[发明专利]用于肺癌筛查的标志物、探针组合物及其应用

说明书

本发明公开了一种用于肺癌筛查的标志物、探针组合物及其应用，所述标志物选自3个标志物的任一种。本发明使用所述的标志物，能够灵敏和特异地检测该基因的甲基化的状态，从而可以用于对外周血游离DNA的检测，并且，本发明所述的组合物以非侵入性的方式用于无症状人群的筛查，降低了侵入性检测造成的危害，所述的组合物具有更高的灵敏度和准确度，能够实现实时监测。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，尤其涉及一种用于肺癌筛查的标志物、探针组合物及其应用。

背景技术

肺癌是全球发病率最高、死亡率最高的癌症之一。在我国，肺癌发病率、死亡率也居首位。常规的筛查肺癌的手段除了低剂量螺旋CT(LDCT)，还有一些蛋白标志物，例如：癌胚抗原(CEA)、鳞状细胞癌抗原(SCC)、神经元特异性烯醇化酶(NSE)等。但这些手段在灵敏性和特异性方面各参差不齐。目前，DNA甲基化已被证明具有组织特异性,可用于早期癌症检测，并可根据循环肿瘤DNA(ctDNA)甲基化特征追踪到肿瘤原发部位。

发明内容

本发明的目的在于提供了一种检测肺癌的标志物以及探针组合物，可以用于肺癌的筛查，所述的标志物以非侵入性的方式用于无症状人群的筛查，以及癌症患者的预后检测，降低了侵入性检测造成的危害，并且具有更高的灵敏度和准确性。

本发明具体技术方案如下：

1.一种用于检测肺癌的标志物，其特征在于，所述标志物选自下述中的一种：USP33、CHRNB2和TMEM219。

2.根据项1所述的标志物，其特征在于，所述标志物的核苷酸序列选自如SEQ IDNO:1-3所示的一种，优选所述标志物为甲基化后的标志物。

3.一种探针组合物，其特征在于，所述探针组合物包含靶向项1或2所述标志物甲基化的探针。

4.根据项3所述的探针组合物，其特征在于，所述探针组合物包含高甲基化的第一探针组合物和低甲基化的第二探针组合物，所述第一探针组合物用于与经重亚硫酸盐转化的CG高甲基化的区域杂交，所述第二探针组合物用于与经重亚硫酸盐转化的CG低甲基化的区域杂交；

优选的，所述第一探针组合物包括n个探针，所述n个探针与经重亚硫酸盐转化的CG高甲基化的区域的正义链和反义链的每个核苷酸杂交；

优选的，所述第二探针组合物包括m个探针，所述m个探针与经重亚硫酸盐转化的CG低甲基化的区域的正义链和反义链的每个核苷酸杂交；

优选的，n和m均是1-10中的任意整数；

优选的，第n-1个探针和第n个探针之间有x₁个核苷酸重叠，优选的，x₁为0-100中的任意整数；

优选的，第m-1个探针和第m个探针之间有x₂个核苷酸重叠，优选的，x₂为0-100中的任意整数；

进一步优选的，所述第一探针组合物包括如SEQ ID NO:4-9所示的一种或两种核苷酸序列，所述第二探针组合物包括如SEQ ID NO:10-15所示的一种或两种和苷酸序列。

5.标志物在制备用于检测肺癌的试剂盒中的用途，其特征在于，所述标志物选自下述中的一种：USP33、CHRNB2和TMEM219。

6.根据项5所述的用途，其特征在于，所述标志物的核苷酸序列选自如SEQ ID NO:1-3所示的一种，优选所述标志物为甲基化后的标志物；

优选的，所述探针组合物用于靶向肺癌的甲基化后的标志物；

优选的，所述探针组合物为项3或4所述的探针组合物。