[发明专利]慢性阻塞性肺病标志基因及其应用在审
申请号: | 202111672720.9 | 申请日: | 2021-12-31 |
公开(公告)号: | CN114703269A | 公开(公告)日: | 2022-07-05 |
发明(设计)人: | 王广冬;谢秋瑾;沈秀萍 | 申请(专利权)人: | 上海锐翌医学检验实验室有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6869;C12Q1/6806;C12N15/11;C12M1/34;C12M1/00;A61K45/00;A61P11/00;A23L33/00;G16H50/30 |
代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 黄德海 |
地址: | 201100 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 慢性 阻塞 肺病 标志 基因 及其 应用 | ||
1.一种试剂盒,其特征在于,包括适于检测第一基因集中的至少一个基因的试剂,所述第一基因集由以下基因组成:GI_0027904、GI_0036168、GI_0034839和GI_0001854,其中,所述第一基因集中的基因与SEQ ID NO:1-4所示的核酸序列一一对应,所述第一基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO:1-4所示的核酸序列具有不小于90%的同一性。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,进一步包括适于检测第二基因集中的至少一个基因的试剂,所述第二基因集由以下基因组成:GI_0005030、GI_0011592和GI_0014334,其中,所述第二基因集中的基因与SEQ ID NO:5-7所示的核酸序列一一对应,所述第二基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO:5-7所示的核酸序列具有不小于90%的同一性。
3.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,包括适于检测所述第一基因集中全部所述基因的试剂。
4.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,包括适于检测所述第二基因集中全部所述基因的试剂。
5.试剂在制备试剂盒中的用途,所述试剂适于检测第一基因集中的至少一种基因,所述试剂盒用于诊断慢性阻塞性肺病或者检测慢性阻塞性肺病的治疗效果,所述第一基因集由以下基因组成:
GI_0027904、GI_0036168、GI_0034839和GI_0001854,其中,所述第一基因集中的基因与SEQ ID NO:1-4所示的核酸序列一一对应,所述第一基因集中的基因与其对应的SEQ IDNO:1-4中的序列具有不小于90%的同一性。
6.根据权利要求5所述的用途,其特征在于,所述试剂进一步适于检测第二基因集中的至少一种基因,所述第二基因集由以下基因组成:GI_0005030、GI_0011592和GI_0014334,其中,所述第二基因集中的基因与SEQ ID NO:5-7所示的核酸序列一一对应,所述第二基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO:5-7所示的核酸序列具有不小于90%的同一性。
7.一种用于预防或者治疗慢性阻塞性肺病的药物组合物或者食品组合物,其特征在于,含有提高第二基因集中的至少一种基因丰度的物质,所述第二基因集由以下基因组成:GI_0005030、GI_0011592和GI_0014334,其中,所述第二基因集中的基因与SEQ ID NO:5-7所示的核酸序列一一对应,所述第二基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO:5-7所示的核酸序列具有不小于90%的同一性。
8.一种确定个体是否患有慢性阻塞性肺病的方法,其特征在于,包括:
(1)确定所述个体的粪便样本中标志基因的丰度,所述标志基因包括第一基因集和第二基因集中的至少一种基因;
(2)将步骤(1)中得到的所述丰度与预定的阈值进行比较,以便确定所述个体是否患有慢性阻塞性肺病;
其中,所述第一基因集由以下基因组成:GI_0027904、GI_0036168、GI_0034839和GI_0001854,其中,所述第一基因集中的基因与SEQ ID NO:1-4所示的核酸序列一一对应,所述第一基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO:1-4中的序列具有不小于90%的同一性;
所述第二基因集由以下基因组成:GI_0005030、GI_0011592和GI_0014334,其中,所述第二基因集中的基因与SEQ ID NO:5-7所示的核酸序列一一对应,所述第二基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO:5-7所示的核酸序列具有不小于90%的同一性。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,步骤(1)进一步包括:
获得所述个体的粪便样本中的核酸测序数据;
将所述测序数据与参考基因组进行比对;
基于所述比对的结果,确定所述标志基因的丰度。
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