[发明专利]用于预测白血病预后的评估基因集、试剂盒、系统及应用在审

专利信息
申请号: 202111679341.2 申请日: 2021-12-31
公开(公告)号: CN114317532A 公开(公告)日: 2022-04-12
发明(设计)人: 王惊华;翁建宇;王延军;杨硕;赖沛龙;王玉连;耿素霞 申请(专利权)人: 广东省人民医院
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12Q1/6886;G16B25/10;G16H50/30
代理公司: 珠海市君佳知识产权代理事务所(普通合伙) 44644 代理人: 刘战胜
地址: 510080 广东*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 用于 预测 白血病 预后 评估 基因 试剂盒 系统 应用
【权利要求书】:

1.用于预测急性髓细胞白血病患者预后的评估基因集,其特征在于,所述评估基因集为基于铁死亡相关聚类的差异表达基因集,其包括18个基因,18个基因为ZNF560、ZSCAN4、LHX6、TWIST1、FOXL1、ZFPM2、HMX2、ASTN1、DLL3、PCDHB12、PRINS、TMEM56、HRASLS、FAM155B、CCL23、LGALS1、EFNB3和MXRA5。

2.用于预测急性髓细胞白血病患者预后的试剂盒,其特征在于,其包括检测权利要求1所述评估基因集中18个基因表达水平的试剂。

3.用于预测急性髓细胞白血病患者预后的系统,其特征在于,包括数据收集单元、预后风险评分单元和预测单元;

数据收集单元用于收集患者的样本,测定其基因表达值,其中基因为权利要求1所述的评估基因集中的18个基因;

预后风险评分单元用于根据18个基因的表达值数据计算风险评分,其中风险评分的计算公式如下:

其中,Coefi为系数,xi为所选基因经过z-score变换后的相对表达值;

预测单元用于根据患者的风险评分来预测患者的预后情况,患者的风险评分越低,则预后情况越好。

4.如权利要求3所述的用于预测急性髓细胞白血病患者预后的系统,其特征在于,若风险评分大于等于0,则预后风险为高风险,若风险评分小于0,则预后风险为低风险。

5.如权利要求3所述的用于预测急性髓细胞白血病患者预后的系统,其特征在于,确定18个基因的系数,将风险评分的计算公式展开为:

Risk score=expr(LGALS1)×(1.54e-1)+expr(DLL3)×(-4.82e-2)+expr(ZFPM2)×(6.83e-2)+expr(LHX6)×(2.79e-2)+expr(MXRA5)×(-1.11e-2)+expr(TMEM56)×(-1.18e-2)+expr(CCL23)×(1.13e-2)+expr(FAM155B)×(3.08e-2)+expr(ZSCAN4)×(1.19e-2)+expr(PCDHB12)×(-1.82e-2)+expr(PRINS)×(-6.59e-2)+expr(FOXL1)×(-1.39e-3)+expr(ASTN1)×(-6.39e-3)+expr(HMX2)×(6.38e-2)+expr(HRASLS)×(4.28e-2)。

6.检测基因表达水平的试剂在制备用于预测急性髓细胞白血病患者预后试剂盒或系统中的应用,其中,试剂盒为权利要求2所述的用于预测急性髓细胞白血病患者预后的试剂盒,系统为权利要求3-5任一项所述的用于预测急性髓细胞白血病患者预后的系统。

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