[发明专利]一种用于鉴定玉米糊粉层层数的CAPS标记及其检测方法有效
| 申请号： | 202111682108.X | 申请日： | 2021-12-31 |
| 公开（公告）号： | CN114292947B | 公开（公告）日： | 2023-09-29 |
| 发明（设计）人： | 胡小娇;石慧敏;王红武;李坤;刘小刚;黄长玲;张伟 | 申请（专利权）人： | 中国农业科学院作物科学研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京慕达星云知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11465 | 代理人： | 崔自京 |
| 地址： | 100081 北*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 用于 鉴定 玉米 糊粉层 层数 caps 标记 及其 检测 方法 | ||
1.一种用于鉴定玉米糊粉层层数的CAPS标记，其特征在于，利用特异性引物CAPS491-F和CAPS491-R扩增得到；
所述CAPS491-F和CAPS491-R的引物序列如下：
CAPS491-F：5’-GGGGGGTAGTTGGACAAGAGC-3’；SEQ ID NO.6；
CAPS491-R：5’-CTGGCTTGATGCTCGGGTC-3’；SEQ ID NO.7；
所述CAPS标记为SEQ ID NO.1中第1791bp-2207bp所示的417bp核苷酸序列；
所述CAPS标记基于SNP位点开发；所述SNP位点为SEQ ID NO.1中第2091位核苷酸序列，所述SNP位点处的核苷酸为G或A。
2.根据权利要求1所述的一种用于鉴定玉米糊粉层层数的CAPS标记的检测方法，其特征在于，具体步骤如下：
(1)提取待测玉米籽粒DNA；
(2)以步骤(1)提取的DNA为模板，利用权利要求1所述特异性引物，进行PCR扩增反应；
(3)对PCR产物进行BceAI酶切，酶切后进行琼脂糖凝胶电泳；
(4)电泳结果判断：若得到一条417bp的电泳条带，则SNP位点为A，是玉米纯合dek48突变体，玉米糊粉层层数增加；若得到302bp和115bp的两条电泳条带，则SNP位点为G，是玉米纯合野生型，玉米糊粉层层数正常。
3.权利要求1所述的CAPS标记在辅助玉米籽粒糊粉层改良中的应用，其特征在于，利用权利要求2所述的方法进行改良。
4.权利要求1所述的CAPS标记在鉴定dek48突变体中的应用，其特征在于，利用权利要求2所述的方法进行鉴定。
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