阵列芯片,其特征在于,
所述载体为醛基基片,所述核酸探针的一端连接有氨基修饰的PolyT(2-16聚)基团,当所述核酸探针被点样设备按阵列设计位置点到载体上,氨基与醛基发生脱水反应形成共价连接而被固定。
4.一种核酸微阵列芯片检测方法,采用权利要求1-3中任一项所述的核酸微阵列芯片,其特征在于,包括如下步骤:
1)将针对核酸微阵列芯片上某一捕获探针的反向互补序列加到靶核酸PCR扩增引物对之一的5’端,引物对的另一个引物5’端加标记物,所述标记物可以是生物素、地高辛,也可以是荧光素等;
2)利用所述引物对扩增靶核酸,得到含有捕获探针互补序列的靶核酸带标记的扩增产物;
3)将所述扩增产物与核酸微阵列芯片进行杂交反应;
4)检测标记物信号。
5.一种基于核酸微阵列芯片的靶核酸检测方法,采用权利要求1-3中任一项所述的核酸微阵列芯片,其特征在于,包括如下步骤:
1)将针对核酸微阵列芯片上某一捕获探针的反向互补序列加到靶核酸PCR扩增引物对之一的5’端;
2)利用所述引物对扩增靶核酸,得到含有捕获探针互补序列的靶核酸扩增产物;
3)将所述扩增产物与检测探针、核酸微阵列芯片进行杂交反应,其中,所述检测探针是一段带有标记物的与所述扩增产物的特征序列互补的寡核酸片段,所述标记物可以是生物素、地高辛,也可以是荧光素等;
4)检测标记物信号。
6.一种基于核酸微阵列芯片的靶核酸检测方法,采用权利要求1-3中任一项所述的核酸微阵列芯片,其特征在于,包括如下步骤:
1)设计一端包含特定捕获探针互补序列,另一端包含与靶核酸特征序列互补的检测探针,在两端序列之间包含2-10个PolyT;
2)将所述检测探针、带标记物的靶核酸片段与核酸微阵列芯片进行杂交反应,形成三明治复合结构,所述带标记物的靶核酸片段可以通过PCR反应、末端标记反应、与带标记物的特异性寡核苷酸片段互补形成复合物等方式获得,所述标记物可以是生物素、地高辛,也可以是荧光素等;
3)检测标记物信号。
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